Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_BANP_0005400

Sequence Length

857 nt

GC Content

0.6476

AGGACUACCCCAAUGGCACCUGGCUGGGCGACGAGAACAACCCCGAGAUGCGGGUACGCUGCGCCAUCAUCCCCUCCGACAUGCUGCACAUCAGCACCAACUGCCGCACGGCCGAGAAGAUGGCGCUCACGCUGCUGGACUACCUCUUCCACCGCGAGGUGCAGGCUGUGUCCAACCUCUCGGGGCAGGGCAAGCACGGGAAGAAGCAGCUGGACCCGCUCACCAUCUACGGCAUCCGGUGUCACCUUUUCUAUAAAUUUGGCAUCACAGAAUCCGACUGGUACCGAAUCAAGCAGAGCAUCGACUCCAAGUGCCGCACGGCGUGGCGGCGCAAGCAGCGGGGCCAGAGCCUGGCGGUCAAGAGCUUCUCGCGGAGAACGCCCAACUCGUCCUCCUACUGCCCUUCAGAGCCGAUGAUGAGCACCCCACCUCCUGCCAGCGAGCUCCCGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGGCCCUGCACUACGCGCUGGCCAACGCACAGCAGGUGCAGAUCCACCAGAUCGGAGAAGACGGACAGGUGCAAGUAGGACACCUCCACAUCGCCCAGGUGCCGCAGGGGGAGCAAGUCCAGAUCACGCAGGACAGCGAGGGCAACCUCCAGAUCCAUCACGUGGGGCAGGACGGUCAGCUUCUAGAGGCCACCCGCAUCCCCUGCCUCCUGGCCCCAUCCGUCUUCAAAGCCAGCAGUGGCCAGGUGCUGCAGGGUGCACAGCUGAUCGCCGUGGCCUCCUCGGACCCCGCGGCGGCGGGCGUGGAUGGGUCGCCACUCCAGGGCAGCGACAUCCAGGUUCAGUACGUGCAGCUGGCGCCAGUGAGUGACCACACGGCCGGGGCACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-336.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -349.73

Frequency: 0.0000

Diversity: 251.39

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((......))..((((.((((((((((((...........((((.....))))..))))((((((((.((.(..(((...(((.(((.............))).))))))..).)).))))))))....((((((((....))((((((.(......((((..(((.(((((.........))))).)))..)))))))))))))))))(((...(((((((......(((..((.(((((((..(((.....)))..)))))))...))..)))(((((...(((.((.....))...)))...)).)))(((((.....)))))(((((.(((.(((.(..(.((((((((..(((..(((...)))..((((.(((.......))).))))..(((((((...(((.......((.((((((..((.(((((((((..((.(((((((((...(((((.((....(((.(((((((....((((((....)).)))).))))))).(((........)))(((((((((..((.((...((((((((((...........)))))..((((((((.((..((((...(((((..((((.(.((((....))))).).)))....)))))....))))(((..((((....)))).))).)).)))))))).)))))))))..)))))))))...))).)).)))))...).))))).))).))...))))..((((((((..((....))..)))))))))))))...))..)))).))))))).))))))).)))..)))))))).)..).))).))).))))).))))))).)))..)))))))))).)).

Thermodynamic Ensemble Prediction

.((......))..((((.((((((((((,({{{,,.....{((((,{,.{{||||.}},.((((((((.((.{..(((...(((.(({.............})).))))))..).)).)))))))).,,.(({(((((,...|,{((({(,({....}|||{.,|{{.{||||.....,,,,)))}},|||..}}}||}|}}|||||}}}||{|||{(({{{{..,,,.((({{(,.(({(((,..{{(.,,..,,|{{|||,|||...|...,},,,|||}.}|||}}.....,}}}....),}.)}..}}||||{..,,.}}})}|(({{.,{{.(({,({|{.{{{{{{{|,,{||..|.|||,}}}.}|{{{.,{|,,,..||)))|}})}..(((({(,.,,{{{....,}}||.||,.,(({(,.(((((((((..((.((((((({,,{.(((((.{{.{{.(({.(((((((....((((((....)).)))).))))))).{({........)))(((((((((..((,((..,,.((,|||||,,.....|.,{{||,|..((((((((.((..((((...(((((..(((,.{.((((....))))}.,.)))....)))))..,.))))(((..(((,....,))).}}).)).))))))))..))))))})..)))))))))...))}.)).)))))..,)}))))).))).))...))))..((((((((..((....))..))))))))))))).}})).|||||,||||||}.}}))}})|}}),,)))})))).}..).))).))),))))).))),))}.}),}.)))))))))).)).