Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_APP_0009700
Sequence Length
336 nt
GC Content
0.5357
GUACCCACUGAUGGUAAUGCUGGCCUGCUGGCUGAACCCCAGAUUGCCAUGUUCUGUGGCAGACUGAACAUGCACAUGAAUGUCCAGAAUGGGAAGUGGGAUUCAGAUCCAUCAGGGACCAAAACCUGCAUUGAUACCAAGGAAGGCAUCCUGCAGUAUUGCCAAGAAAGGUGUGCUCUGAACAAGCCGAGACGGGGCCGUGCCGAGCAAUGAUCUCCCGCUGGUACUUUGAUGUGACUGAAGGGAAGUGUGCCCCAUUCUUUUACGGCGGAUGUGGCGGCAACCGGAACAACUUUGACACAGAAGAGUACUGCAUGGCCGUGUGUGGCAGCGCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-106.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -113.86
Frequency: 0.0000
Diversity: 72.96
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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