Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ASTN1_0005700
Sequence Length
429 nt
GC Content
0.4732
GUCUGUCAGGAAAAUGCAAAGAACAGUGCUCUUUAGGUCACGUCUCCCAAAGGCAGCCAAGGGGGAAGUUGAUGUCCCACAGUGCCACCCUCCCUUUGGCUGGUCCAUUCUCAAAUGUCUUAAGCAAUGUGCUCCCAGCUGGGAUCCUCAGGAGACAAUUUCACUAUCUAAUGGAGCUCCCAGCUGAGACACUUUUAAAAAAAGCUAUUCAGCUUAUAUUUCUUCAUCCAGAUUUGAGCCUUUCAUUUCUUAUUACUGUCUGGCGUCAUUCUAAGUGCUGAAACACUGUGUGUUCAUAUGUGCACCUCCUUCCCUACUCUCUGUAGCCACUGCAGUAUGGGUUUGAGCAUGCACAUGCAUUAGCAGACAAACACAGGGUUAGGCUCUCCCUCUUUUGCCACUUCUGUGUCCCUUCCUGAGCCCCUCAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-119.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -128.26
Frequency: 0.0000
Diversity: 87.67
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...(((((((.((((..(((.(((((.(((((.((........)).)))))((((((((((((..((...(((...))).....))..))))))))))))...((((....))))...........(((.((.((((((((((((...(((.............)))...)))..))))))))).))))).........(((((....)))))..............(((..(((.....)))..)))...)))))))).)))).......((((......))))((.((((..((((((((.(((...(((......((((((...))))))...)))...)))..))))))))....)))).))..((((((((...(((............)))..))))))))...)))))))))((....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((...(((((((.{{((..((,,(((((,,((((.((........)).))))}((((((((((((..({.,.(({...}}}...,.}}..))))))))))))...,,,.....,,||,,,..,||,..(((,((.(((((((((,({{{{,,(({...........)))..}))}}.))))))))).))))).........(((((....)))))..............(((..((({....}}}..}}}...,)))))}},))}),..,},.,{{{..|,,,|}||((.((({.,{(((((((.(((...(((......((((((...))))))...)))...)))..))))))))..,.}))).)),.((((((((,..(((............)))}}})))))))...)))))))))((....))
Back