Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BBS2_0006400
Sequence Length
319 nt
GC Content
0.4671
GUUUUUAUUCAUAAUCCUCAUACACGGAACCAGCAUGUCAGUGCAUCCAGGGUCUUCCAGAGCCCCCUGGAAUCUGAUGUUUCUCUUCUCAGCAUUAACCAGGCAGUCAGCUGUCUGACUGCAGGCGUAUUGAACCCUGAGCUUGGCUAUGAUGCCCUUUUAGUGGGGACACAGACUAAUCUUUUGGCUUAUGAUGUCUACAAUAAUUCGGAUUUGUUCUACAGAGAGGUAGCAGAUGGGGCAAAUGCAAUUGUGCUGGGGACAUUGGGAGACAUUUCUUCCCCUCUUGCGAUUAUUGGUGGCAAUUGUGCUCUGCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-87.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -92.19
Frequency: 0.0004
Diversity: 69.33
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((((.((((((..((.....((((...((((....)))).(((((((.(((...)))..)))))))....((((((((((((((((((.........((((((((....))))))))((((((..(((.((..(((.((((((.((.(.(((.......))).))).)).)))).)))..)).)))..))))))...((((((.(.(((((((((((.(........).).)))))))))).)))))))))))))))....))))))))))..)))).....)).)))))).))))).)))(.(((...))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
({{.,,,,,.,,{,(({..,.....|||,...((((....)))).(((((((.((,...))}..)))))))....(((((((((((((((((({,.......((((((((....))))))))((((((..(((.((..(((.(((({{.((.(,((({......)))},)),)}.)))).)))..)).)))..))))))...,{((((.(.(((((((((({.,........,.}.)))))))))).)))))))))))))))....))))))))))..,}}}....,||{|||}}}.}}}}}}))},.|||...))),)
Back