Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ATRNL1_0009100
Sequence Length
219 nt
GC Content
0.4521
CUCAAAAUUGUUCUGGAUUGAGAACCUGUGGACAGUGUUUGGAACAGCCUGGAUGUGGCUGGUGCAAUGAUCCUAGUAAUACAGGAAGAGGACAUUGCAUUGAAGGUUCUUCACGGGGACCAAUGAAGCUUAUUGGAAUGCACCACAGUGAGAUGGUUCUUGACACCAAUCUUUGCCCCAAAGAAAAGAACUAUGAGUGGUCCUUUAUCCAGUGUCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-58.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -62.19
Frequency: 0.0041
Diversity: 46.20
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.........(((((......)))))...((((((....(((((.(((((.......)))))((((((((.((((..(........)..))))))))))))(((((...))))).((((((((......(((((((..........)))))))(((((((((........((((((...)))))).)))))))))...))))))))..))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.,,....,(((((.,...,|||||,{.({(({{.,,.||,|..(((((.......)))))((((((((.((((..{........,..)))))))))))),{{||,,,))))}.,(((((({......(((((((,......,,.)))))))(((((((((........((((((...)))))).)))))))))...)))))))}..,})),))))))}
Back