Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ASTN1_0002200
Sequence Length
691 nt
GC Content
0.5630
GCAACUCCCCAUCAGAUGAGUCUGAGGAGCGGGAAAGAGACCCCAAGGUGCUGACAUUCCCAGAAUACAUCACCAGCUUGUCAGACUCCGGCACCAAGCACAUGGCGGCUGGAGUCCGCAUGGAGUGCCACAGCAAGGGACGAUGCCCCUCGUCCUGCCCCCUGUGUCAUGUGACAUCCAGCCCUGACACCCCUGCUGAGCCGGUUCUGCUGGAGGUGACCAAAGCAGCCCCCAUCUAUGAACUAGUGACCAACAACCAGACCCAGAGGCUCUUGCAGGAGGCUACCAUGAGCUCUCUCUGGUGCUCAGGGACUGGAGAUGUCAUCGAGGACUGGUGUCGAUGUGACUCCACUGCUUUUGGAGCUGAUGGACUCCCCACCUGUGCGCCUCUCCCACAGCCUGUGCUGAGACUCUCCACGGUUCACGAGCCCAGCAGCACUCUUGUGGUCCUGGAGUGGGAACACUCAGAGCCACCAAUCGGGGUGCAGAUUGUAGAUUACCUCCUCCGUCAAGAGAAAGUCACUGACAGGAUGGACCACUCCAAAGUGGAGACAGAAACAGUGCUGAGCUUUGUGGACGACAUCAUCUCUGGAGCAAAGUCUCCUUGUGCAAUGCCAUCUCAGGUGCCGGACAAGCAGCUCACCACCAUCUCUCUGAUCAUACGAUGCCUGGAACCUGACACCAUUUACAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-242.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -253.67
Frequency: 0.0000
Diversity: 102.51
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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