Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BANP_0003200
Sequence Length
1514 nt
GC Content
0.5429
CCUUCCACAACAAAGCGGACCUUAGAUAUCCCUUGUGACCAGAAAGUGCUAAGGCUUAAAAACGCAUGAUUGAAAACUGUGGGUGAGUCUGUACUUUGAGAUGAAGCUGUGUUAGCUGCCGCCUGUCUGAACACACUCGUGCUUCCUCCAGGGUGGCGCCAGGCUUGCUGGUUUCUGGGCCAUGGUCUGUUCUUUUGUAGAAUCUUUUCCUUCAAAGCAGAACCCUGAGCCCUUUGGUUGUAGCUCACACAUGUUCCUGCAGGACCUGGAGGCAGCAUGUGUGUCCUUCCAUCCCAAGUCCAACGUGAUGUUUGCCCCUUUCUUUCCAGGGCGCUACCGUUUUGGAAUGAUACCAACACUUACGUGGUUACGAACGUUAGAUCUGUCCCAUAGGAAUGAGUUGGGAUGGAGUGACUGAAAAUGUCAAGCCAGUUCUCAUGCAAGUGUGCCACCCUAGAAGCUUUAUUAACUGGGUGCGAUAACAGCUGGUGCGGUUGCAGUCUAUUCUGUCACAAGUUCAGCAUCCUCAGCCCAGCUGUCCUGUGCUAUCCAGUUGUGCAGACAGAUCACCAACAAUUAGGAAAAGUUACGUUCUGCUAAAAACCCCAUCUCCAGUUUAUUCUUCCUUAGCAUUUGGGGCUCCUUCCCCCUCAGGACGGGUCCCUGGGAGUGGACUAUGUUGAAUGACUCUUAGGCCUCCCCCUCAGUGCGGGUCCCUGGGAGUGGACUGUGUUGAAUGACUCUUAUGUGCUCUUACCAUGAAUGUUGUUGUUUUAAGGCCUUCUUUUUCUUUGUGAUUCUUUUGUUCCCUAGCGUCGUCCCCCAGACUACAGUAAUACUCAACAAUGAUCGGCAGAACGCCAUUGUAGCCAAGAUGGAAGACCCCUUGAGCAACAGGGCACCGGAUUCCCUGGAAAAUGUCAUUAGCAACGCUGUGCCUGGGCGUCGGCAGAACACCAUUGUGGUGAAGGUGCCGGGCCAAGAAGACAGCCACCACGAGGACGGGGAGAGCGGCUCGGAGGCCAGCGACUCUGUGUCCAGCUGUGGGCAGGCGGGCAGUCAGAGCAUCGGGAGCAACGUCACGCUCAUCACCCUGAACUCGGAAGAGGACUACCCCAAUGGCACCUGGCUGGGCGACGAGAACAACCCCGAGAUGCGGGUACGCUGCGCCAUCAUCCCCUCCGACAUGCUGCACAUCAGCACCAACUGCCGCACGGCCGAGAAGAUGGCGCUCACGCUGCUGGACUACCUCUUCCACCGCGAGGUGCAGGCUGUGUCCAACCUCUCGGGGCAGGGCAAGCACGGGAAGAAGCAGCUGGACCCGCUCACCAUCUACGGCAUCCGGUGUCACCUUUUCUAUAAAUUUGGCAUCACAGAAUCCGACUGGUACCGAAUCAAGCAGAGCAUCGACUCCAAGUGCCGCACGGCGUGGCGGCGCAAGCAGCGGGGCCAGAGCCUGGCGGUCAAGAGCUUCUCGCGGAGAACGCCCAACUCGUCCUCCUACUGCCCUUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-506.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -535.64
Frequency: 0.0000
Diversity: 399.72
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((((....((.(((.........)))))))))..(..(((((((..(((((((....((((.(........)))))..))))))))))))))..).....(((((....(((((((((((((((..(((......(((((....(((((((((((..((..(((((((...((((((.(((((((...((((..(((....)))...)))))))).))).)).)))).........((..(((((((((((((.(((...))).))).))))))))))..))((((((((((.((.....(((((((((......((.((((((((((....)))))))))).)).((((.(......)))))..)))))))))......(((....)))..)).)))))))))).((((.......)))))))))))......))..).)))))))))).)))))......(((((((((((...((((((((.((((.(((......................))).))...))))))))))....))).))))))))))))))))))....((........))...((((..((((((((............(((((((..((((((((........