Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_APP_0008300
Sequence Length
228 nt
GC Content
0.3289
GUCUUAGGAUAUUAGACAGCAGAAGUCUUCUUUUUCUUCCCCCAUUAUGUACUGCUUUUUGGCAUUGUAUUCAUGACACACACACACAUAAAAUGUCAUAUUUUCUUUAAAGUCAAAAUAUACAGUUUAAAAUGGUUUCAGUUGCUUUCAUAAGAGAGUAAAACUUAGGUGUUCAGUUUAAUAUUGGAAGACCUUGUUCAGUUAAUGUGUGCCUUCCAUGAAUAGUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-41.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -45.08
Frequency: 0.0018
Diversity: 22.46
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..((((((((((((.(((((....))))).))....(((((.((.((((..(((((((.(((.....((((((...............))))))........))).)))))))....)))).)).)))))......((((((((....))))))))(((......)))..))))))))))..)))))((((((((..................)))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((..((((((((((,(,(((((....,,,}}.)).,..(((((.({.((((..(((((((.(((.....((((((...............))))))........})).)))))))....)))).}).)))))......((((((((....)))))))},||.....,))}..))))))))))..)))))({((((((......,...........))))))}..)
Back