Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ASTN1_0001400
Sequence Length
421 nt
GC Content
0.5321
AAACAGUGCUGAGCUUUGUGGACGACAUCAUCUCUGGAGCAAAGUCUCCUUGUGCAAUGCCAUCUCAGGUGCCGGACAAGCAGCUCACCACCAUCUCUCUGAUCAUACGAUGCCUGGAACCUGACACCAUUUACAUGUUCACGCUGUGGGGAGUGGACAACACAGGACGGCGCUCCAGGCCAAGCGACGUGAUCGUGAAGACCCCAUGCCCCGUGGUGGAUGAUGUCAAGGCUCAAGAAAUAGCAGACAAGAUCUACAAUCUCUUCAAUGGCUACACUAGUGGGAAGGAGCAGCAGACCGCCUACAACACCCUCCUGGAUCUGGGUUCCCCCACCUUACACCGGGUCCUCUACCACUAUAACCAGCACUAUGAGAGUUUUGGGGAAUUCACCUGGCGAUGUGAGGAUGAGUUAGGUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-117.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -125.90
Frequency: 0.0000
Diversity: 103.90
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(((.((((((...((..((.((((.....(((.((((((....))).)))....))).....)))).))..))...)))))).))).........((((((.((..(((((((.((((...((.......(((((((.((....)).))))))).....)).))).).)))))))....))..))))))(((((..(((((.........((((((..((((...(((........))).))))..))))))...(((((.....(((....((((((..(((((..((.....))..........)))))((((((((((...........)).))))))))....)))))).....))).....)))))...)))))..)))))((((.(((.(((.......))).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({((((((((.,....((((..(((((((((((((((((...(((((({{(((.,,{{.....((((((.((((....(((..,,......({(.....)}}.....}.))))))).))))))...},,,....(((((((.((....)).))))))).))))))).))))))))))|{,..{|{,{{|{.||||,..}}..,||||...)))))})))))))))).,{((({......,|||.{{.,(((|.....}}}),,},...,}}}}.....(((((..(((((..(((({{{...............})).)))).))))))))))........)))})},...))))......)))))))......}))|((((((((((((((.((...)).))).))))))...))))))
Back