Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_BCL2L14_0000800

Sequence Length

756 nt

GC Content

0.3981

GUAGGGACAGAGACUUGCACACACACACAGCUUCAUGGCAUCUUACCAGAGGGCUGAUCUCUCCUACAACAGCAACACCCAGAAUGGGUUUUUAGAAAUAUCUACUUUCCUCACUAGCACUGUUGGAUUCCUAGAGAAAACAAAGCCCUUCGUCCAAGGUUAGUAUUAAUUGCAUUUUUUUCCUUUCAUCAUUUCUUACUUGUUGGCCCUCAAAUGUUAGUUAACUGAAGGCUAUCUGGCUACAUCCAUGUAUCUAUGGUUUGCUGCUCUGAGAUGGACUUAAUUUUUCUUCUUCCUCUUUUUUAUUUUUGGUAUCAAUAAAGCCCAGAUAUUCCUGGUCAGUGAUGCCUUUAUUAUUCCUGUUUCCUUUGUACUCAGUUGCUUCACUGGGUUUAAGGCAUGCUUUGUGUAUUUAGUUUGCAAAAAUAAAACUUUUAGUACAAAUUUUUUUUAUACAAACUUUUAUGGCACAAGCAGCAAAUCUGCUGUUUUAAGAAAAUAUAUAAAUAUCCUUUUCUUCUGUACAAAUAUCUCCAGUAUUCCCUACCCCAUUUUAUAAUUUUAACUGUACAUGGUCUGCCUCAUCCUUCUCUAAUAGCUCCCUCCCCCCCUCCAGAUCUCAACCAAAUUUAUAUUUACAUUUUUACGUUGGAGGCAGUCAGAGGAGGAGGGCCCCUCCUCAGGAGGAGUCUGUACAGGGAGAGGGUGGCGGUGGGUAGAGGUGAUGAGAAUAGCUCCUCUCUGUGUAUGGAGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-174.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -192.68

Frequency: 0.0000

Diversity: 215.51

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((..((((.(((.(((......((((((..(((.......)))..))))))...........(((((((..(((((...)))))...((((....))))........((((((.((..(((((....((.............))..))))))))))))).....................................(.(((((.(((...(((....)))))).))))).)(((.((((....)))).))).(((((((((((..((((.(((...............)))))))..........(((((((.....(.((((......)))).)..)))))))............((...(((((.(((((((......))))))).)))))...))..(((((....((((((.(((((.....................)))))...))))))......)))))))))))))))))))))))..(((((((.............))))))).))).)))...))))......)))))))(((((..((((........)))).)))).....(((((((((((((....((((((((.(((....((((.(((..((......................((((....))).).(((((((......))))))).))..)))))))....))).))))).)))....)).))))).)))))).....((((...........))))..)

Thermodynamic Ensemble Prediction

({(((((.,((({..{({{........,{(((,..{((,,,.,..||,(((((((,.{((((....((((((.,..(((({...}))))...((((....})))............,..}))))).......)))))......))))))}.,,,,}}))},,||......})}}.,}}}.,}}|{{(({((({((,.,{,.{.(((((.(((...{,,...,},,))).))))).}|||..,,|.{{{||||.,,,.(({{((((({|..((((.(((...............)}}}}},..........(((((((.....{.((((......)))).,..)))))))............((..,((({{.(((((((......))))))).}))))...)).,(((((....((((((.,,(((.{(({.,{,......,},})))})))...))))))......))))))||||||}}}},}}|||...(((((((,{{....,}},..}))))))..|,|},....,.....}}}.,,},}}},,,,,..,{,,........})))})))).{{(((((((((((((((.(({(((((((((,..(((((((.........{{{{....,,,}...........)))))))..,...(((((((......))))))).))))))).)))}..})))})))))))),}))))),)))))})))))),....},}{{{{{{,.....))))}.)