Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BANP_0001900
Sequence Length
1340 nt
GC Content
0.5873
GUGACCAAAAGCCAGCCCCACUGUGAGUUGAACUCUUUCGUGUUGACCGGCCACUCUCCGUGCUCUGGAUGAUGUCGGAACACGACCUGGCCGAUGUGGUUCAGAUUGCAGUGGAAGACCUGAGCCCUGACCACCCAGUUGUUUUGGAGAAUCAUGUAGUGACAGAUGAAGACGAACCUGCUUUGAAACGCCAGCGACUAGAAAUCAAUUGCCAGGAUCCAUCUAUAAAGUCAUUCCUGUAUUCCAUCAACCAGACAAUCUGCUUGCGGUUGGAUAGCAUUGAAGCCAAAUUGCAAGCCCUGGAGGCUACUUGUAAAUCCUUAGAAGAAAAGCUGGAUCUGGUCACGAACAAGCAGCACAGCCCCAUCCAGGUCCCCAUGGUGGCCGGCUCCCCUCUCGGGGCAACCCAGACGUGCAACAAAGUGCGAUGCGUCGUCCCCCAGACUACAGUAAUACUCAACAAUGAUCGGCAGAACGCCAUUGUAGCCAAGAUGGAAGACCCCUUGAGCAACAGGGCACCGGAUUCCCUGGAAAAUGUCAUUAGCAACGCUGUGCCUGGGCGUCGGCAGAACACCAUUGUGGUGAAGGUGCCGGGCCAAGAAGACAGCCACCACGAGGACGGGGAGAGCGGCUCGGAGGCCAGCGACUCUGUGUCCAGCUGUGGGCAGGCGGGCAGUCAGAGCAUCGGGAGCAACGUCACGCUCAUCACCCUGAACUCGGAAGAGGACUACCCCAAUGGCACCUGGCUGGGCGACGAGAACAACCCCGAGAUGCGGGUACGCUGCGCCAUCAUCCCCUCCGACAUGCUGCACAUCAGCACCAACUGCCGCACGGCCGAGAAGAUGGCGCUCACGCUGCUGGACUACCUCUUCCACCGCGAGGUGCAGGCUGUGUCCAACCUCUCGGGGCAGGGCAAGCACGGGAAGAAGCAGCUGGACCCGCUCACCAUCUACGGCAUCCGGUGUCACCUUUUCUAUAAAUUUGGCAUCACAGAAUCCGACUGGUACCGAAUCAAGCAGAGCAUCGACUCCAAGUGCCGCACGGCGUGGCGGCGCAAGCAGCGGGGCCAGAGCCUGGCGGUCAAGAGCUUCUCGCGGAGAACGCCCAACUCGUCCUCCUACUGCCCUUCAGAGCCGAUGAUGAGCACCCCACCUCCUGCCAGCGAGCUCCCGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGGCCCUGCACUACGCGCUGGCCAACGCACAGCAGGUGCAGAUCCACCAGAUCGGAGAAGACGGACAGGUGCAAGUAAUCCCACAGGGACACCUCCACAUCGCCCAGGUGCCGCAGGGGGAGCAAGUCCAGAUCACGCAGGACAGCGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-459.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -483.47
Frequency: 0.0000
Diversity: 437.05
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((........))(..((((.(((((.((..........((((((..(((((...((((((.....)))).)).)))))))))))((((((.(((((((((((.((..((((((((.(((..(((((.(((((.(((.((((((((((((..(((((((((((((((((.....((.(((((.((((..................))))..).)))).))))))).....)))))).(((............)))....(((((((((((((((((.....(((.((((((((((..((((((..((((.(((.(((....))).)))...))))...(((.(((........((......))((((.((((((..(((((((((((...(((....((((((......((.((((........(.((((((.((((((.((...(((((((........((((((..((......)).)))))).((((((..((....)).)))).))..(((((.........))))).....(((.....)))..(((((..((.(((.((((((...(((((...)))))....))))))))).))...)))))........(((((.((((.((((((....)))).))..)))).))))).)))))))...)).)))).....)))))))).)........)))))).....))))))....)))...)).)))))...)))).)))))).)))).))).)))....((((((((.(((....))).((((((((.((.(..(((...(((.(((.............))).))))))..).)).)))))))).........(((((.((..(((.((((....)))).)))..)))))))...))))))))))))))..))..((((((..(..((((((.(((...........)))..))))))..)..))))))....)))))))).)))....))))))))).........)))))))))))).))))))))(((((((........))))))).)))))))))(((((...)))))))))).).))))...(((.....))).......))).))).)))))...)).)))))(((.((..(((((...((((..(((.(((.(((...((.((....)).)))))))).))).(((((((....((((((....)).)))).))))))).(((........)))...)).))...)))))..)).)))....(((....)))..)))))).))))))))))))))))).((..((((..........)))).))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((........))(..((((.(((((,((...,,,,...((((((..(((((...((((((.....}))).)).)))))))))))((((((.(((((((({((.(({{,,,(((((.,,,{{(((({(({,((.(((.((((({{(((((.,{((.(.(((((((((((.....((.(((((.((((.......,....,.,...))))..),}))).))))))).....)))))),,}}..}}},,.,,.,,}}},,,|||((((((((((((,{..,..,,,.{|||||||||}}||{((({{((((.(((.(({....})).)))...,||{(..,{({,,......,..,}}}}..}))|,,.}||||(({{.{.(((((((,{({{(({,,,{.||||...},,.{{(((((,.....,)))}.|}|}|||||{{{{{|.{{(((((.....{,...,,|||,,{,,.....|||.|{({.((((((..((....}),)))).)).}))|||}.((((....,))))....,||}....},...|||||,.||,(((.((((((...(((({...}))))....))))))))).,}...})}))}}}}}.}.|||||}||,{}|,|||}}}}.{|||.||{.,,||{||,,,.{{|||||,|.,|{|||.{{{,.,.||.,||{(((,...|,...{{{{{{{{,,|||,.,{|}|..|,|{.,..,}},..,||{,,||||.,|||||||{{{.....((((((((.((({,..,},.((((((((.((.{..(((...(((,(({.....,,......})}.))})))..}.)).)))))))).....}}}}(((((.((..(((.((((....)))).)))..)))))))...)))))))),,||||..,|.{(,({{({{({.,((,((,((({.,,,..,,,.|||{,||}|||{{{..,|||||,...,||||||}{|||..|.,,}}},}))},.,}}},,,,}},)))},.,.}}),))..{||||{{.,...,}}))))))}.,))}|)}}|((|||.,,))})))))).,).))))}}},||..,...))}}..}}}))).}}}.,}}))},.))}),)}}|.}}}}}}||{{,....|}}}}|,,.||,.|||}}}||.|}}}}}))})))),))).)))}(((((((....((((((....)).)))).))))))).||}}}..}})}})),.....,,..,||||,..,...{{({...)))}}}))))))))))).)))))),,))))))))).||..((((.,......|.)))).))..)
Back