Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_APP_0009100
Sequence Length
428 nt
GC Content
0.5374
UGAAGACAAAGUAGUAGAAGUAGCAGAGGAGGAAGAAGUGGCUGAGGUGGAAGAAGAAGAAGCCGAUGAUGACGAGGACGAUGAGGAUGGUGAUGAGGUAGAGGAAGAGGCUGAGGAACCCUACGAAGAAGCCACAGAGAGAACCACCAGCAUUGCCACCACCACCACCACCACCACAGAGUCUGUGGAAGAGGUGGUUCGAGAGGUGUGCUCUGAACAAGCCGAGACGGGGCCGUGCCGAGCAAUGAUCUCCCGCUGGUACUUUGAUGUGACUGAAGGGAAGUGUGCCCCAUUCUUUUACGGCGGAUGUGGCGGCAACCGGAACAACUUUGACACAGAAGAGUACUGCAUGGCCGUGUGUGGCAGCGCCAUGUCCCAAAGUUUACUCAAGACUACCCAGGAACCUCUUGCCCGAGAUCCUGUUAAAC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-118.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -125.95
Frequency: 0.0000
Diversity: 50.42
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(....((......))...)(((((((.((.(.((((.((..(((.(((((.....((..((((...((..((((.((.((....((.((((((((.(((...((......(((.((....((....))...)).)))......)))))..))))))))))...((((((.(..((((((...))))))..).))))))((.((((.....))))))....(((.(.(((.((((((((..(((...........)))((((((((..((((.(.((((.....(((((((((((((........))).)))).))))..))......))))).))))..)))))))))))))))).))).))))..)))).)))).))..))))..))....))))))))..)).)))).)))......)))))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(....((......))...)(({(((({((.(,((((.((..(((.(((((.....((..((((...{{..((((.((.((....((.((((((((.(((...((......(((.((....{{....,}...)).)))......)))))..))))))))))...{{((((.{..((((((...))))))..}.)))))|((.((((.....)))))),...(((,{.(((.((((((((..(((...........)))((((((((..((((.,.((((....,,{(((((((((((........))).)))).)))).,}.......))))}.))))..)))))))))))))))).))).))))..)))).)))).}}..))))..))....))))))))..)).)))).))}....},)))))..})
Back