Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ATXN10_0002400

Sequence Length

555 nt

GC Content

0.4523

AGAAACAGCACCCAGGACUAUCUUCCAAAGAGUUCUGGAUAUCCUAAAGAAAUCUUCUCAUGCUGUUGAGCUUGCCUGCAGAGAUCCAUCCCAAGUGGAAAACCUGGCUUCCAGUCUGCAGUUAAUAACAGAAUGCUUCAGGUGUCUUCGCAAUGCUUGCAUAGAGUGUUCUGUGAACCAGAAUUCAAUCAGGAACUUGGAUACGAUUGGUGUUGCUGUUGAUUUGAUUCUUCUGUUUCGUGAACUGCGAGUGGAACAGGAAUCUCUGUUGACAGCUUUUCGCUGUGGCCUGCAGUUUUUAGGCAACAUUGCCUCACGGAAUGAAGAUUCCCAGUCUAUUGUUUGGGUGCAUGCUUUCCCAGAACUGUUUUUCACGAACCAGCCCAUCCUCACUGAUAAGAGCCCCAGUGUGCGGAGUGGAUUCCUGAGCCAGUUAAAAGGUUGCUACAGCAGUGGAGGCCUGGUUGGAGGGUGGUGAUAAGCCUGGAAAUAAAAGGACAUAUGUGAGAGACAGUAAUUUGAUAAAGAGUAAUGAAAGAGGAAGCUUUCUUUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-164.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -175.70

Frequency: 0.0000

Diversity: 106.13

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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