Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BANP_0002000
Sequence Length
1379 nt
GC Content
0.5888
GUGACCAAAAGCCAGCCCCACUGUGAGUUGAACUCUUUCGUGUUGACCGGCCACUCUCCGUGCUCUGGAUGAUGUCGGAACACGACCUGGCCGAUGUGGUUCAGAUUGCAGUGGAAGACCUGAGCCCUGACCACCCAGUUGUUUUGGAGAAUCAUGUAGUGACAGAUGAAGACGAACCUGCUUUGAAACGCCAGCGACUAGAAAUCAAUUGCCAGGAUCCAUCUAUAAAGUCAUUCCUGUAUUCCAUCAACCAGACAAUCUGCUUGCGGUUGGAUAGCAUUGAAGCCAAAUUGCAAGCCCUGGAGGCUACUUGUAAAUCCUUAGAAGAAAAGCUGGAUCUGGUCACGAACAAGCAGCACAGCCCCAUCCAGGUCCCCAUGGUGGCCGGCUCCCCUCUCGGGGCAACCCAGACGUGCAACAAAGUGCGAUGCGUCGUCCCCCAGACUACAGUAAUACUCAACAAUGAUCGGCAGAACGCCAUUGUAGCCAAGAUGGAAGACCCCUUGAGCAACAGGGCACCGGAUUCCCUGGAAAAUGUCAUUAGCAACGCUGUGCCUGGGCGUCGGCAGAACACCAUUGUGGUGAAGGUGCCGGGCCAAGAAGACAGCCACCACGAGGACGGGGAGAGCGGCUCGGAGGCCAGCGACUCUGUGUCCAGCUGUGGGCAGGCGGGCAGUCAGAGCAUCGGGAGCAACGUCACGCUCAUCACCCUGAACUCGGAAGAGGACUACCCCAAUGGCACCUGGCUGGGCGACGAGAACAACCCCGAGAUGCGGGUACGCUGCGCCAUCAUCCCCUCCGACAUGCUGCACAUCAGCACCAACUGCCGCACGGCCGAGAAGAUGGCGCUCACGCUGCUGGACUACCUCUUCCACCGCGAGGUGCAGGCUGUGUCCAACCUCUCGGGGCAGGGCAAGCACGGGAAGAAGCAGCUGGACCCGCUCACCAUCUACGGCAUCCGGUGUCACCUUUUCUAUAAAUUUGGCAUCACAGAAUCCGACUGGUACCGAAUCAAGCAGAGCAUCGACUCCAAGUGCCGCACGGCGUGGCGGCGCAAGCAGCGGGGCCAGAGCCUGGCGGUCAAGAGCUUCUCGCGGAGAACGCCCAACUCGUCCUCCUACUGCCCUUCAGAGCCGAUGAUGAGCACCCCACCUCCUGCCAGCGAGCUCCCGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGGCCCUGCACUACGCGCUGGCCAACGCACAGCAGGUGCAGAUCCACCAGAUCGGAGAAGACGGACAGGUGCAAGUAAUCCCACAGGGACACCUCCACAUCGCCCAGGUGCCGCAGGGGGAGCAAGUCCAGAUCACGCAGGACAGCGAGGGCAACCUCCAGAUCCAUCACGUGGGGCAGGACGGUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-480.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -506.00
Frequency: 0.0000
Diversity: 510.55
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((.....((.(((((((.((((((((...((((.((((......(((..((((((.((((((((......))))).....((((((.(((((((((((.((..((((((((.(((..(((((.(((((.(((.((((((((((((..(((((((((((((((((.....((.(((((.((((..................))))..).)))).))))))).....)))))).(((............)))....(((((((((((((((((.....(((.((((((((((..((((((..((((.(((.(((....))).)))...))))...(((.(((........((......))((((.((((((..(((((((((((...(((....((((((......((.((((........(.((((((.((((((.((...(((((((........((((((..((......)).)))))).((((((..((....)).)))).))..(((((.........))))).....(((.....)))..(((((..((.(((.((((((...(((((...)))))....))))))))).))...)))))........(((((.((((.((((((....)))).))..)))).))))).)))))))...)).)))).....)))))))).)........)))))).....))))))....)))...)).)))))...)))).)))))).)))).))).)))....((((((((.(((....))).((((((((.((.(..(((...(((.(((.............))).))))))..).)).)))))))).........(((((.((..(((.((((....)))).)))..)))))))...))))))))))))))..))..((((((..(..((((((.(((...........)))..))))))..)..))))))....)))))))).)))....))))))))).........)))))))))))).))))))))(((((((........))))))).)))))))))(((((...)))))))))).).))))...(((.....))).......))).))).)))))...)).)))))(((.((..(((((...((((..(((.(((.(((...((.((....)).)))))))).))).(((((((....((((((....)).)))).))))))).(((........)))...)).))...)))))..)).)))....(((....)))..)))))).))))))...))).))))))...))).....)))).))))))))((((....))))........))))))))))).))..))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((.....((.(((((((.((((...{,.((((((((,(((.,,,(({..,({(((((({((((({(.{{(((({..{|,.,,,||,}||||||,|}||}||..}}},||||.|,,((((((.(((((,.(((.(((({{{((({(,,,((.(.(((((((((((.....((.(((((.((((.......,...,,.,...))))..),}))).))))))).....)))))),,)).,)))}}.,,,}.}}}},,|{{(((((((((((({(,{{,.{,...}}}}}}))),|||({{{{,{({{.(((.(({....})).)))...,|||(,.,{(({.......,..,}}}}..||||,..|||}}|||{,|.{|||((({{{{{((({,{{.(((|,..|,|,{{(((((,.....,)))}.})})}}|||||{{||,|,{{{{{.....{,...,,|||,,{{{.....|||.|{{{.((((((..((....}),)))).)).}))}||}.((((....,))))....,||,....},...|||||,.||,(((.((((((...(((({...}))))....))))))))).,}...})}))},}},.}.}}|||})|||.||}}}}{{{,{|||.||..))))|}))))}}|)))))}}})|.))).,}}}}).)}.}})}((({........)))}....,},},}}}.)))}}))){.|,.{{{{..{((({{({{|.,((((((,({(.....{((({{{{,({({{,.,|,,((((({((.((.,,,(((,..(({{(,,.,,{.||{,,...}||,||}}}}{,|.}}.|||||}|},{,.{||||(((,,.,|,{((({({((....}|||{,,|{{,|||||,...,,,,})))}},|||..}}}||}||||||||}}|||||,{|||.,.|}}}}}.{(({{(,.((,(((..,{{{,{{....{{((({,{||{..{...,},.,))}}.}}}}}}..,,.}))}....)}).)}..||||||,.||||,|||})||||..||.((|{{(({,{.{|||||||||,..|,||||||,{||{{|...}},,..||||||.{||,.{{|,...,)))})..}},)))))),.......}}}),)},,)||,)))),,||.||,...))}))})}))).)))}||||{{{..,,((((((....)).)))).)))))}),},}},}},.)))))}..},.}},..||||}..},..{|{{...)))},,,)))}.,,)))})))))))))}..}))),,||..((((.{......,.)))).|,((((....))))....,,..))))))))))).))..))))..
Back