(((((.((.(((......))).))))))).(((.(.((.(((.(((....)))...))).)).).)))...((((..(.(((((((((.((.((......((((((..(((((.(......))))))..))))))......)).))))))...............(((((((.((((((((((.(.(((((..((((((....((....((((((.........(((.((((.((((((..((....)).)))).)).))))))).((((.....)))).....))))))))....)))))).))))).).))))....(((((...))))).(((((((((((..........)))....((((..(((((.(((((...((...((...(((((((((((((..(((....)))..)))))..)))))..)))...))..))...)))))....)))))..)))).....((......))..)))))))).)))))).)))))))....((((((((.(((....))).((((((((.((.(..(((...(((.(((.............))).))))))..).)).)))))))).........(((((.((..(((.((((....)))).)))..)))))))...))))))))))))))..))))))))))))..)))))))..((...((((....(((..((.(((((((..(((.....)))..)))))))...))..)))..))))..)).....))))))))...))))......(((....)))))))))))....)))))))))(..(((...((((((...(((...)))..((((.(((.......))).)))).)))))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,,(((((.,{,,((.(((.........}))}))}},..,...(((((((((((...,.{{((....({,.{.....(({.(((((((((((((.....,({({{({(((((({((........),}}}}})))},,,},((({{.,..((((((((((,..(({(((((({,...((((((.(((((((,..{(((.,(((....))},,.))))))))},)).)).))))..,{{{,..,{..(((((((((((((.(((...))).))).))))))))))..}|((((((((((.((,.,{,(((((((((......((.((((((((((....)))))))))).)).,{||||,.,,,,)))}}..}}}}}))}}..,,..(((....)))..)).)))))))))),{(((.......)))))))))),...}}.))}})})))))))))).)))))......(((((((((((...((((((((.((((.(((.,......,,......}}..,.))).))...))))))))))....))).))))))))))))))))...))))).})}.,{,({{..,,,....||,|,}},........}}}....)))}.,,...))))))))))}(((({.{{.{{|,,....))}.)))))))}|||.|}}|}....}(({{,..(((((((((...{((,{.....}.)))..))))))))){{((.((((((((((((..{{,,({({{{....,,,,,..,,{(((({{{{((((.{{(((.,.((({.({{,,....,,{{{....,|{(({{{{.....))).||,||.....,.,|||{{|},|({{....,)})}}}}}.}|,}))).}))))...))))))))))))))))}|(((.....)))}.....)))))}..)))))),)),||{,(((.((((((...(((({...}))))....))))))))).,,....,,|||.{{{({.(((((.((((.((((((....)))).))..)))).)))))...))))).,}))}(((((((..(((..,,({((((........)))}.....}}}},.(((....))),.....|||...|{{.,,..}))))).((((((.....((((((((.((({,..,|,.((((((((.((.{..(((...(((.(({.............})).))))))..).)).))))))))...,.}}}}(((((.((..(((.((((....)))).)))..)))))))...))))))))..((((...{.((.(||(((((..({.(({((((,{({,.,,,.((({,({.(({(((,..{{(.,,....|{{|||,|||,..|...,},..)))).}))}}}..,,.}))}....}}),)}..||||||,..,,.}}})))}|}}..)),||}||||},|,},}}})))))).}}.))))))).))..}...))))..)))))))))..)))))))}}}})
Back