Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_BBS2_0004800

Sequence Length

735 nt

GC Content

0.4599

CAGAUGGGGCAAAUGCAAUUGUGCUGGGGACAUUGGGAGACAUUUCUUCCCCUCUUGCGAUUAUUGGUGGCAAUUGUGCUCUGCAAGGUUUCAAUCAUGAAGGAAGUGAUCUCUUUUGGACGGUUACUGGAGACAAUGUUAAUUCCUUGGCCUUGUGUGACUUUGAUGGUGAUGGAAAGAAAGAGCUUCUUGUUGGAUCUGAGGAUUUUGAUAUCCGAGUUUUUAAGGAAGAUGAGAUUGUGGCAGAAAUGACAGAAACAGAGAUAGUCACCUCUCUUUGUCCCAUGUAUGGCAGUCGAUUUGGUUAUGCCCUUUCCAAUGGCACAGUUGGAGUUUAUGACAAAACAUCCCGAUACUGGAGAAUUAAAUCGAAAAAUCAUGCCAUGAGCAUUCAUGCUUUUGACCUUAAUUCUGAUGGAGUGAAUGAACUGAUAACUGGUUGGUCCAAUGGGAAGGUUGAUGCUCGAAGUGACCGAACUGGGGAGGUCAUCUUUAAGGACAAUUUUUCUUCUGCAAUUGCCGGUGUGGUAGAGGGAGAUUACCGGAUGGAUGGCCACAUACAGUUAAUCUGCUGCUCAGUGGAUGGGGAAAUCCGGGGCUACCUGCCUGGCACGGCUGAGAUGAGGGGCAACCUCAUGGACACCAGUGCAGAGCAGGACCUGAUCCGAGAGCUGAGUCAGAAGAAGCAGAAUCUGUUGCUGGAACUCCGUAACUAUGAGGAAAAUGCCAAGGUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-216.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -231.33

Frequency: 0.0000

Diversity: 160.06

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((((((..(((....))).((((.....((((((....))))))))))((((.(((...))).)))).(((..(((((..((((((((((((.......)))))(((((((...(.((((((((((((((.(((((....))))).))))....))))...)))))).)...)))))))((((((...(((.((..((((......)))).)).)))..)))))).)))))))...)))))....))).....(((((........)))))))))))).((((((((.(((.(((((((....(((((((((.(((((((((((.(((((((..((...(((((((....)))((((((((.((((((......((.((((....))))))))))))..))))))))))))...)).)))))))..))))))((((.......((((((((((.(.((.(((((((((..........))))).)))).)).)))))))))))....)))))))))...))).)))))).....))))))).))).))))..)))).....(((((((((((((((((.(((.............((((((((.(((((.((..((((((.....))))))...)))).)))))).))))).))).))))....))))))).......)))))))))))(((((((...(((.((....)).))).....))..)))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((((((((,.{{{.,,,}}).(((({....(((((,...,)))))))),,{{((.{{,...|}}.}))},{{{.,(((((..{(((((({(({{..,,{,{||}}|{((((((..,(.(((({{(,{,((((.(((({....})))).)))).}..),,),,}})),}).)}},)),)}})|||||{.,,({{,{{..((((......)))).,}.,},,.})))}).)))))))...}))))...,}}},....|{{{|..,,...,)))})))))))).((((((((.(((.(((((((.,,.(((((((((.(((((((((((.(((((((..((...(((((({....}))((((((((.((((((.....,({,{{{{....}))))}))))))..))))))))))))...)).)))))))..))))))((((...,,..((((((((((.(.((.(((((((((..........))))).)))).)).)))))))))))..,,)}}})))))...))).))))))..,,.))))))).))).)))}.,)))}.....(((((((((((((,,,(.(({...{{,,((,...(((((((,{(((((.{{..((((((.....))))))...}})).)))))).))))).)))}))))....))))))).......)))))))))))(((((((...(((.{,....,}.))).....)),.,))))