Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ASTN1_0004600
Sequence Length
1073 nt
GC Content
0.5471
AUUCACCUACACUCUUGGGGAGGGCAUGUGGUUGCCCCUCAGCAAGAGCUUUGUGAUUCCACCAGCCGAACUGGCCAUCAAUCCAUCAGCAAAGUGCAAGACGGACAUGACUGUGAUGGAGGAUGCUGUGGAGGUCAGAGAGGAGCUGAUGACUUCAUCCUCCUUCGACAGCCUGGAGGUUCUCUUAGAUUCCUUUGGGCCGGUGCGCGACUGCAGCAAAGAUAACGGGGGCUGCAGUAAGAAUUUCCGCUGUAUUUCAGAUCGCAAGCUGGACUCCACUGGUUGCGUGUGCCCAUCUGGACUCAGUCCCAUGAAGGACAGCUCUGGCUGCUAUGACCGCCACAUCGGGGUGGACUGUUCCGACGGCUUCAACGGCGGCUGUGAGCAGCUGUGCCUCCAGCAGAUGGCGCCCUUCCCGGACGACCCCACCUUGUAUAACAUCCUCAUGUUCUGUGGGUGCAUCGAGGACUACAAGCUUGGUGUGGAUGGACGCUCUUGCCAACUCAUCACGGAGACCUGUCCAGAGGGAAGUGACUGUGGGGAAAGCAGGGAGCUUCCCAUGAACCAGACCCUCUUUGGGGAGAUGUUCUUUGGUUACAACAACCAUUCCAAGGAAGUGGCUGCCGGACAGGUGCUGAAAGGAACAUUCAGGCAAAACAACUUUGCUCGUGGUUUAGACCAGCAACUGCCAGAUGGUCUUGUGGUGGCCACUGUGCCCCUGGAGAAUCAAUGCCUAGAGGAGAUCUCGGAGCCCACCCCUGACCCUGACUUCCUGACUGGGAUGGUGAACUUCAGUGAAGUGUCUGGGUACCCUGUGCUGCAGCACUGGAAGGUCCGGUCUGUGAUGUACCACAUCAAACUCAACCAAGUGGCCAUCUCUCAGGCCCUCAGCAAUGCUCUCCACUCGCUGGAUGGGGCUACAUCUCGUGCAGAUUUUGUGGCGCUGUUGGACCAGUUCGGCAACCAUUACAUCCAGGAAGCUAUCUACGGCUUUGAGGAGUCCUGUUCUAUCUGGUACCCAAACAAGCAGGUCCAGCGGCGACUCUGGCUGGAGUAUGAAGACAUCAGUAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-385.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -404.11
Frequency: 0.0000
Diversity: 286.45
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((.....((((((..(((((((......)).)))))..))))))....)))).)(......((...((((((.....((((.(((((...(.((..((((......))))..)).)...)))))))))))))))...)).(((((((.((((((.((((.......(((((((((.(((...)))..))))))))).((((((((((((((((.............)))))))).........))).)))))(((((((((..(((((((....(((.(((.(.((((((((..((((...)))).))).(((((((...(((.((((...(((.((.....)))))((((((.(((((((((((((.((((((.((.(((((((((.((((..((.(((((((.(.((((((((((...((((((..((......(((((((((.((...)).)))).)))))......))..)))).)).(((.(......))))(((..(((((((((((..(((((.(((((((.(..((((((...((.((((...))))..........(((.....)))(((((.((((((((...((.......(((((.((.((((((((((((.(((.(((((....((((.....((((((.....))))))....))))....))))).)))))(((...)))...))))))))))....)).)))))......)).)))))))).)))))...))...))))..))..).)))))))..)))))..)))...)))).))))))))))))))...((.((((....)))).))..(((..(((...((((((...)))))).)))..)))))).)))))))))).))))...))))..)))))..)).))))))..))))((((((..((.....))...))))))))))))))).)))))))))).)))..((.(((..((((((......))))))..))))).)))))))....))))).)...))).)))))))))).)))).)))))..)))).)))))).)))))))...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,,,,.....((((((..(((((((......))))))))..)))))){{{{,|||{{({{{..{((...,||||({{{..(((({(({({..{({(,..,,{|.},}..,}})}}))}).}})),,)))))))))),}}}),.(((((((.((((((.((((..,..{.(((((((((.(((...})}..))))))))).|{{{{{{{((((((((...,....,....))))))))..,....,,))),))}}.,((((((((..(((((((....,(({(((,{.({(((,,,,,({{(,,.||||..,},,||||||...{{|,{||,...(((.((.....)))))((((((.(((((((((,{((.((((((.((.(((((((((.((((..((.(((((((,(,{{,(((((((..,({((((..((......(((((((((.({...)).)))).)))))......))..)))).)).{((.{{....,})}}.,,,.{{((((({(((..(((((.(((((((.,..{({(({...||,{{{.|||||}}..........(((.....)))(((({.(((((((({,.,,...,,,.{((((.((,((((((((((((.(((.(((((....((((...,.((((((.....)))))).}..))))....))))).))))).{,.,,|||.,.}|}|)))))}...|||,|||}|......,}|)}))}))}.}))})||,}},,.,}})},,)},},)))))))..)))))..)))...)))).)})),}}))))))).,,((.((((....)))).))..(((..(((...((((((...)))))).}))..))).}),}))))))))).))))...))))..)))))..)).))))))..}))}((((((,,({.....))...))))))))))))))).))))))}))),)))...,.(((..((((((......))))))..))))},|||||,....,||}}}})}..},)})))))))))).)))).)))))..)))).)))))).)))))))...}
Back