Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BANP_0003600
Sequence Length
1424 nt
GC Content
0.5716
GGCGCUACCGUUUUGGAAUGAUACCAACACUUACGUGGUUACGAACGUUAGAUCUGUCCCAUAGGAAUGAGUUGGGAUGGAGUGACUGAAAAUGUCAAGCCAGUUCUCAUGCAAGUGUGCCACCCUAGAAGCUUUAUUAACUGGGUGCGAUAACAGCUGGUGCGGUUGCAGUCUAUUCUGUCACAAGUUCAGCAUCCUCAGCCCAGCUGUCCUGUGCUAUCCAGUUGUGCAGACAGAUCACCAACAAUUAGGAAAAGUUACGUUCUGCUAAAAACCCCAUCUCCAGUUUAUUCUUCCUUAGCAUUUGGGGCUCCUUCCCCCUCAGGACGGGUCCCUGGGAGUGGACUAUGUUGAAUGACUCUUAGGCCUCCCCCUCAGUGCGGGUCCCUGGGAGUGGACUGUGUUGAAUGACUCUUAUGUGCUCUUACCAUGAAUGUUGUUGUUUUAAGGCCUUCUUUUUCUUUGUGAUUCUUUUGUUCCCUAGCGUCGUCCCCCAGACUACAGUAAUACUCAACAAUGAUCGGCAGAACGCCAUUGUAGCCAAGAUGGAAGACCCCUUGAGCAACAGGGCACCGGAUUCCCUGGAAAAUGUCAUUAGCAACGCUGUGCCUGGGCGUCGGCAGAACACCAUUGUGGUGAAGGUGCCGGGCCAAGAAGACAGCCACCACGAGGACGGGGAGAGCGGCUCGGAGGCCAGCGACUCUGUGUCCAGCUGUGGGCAGGCGGGCAGUCAGAGCAUCGGGAGCAACGUCACGCUCAUCACCCUGAACUCGGAAGAGGACUACCCCAAUGGCACCUGGCUGGGCGACGAGAACAACCCCGAGAUGCGGGUACGCUGCGCCAUCAUCCCCUCCGACAUGCUGCACAUCAGCACCAACUGCCGCACGGCCGAGAAGAUGGCGCUCACGCUGCUGGACUACCUCUUCCACCGCGAGGUGCAGGCUGUGUCCAACCUCUCGGGGCAGGGCAAGCACGGGAAGAAGCAGCUGGACCCGCUCACCAUCUACGGCAUCCGGUGUCACCUUUUCUAUAAAUUUGGCAUCACAGAAUCCGACUGGUACCGAAUCAAGCAGAGCAUCGACUCCAAGUGCCGCACGGCGUGGCGGCGCAAGCAGCGGGGCCAGAGCCUGGCGGUCAAGAGCUUCUCGCGGAGAACGCCCAACUCGUCCUCCUACUGCCCUUCAGAGCCGAUGAUGAGCACCCCACCUCCUGCCAGCGAGCUCCCGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGGCCCUGCACUACGCGCUGGCCAACGCACAGCAGGUGCAGAUCCACCAGAUCGGAGAAGACGGACAGGUGCAAGUAGGACACCUCCACAUCGCCCAGGUGCCGCAGGGGGAGCAAGUCCAGAUCACGCAGGACAGCGAGGGCAACCUCCAGAUCCAUCACGUGGGGCAGGACGGUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-483.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -511.04
Frequency: 0.0000
Diversity: 409.30
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((((((((.......))))..((.((((........)))).))..(((((((((..((..((.((((((.(((.((.(((((..(((...(.(((......(((((.(((((((.(((((............))))).((.......))))))))).))))).......))).))))..)))))))))))).((((.(((((((((((...(((((((((...............)))))).))).(((...(((((.((........((((.(((((...((((.((((.((.....((((......)))))).)))).))))..))))).)))).....)).)))))...))).(((((((((((....((((...((((((.(((((..(((((.((((((..(((((.(......))))))..)))))).......(((((((((((((((((((...((.((((((....(.(((.(((......(((((((.....(((....)))..(((.....)))))))))).......))).))))....)))))).))((((((((.....))))....)))).........(((((..((.(((.((((((...(((((...)))))....))))))))).))...)))))...))))))))..))))))).))))....((((.(((...(((((....(((((((....(((((.(((....((..((((((.........((((((((....(..(((....)))..).........(((..((((..((((((((((.....((((((((.(((....))).((((((((.((.(..(((...(((.(((.............))).))))))..).)).)))))))).........(((((.((..(((.((((....)))).)))..)))))))...))))))))..((((...(.((.((.(((((..((.((((.((((((((....(((..((.(((((((..(((.....)))..)))))))...))..)))..)))).............))))...........(((((((........))))))).....((.((((....)))).)))))).)).))))))).))..)...))))..))))))........)))).)))).)))..)))))))).......))))))...))..))))))))..)))))))))))).))).))))(((((((....((((((....)).)))).)))))))...((((...(((.......)))...)))).......))))).)))))....))))))..))))))))))))...))).......)))))))))))..)))).....)))).))..))..))))))))))))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
....((((((((((((.......)))}..((.((((........)))).))..(((((((((.,((.{((,((((({{(({{(({(((,,..{{{...{{{((,,....{{{{,.((({{(((((.{{............}})))}|{.......))})))))).}}|))|....,,)))},})}..)))))},}}},..((((.(((((((((((...(((((((((,..({....,}..,.}))))).))}..{{,..,{{{{.||........((({.{(({(...{{{{.{{{{.{{.....((((.....,||}}}}.}))).)))).,)}}))|)))).....}}.}},}}}}|||,.{({(((((((,...,((((,,.((((((.(((({,,(((((,((((((..({{{({(,,,...,}}}}}..}}||||{,,{,{{((,({((({{,((((,(((,,....,{({{,...,{{(({,((,....}}|,||,{|.....,,,,,,|||}.,({{.....)})}}}}}.||,|||,.|}}}}.,,}))))}))}))))}}}}{(((.....)))}.....}}}}},.,}},,(((((,,((.(((.((((((...(((({...}))))....)))))|))).,}...}}}))........({{((.(({{.((((({....|||}.}}..}})),}}))}.((((({(,{..(((((.(((....((..((((((....{,...((((((((.,{{{..,,{||..||{(.....,|,...(((..{{((..((({((((((.....((((((((.((({,..,|,.((((((((.((.{..(((...(((.(({.............})).))))))..).)).))))))))...,.}}}}(((((.((..(((.((((....)))).)))..)))))))...))))))))..((((...{.((.({{(((((..((.(((((((,({{,.,,,.(((({(,.((,(((...,,{,{,....{(((((.{{{,..{....,...)))).)))))).....,}}}....}}).)}..||||||{..,,.,}})))||}}..}},||}||||},,,}}}),)))))).}).))))))).))..}...))))..))))))..,,...,)))),)))).)}}}.)))))))).......))))))...))..)))))))).)))))))),}}})}))).)))}(((((((....((((((....)).)))).))))))).,||,,,.,.||}},...},,}}.,||||||......),))),)))))....)))))).})))))))))))),..)}}.,},,..)))))))))))..))))....,)},,.},,,)}..))))))))))))))).))
Back