Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ATRNL1_0005900

Sequence Length

1386 nt

GC Content

0.3737

AACCUUCUGGAUAUUUAACAGAUGGCCCAAUUAACUAUAAAUAUAAAACUAAAUGUACUUGGCUCAUUGAAGGCUAUCCAAAUGCAGUGUUAAGAUUAAGAUUCAAUCAUUUUGCUACAGAAUGUAGCUGGGAUCAUAUGUAUGUUUAUGAUGGAGAUUCAAUAUAUGCACCUUUAAUAGCUGUACUUAGUGGUUUGAUAGUCCCUGAAAUAAGGGGCAAUGAAACUGUGCCUGAAGUUGUUACUACAUCUGGCUAUGCACUGUUACAUUUUUUUAGUGAUGCUGCGUAUAAUCUAACUGGUUUCAACAUUUUCUAUUCAAUCAAUUCUUGUCCUAACAAUUGCUCUGGUCAUGGGAAGUGUACAACUAGUGUCUCUGUUCCAAGUCAAGUAUAUUGUGAAUGUGAUAAAUACUGGAAGGGUGAAGCUUGUGAUAUUCCUUACUGUAAAGCCAAUUGCGGCAGUCCAGAUCACGGUUACUGUGACCUGACUGGAGAAAAAUUAUGUGUCUGCAAUGAUAGUUGGCAAGGUCCUGAUUGUUCUUUGAAUGUUCCCUCUACUGAGUCUUACUGGAUUCUGCCAAACGUUAAACCCUUCAGUCCUUCUGUAGGUCGGGCUUCACAUAAAGCAGUUUUACACGGGAAAUUUAUGUGGGUGAUUGGUGGAUAUACUUUUAACUACAGUUCUUUUCAAAUGGUCCUAAAUUACAAUUUAGAAAGCAGUAUAUGGAAUGUAGGAACUCCAUCAAGGGGACCUCUCCAGAGAUAUGGACACUCUCUUGCUUUAUAUCAGGAAAACAUCUUUAUGUAUGGAGGCAGAAUUGAAACAAAUGAUGGCAAUGUCACAGAUGAAUUAUGGGUUUUUAACAUACAUAGUCAGUCAUGGAGUACAAAAACUCCUACUGUUCUUGGACAUGGUCAGCAGUAUGCUGUGGAGGGACAUUCAGCACAUAUUAUGGAGUUGGAUAGUAGAGAUGUUGUCAUGAUCAUAAUAUUUGGAUAUUCUGCAAUAUAUGGUUAUACAAGCAGCAUACAGGAAUACCAUAUCUCAUCAAACACUUGGCUUGUUCCAGAAACUAAAGGAGCUAUUGUACAAGGUGGAUAUGGCCAUACUAGUGUGUAUGAUGAAAUAACAAAGUCCAUUUAUGUUCAUGGAGGGUAUAAAGCAUUGCCAGGGAACAAAUAUGGAUUGGUUGAUGAUCUUUAUAAAUAUGAAGUUAACACUAAGACUUGGACUAUUUUGAAAGAAAGUGGGUUUGCCAGAUACCUUCAUUCAGCUGUUCUUAUCAAUGGAGCUAUGCUUAUUUUUGGAGGAAAUACCCAUAAUGACACUUCCUUGAGUAACGGUGCAAAAUGUUUUUCUGCCGAUUUCCUGGCAUAUGACAUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-350.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -377.32

Frequency: 0.0000

Diversity: 335.81

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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