Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ATRNL1_0019200
Sequence Length
462 nt
GC Content
0.3810
UCUGUCAAGAACUACACCAAAUGUCAUGUGAGAAAUGAGCAGAUUUGUAACAAACUUACCAGCUGUAAAAGCUGUUCACUAAACUUGAAUUGCCAGUGGGAUCAGAGACAGCAAGAAUGCCAGGCUUUACCAGCUCAUCUUUGUGGAGAAGGAUGGAGUCAUAUUGGGGAUGCUUGUCUUAGAGUCAAUUCCAGUAGAGAAAACUAUGACAAUGCAAAACUUUAUUGCUAUAAUCUUAGUGGAAAUCUUGCUUCAUUAACAACCUCAAAAGAAGUAGAAUUUGUUCUGGAUGAAAUACAGAAGUAUACACAACAGCUUGUACAUGCAGUGGCCAUGCAAAUAUCUGUCAUCUGCACACAGGAAAAUGUUUCUGCACAACUAAAGGAAUAAAAGGUGACCAAUGCCAAUUAUGUGACUCUGAAAAUCGCUAUGUUGGUAAUCCACUUAGAGGAACAUGUUAUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-93.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -102.78
Frequency: 0.0000
Diversity: 146.19
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((....((.(((..........)))))...))).))))...((((((.......(((((.....))))).((((....(((..(((.((..(((...((((((((((((((...((.(((((((((..(((.........)))..)).))))))).((((((((.(((((......))).)).))))))))......((((.((..((((((.......)))).))..)).))))))...))))))(((((((((((..((..........))..)))))...))))))((((....)))).........(((((...(((((((((.............)))).))))).)))))....)))))))).....)))..)))))..)))))))....(((((((...((((.........))))...))))))).(((.......)))...)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((({{....((.(({.........,)))))...}}}}))))...((((({.......,((((.....))))|(((.(({{...((.((((((((((({{((((((.{{(((.,{.{|{({(({,({{((.{(((((((((......)))))))})))|.{(((((({.{((((......))),}}.}))))))},,,...{{((.({..{{((({.......)))).}}..)).))})}}|,.|||{(((((.,,.............))))))),.|||,{((({.........|||||||,,..,,.....(((((...(((((((((.,,,.....,,..)))).))))).)))))....|||||||,.........,)))))}...|||},....})}),.},.,}}}.)))))}...)),)}},.,))))))).)).)))).,)))}.)))))).
Back