Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BBS2_0002400
Sequence Length
830 nt
GC Content
0.4578
GCUGAAUUGGCCAGUCCACUGAACGAGGCUGAUGGGCAUCGGGGCAUAAUCCCAGCCAAUACCAGGCUCCACACCACGCUCUCAGUCAGCCUGGGGAAUGAGACCCAAACUGCUCAUACAGAAUUACGCAUUUCCACUUCUAAUGACACCAUCAUCCGAGCAGUAUUGAUUUUUGCAGAAGGAAUUUUUACAGGUGAAAGCCACGUGGUACAUCCCAGCAUUCACAACCUCUCCAGUUCCAUCUGCAUCCCUAUUGUGCCUCCCAAAGAUGUCCCUGUGGAUCUGCACUUGAAGGCAUUCGUGGGUUACAGAAGCAGCACCCAGUUUCAUGUAUUUGAAUCGACAAGACAGCUCCCUCGAUUCUCCAUGUAUGCGCUGACCAGCCUGGACCCUGCCAGUGAGCCAAUCAGUUAUGUUAACUUUACCAUUGCAGAACGGGCACAGAGGGUUGUUGUAUGGCUCGGUCAGAACUUUCUGUUACCAGAAGACACUCACAUUCAGAAUGCUCCAUUUCAAGUGUGUUUCACAUCUUUACGGAAUGGCGGCCACCUGCAUAUAAAAAUAAAACUUAGUGGAGAGAUCACUAUAAAUACUGAUGAUAUUGAUUUGGCUGGUGAUAUCAUCCAGUCAAUGGCAUCAUUUUUUGCUAUUGAAGACCUUCAAGUAGAAGCGGAUUUUCCUGUCUAUUUUGAGGAAUUACGAAAGGUGCUAGUUAAGGUGGAUGAAUAUCAUUCAGUGCAUCAGAAGCUCAGUGCUGAUAUGGCUGAUCAUUCUAAUUUGAUCCGAAGUUUGCUGGUCGGAGCUGAGGAUGCUCGUCUGAUGAGGGACAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-235.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -251.17
Frequency: 0.0000
Diversity: 234.52
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.....)))..((((.((.....((((((((((((...((((.....))))((((.......)))).........))))...)))))))).(((((((.........(((......))).......)))))))..............(((((..(((((((((.((((((((.((.(((..(((((((((((((...(((....((......))(((((((.....((..((.(..(((((.(((.((((.((((((((.(((.((......)).))).((((((..(((((((((.((((((.(((((((((........))))).))))...(((((((..((....))...))))))))))))).))))(((((...((((((......))))...))...)))))........)))))....))))))..)))))))))))).))).).))))..)))..))...((((((....)))))).............)))))))((((((((((((((...)))).)))...))))))).)))))))))....)))))))....)))..)).)))))))).))).....((((((.((((((........(((((((((((((.(((((((((........)))))))))...((((.(((((((...(((...)))..))))))).))))...(((.....)))..........)))))).)))))))))))))))))))...((((((.(((((..(((.(((((........)))))........))).))))).))))))..))))))..)))))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({....,{||{{({,,.}},..},{(((((((((((...((((.....})))((((.......)))).........))))...)))))))}(((........))),.,((({{{...}||{.....}|(({{{{.,.{{..{{{{,,,{.||{{{{||,||||{..{{{{,,((((((.((((((.....,,(((((.((....{((......))})).))))}..,,,....)))))).))))))......,,|,{{{{{{.{{{(({{{,,.{{{(((.,,(((((((((((((((((((((((((((((((........))))).))))...(((((((..,(....,},..))))))).........{..((((((((((..(((((({{{.((,.,{(,,{,,((,(,,.||,,,..,.,)),)).,,,,,)))}}..)))))).......)))).))))))..,{(((((....)))))}..)))))).....)))))))....)))))))))).))))))}))}}..))},,}|||({{,.|,||,,..............{{{(({,,.,,||||||,,..{(((((,(.{,(((({...(((((((((((((((({.(((((((((........))))))))}...((((,(((((({.,,((,...}})},))))))).))))...{{{.....})},|......}.))))))}})))))}})))),,)))))...|}}})))|,,.|,)))|}||||{,,,,....})}}}.,}})}}})))),))))},,))))).)),)}})}}))}}}))))}})
Back