Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ATRNL1_0001600
Sequence Length
314 nt
GC Content
0.3854
CAUCAAACACUUGGCUUGUUCCAGAAACUAAAGGAGCUAUUGUACAAGGUGGAUAUGGCCAUACUAGUGUGUAUGAUGAAAUAACAAAGUCCAUUUAUGUUCAUGGAGGGUAUAAAGCAUUGCCAGGGAACAAAUAUGGAUUGGUUGAUGAUCUUUAUAAAUAUGAAGUUAACACUAAGACUUGGGUGCUUGGUCUCCUUGUGGUGAAGCAGUUUUGAAGGUUUCAUGGUUUCAUUGGAUGGCUGGUUGCAACGUAUUGUACAAAGUGGACUUGGAGAAUGUGAAUCACCUGUUGUAAUGAACCCGUAAUUUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-66.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -73.61
Frequency: 0.0000
Diversity: 70.05
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((....((.((.(((((((((..........)))))...(((((((..((.(..(((((((.((((((...((.(((((((..(((((....(((((...((.(((((.....((((((..(((((.............(((((.(.(((.((((((....))))))))).))))))..)))))))))))..))))).))..)))))....)))))...))))))).))..)))))))))))))..).)).....))))))))))).))..))....)))(((((.((..(((......)))..)).)))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((,,.(({((,((({{(({{.........,})))),.,(((((((.,((.(..(((((((.((((((.,.((.(((((((..{,.(((((((.,.(((((.{{{..{((,....}}..},))}..)))))...))))))|,({{(.{{{.((((((....))))))))),)}}||,..{{|,{,{((({.,{{.{{....)),}))})),)})),.,,))))))).))..)))))))))))))..).)).,...)))))))))))},,.,)),...}))(((((.((..(((......)))..)).)))),,
Back