Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ASTN1_0001900
Sequence Length
792 nt
GC Content
0.5694
GCAACUCCCCAUCAGAUGAGUCUGAGGAGCGGGAAAGAGACCCCAAGGUGCUGACAUUCCCAGAAUACAUCACCAGCUUGUCAGACUCCGGCACCAAGCACAUGGCGGCUGGAGUCCGCAUGGAGUGCCACAGCAAGGGACGAUGCCCCUCGUCCUGCCCCCUGUGUCAUGUGACAUCCAGCCCUGACACCCCUGCUGAGCCGGUUCUGCUGGAGGUGACCAAAGCAGCCCCCAUCUAUGAACUAGUGACCAACAACCAGACCCAGAGGCUCUUGCAGGAGGCUACCAUGAGCUCUCUCUGGUGCUCAGGGACUGGAGAUGUCAUCGAGGACUGGUGUCGAUGUGACUCCACUGCUUUUGGAGCUGAUGGACUCCCCACCUGUGCGCCUCUCCCACAGCCUGUGCUGAGACUCUCCACGGUUCACGAGCCCAGCAGCACUCUUGUGGUCCUGGAGUGGGAACACUCAGAGCCACCAAUCGGGGUGCAGAUUGUAGAUUACCUCCUCCGUCAAGAGAAAGUCACUGACAGGAUGGACCACUCCAAAGUGGAGACAGAAACAGUGCUGAGCUUUGUGGACGACAUCAUCUCUGGAGCAAAGUCUCCUUGUGCAAUGCCAUCUCAGGUGCCGGACAAGCAGCUCACCACCAUCUCUCUGAUCAUACGAUGCCUGGAACCUGACACCAUUUACAUGUUCACGCUGUGGGGAGUGGACAACACAGGACGGCGCUCCAGGCCAAGCGACGUGAUCGUGAAGACCCCAUGCCCCGUGGUGGAUGAUGUCAAGGCUCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-286.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -300.00
Frequency: 0.0000
Diversity: 138.46
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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