Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ATRNL1_0004400

Sequence Length

1135 nt

GC Content

0.2476

GUUAACAGAACCUUCUGGAUAUUUAACAGAUGGCCCAAUUAACUAUAAAUAUAAAACUAAAUGUACUUGGCUCAUUGAAGGCUAUCCAAAUGCAGUGUUAAGAUUAAGAUUCAAUCAUUUUGCUACAGAAUGUAGCUGGGAUCAUAUGUAUGUUUAUGAUGGAGAUUCAAUAUAUGCACCUUUAAUAGCUGUACUUAGGUGAGUAAUUAUAUUUAAUCAGUUGCAGAAAAGUGACUGUGUAAUUGCUUCUUUAAAUAUAUAUUGAUAUGUACUGCAAAAUAAAUUUAGUAAAGAUAUUGAUAGUUACAUUUCACAGAUGAUUAUAAUACUUUGUUAUGUGCUGUAACUGUCAAUUUAGGUAAUAAUUAUGUAAAUAUUGAUAUAACAUAAAUAAGUACUAUAUUGGAAAUAUAGAUUUCUUUCUAAAUAUUUUUUAUUCUCAUUGUAUUUAGUUUAUUCUUUUAAAGUGCCUUGAAUAUGUUUUCAGAACUAUCUGGAUAUAUUAGCGUGAGUUCUAGCUGACAAAUAAAUAGACAAGUUUUGUUUUUUAAUAGUUGUUUUUUUAUUUUAGUGAAAUGGUAAAAUUUUAAAUUCUGCAUAAAAGGGUUAAGUUAUGCUUUGUGCAAUGAUUAAUAAAGAUGGAGUUUCUACCAAUUGUCAAAAUGUGAGAGUUUUAUUUGUUUCAAAAUAUUUUAUUGUUAGUCGUAAGGUAGAUUAUUAAUUUUAAAAUUAUAGCAUUGUAUCAAUUUAAAAAUCUUUUCUUGUGUAUGUUUAGAUUAUUAUAAAAAGUUUCGUGAAUAGGAGAAAAUCUAUUAGACACAGAAAAAAUUAUGAACAUGUAUAGAUUUUAUAUAUAAUUUAACAUGAUUGUUGAUAAGUUACUCAUUAUAUUAUUUACUUUUGCUAUUUAUACAAUAUCUGUUAUAUGUUCUGUCAUUGCUGGAAAUUUAAGUAUGGAUAAAAGCUUAUUGGUCCCUUCAAAAUAUUUUCUUUCCAAUUUUUCUUUUUAUUAUUCAUGUGGCAAAUAUUCUAUUUCAUUCUAUUCUAAUACAUUUUAUUUUGUUCUAUUUUAUCAGGAAUGUGAAUUAUUAUUUUGGACAAAAAUGUAACGACUUGUAUUUCCUUAGGAGCUUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-206.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -231.79

Frequency: 0.0000

Diversity: 359.89

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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