Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BMPR2_0001800
Sequence Length
1425 nt
GC Content
0.4267
GAGGAUUGCUUGAGGCCUAGAGUUCGAGACCAGCCUGGGCAAUAUAAUGAGAACCCUGUCUCUACAAACAAUUUUUAAAAAUCAGCUGAGUGUGAGUCUGUAGUACCAGCUACUUGGGAGGCUGAGGUGGGAGGCUCACUGAAGCCCAGGAAUUGGAGACUGCAAUGAGCUGUGAUCAUGCCACUGCACUUCAGCUUGGGUGACAGGUUGAGACCCUGUCUCUUAAAUUUAAAAAACAAAAAAGGCUGGGUGUGGUGGCUCAGGGCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCAGGGCGGGCAGAUCAUGAGGUCAGGAGAUUGAGACCAUCCUGGCUAACAUGGUGAAACCCCGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAAUUAGCUUGGCGUGGUGGCAUGCGCUUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCGCUUGAACCCGAGAGGCAGAGUUUGCAGUGAGACGAGAUUGCGCCACUGCCCUCCAGCCUGGGCGACAGAGUAAGAUUCCAUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACUUGUUUUUGCUUUUGAUUUUAUCAUUUCUUUUAAAAAACUUUUUGUUAUUUAAGAUUCUAAAAUUAUACAAAGUCAUUGUAAAAGGGUUUUAUAAAUUUAUUUUUUUUUUUUUGAGACUGAGUUUUGCUCUUGUCCAGGCUGGAGUGCCAUGGCUCGAUCUUGGCUCACCGCAACCUCCGCCUCCUGGGUUCAAGUGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGAUUACAGUCAUGUGCCACCACGUCCGGCUAAUUUUGUGUUUUUAGUAGAGAUGGGUUUUUCCAUGUUGGUCAGGCUGGUCUCGAACUCCUGACCUCAGGUGAUCCGCCCGCCUCAGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACUGCACCUGGCCCAUUAAAAAGGGUUUUUAAACGAUGAUGAUGGUGAAGUGUAGAAAUGAUAAUGAAGUAUACAAAAAAAAAAAAAAAUCGUCUCGUGUUUCCUUAAUCCCAUUUCCUGGAUGUAACCAGUGUUAAUAGUUGGUGUAUAAUCUUUAAUGCUUUUUUAUAUGUGCUAUAAAUAAAUAUCUGUAUAAUUAGAAUUUGCUUCUAAACAAGGUGGAAUAAUAUUGCGUAUAUUGUACAUAAAGUUUUGUGAUUAUUGAUCUGGGACAGUUCUAGAAGUAAGAUCAUGUGGUUAGAAAUUUGUACAUUUAAAAUCUUGAAAUGAACUGCUAGAAUUUCUUCAAAAUAGGUUGUACUGUCAUUUCUACCAGUAGUGUAUGAGAACCUCCCUUUUCUUUCGUGUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGACAGAGUCUUGCGCUGUUGCCCAAGCUGGAGUGCAGUGGCACGAUCUUGGCUCACUGCAACCUCUGCCUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-704.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -725.51
Frequency: 0.0000
Diversity: 231.35
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.(((..((((((.(((.(....))))))))))........((((......))))..))).)))))))........(((((.(((...........)))))))).)(((((((((.(((((....((((......))))..............((((.((((((..((((.((((((((((((((((((((((((((((..((((((.(((((((..(((...((((((((..((((((((((((((((((((((.(.(((((((((((((((((((((((((..((((((((.(((((((((((((((((.(((((((((.((((((((((((((.(((((((.((((((((((((((((((((..(((((((.((((((((((((((.(.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((.(((.((((.(((((.((((((((.((((..((.((((((((((((((..((((((((((((..(((((((((((((((((.(((((((((..(((((((...(((((((((.((((.(((((((.(((.....))).))))))).....)))).)))..))))))..))))))))))))).....))).)))))))))))))))))..)))))))))))))))))))))))))).))..)))).)))))))).))))).)))).))).))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).).)))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))).))))))))).))))))))))))..))))).))))))))..))))))))))))))))))))))))).).))))))))))))))))))).....(((((((((((((.(((....((..........(((((((((((.....((((((..................((((((.(..((..(((((.((....((..(((((...((((((((..((((.....))))..)))))))).....((((((((.(((......(((((((....((((((.....)))))))).)))))......))).))))))))..)))))..))...)).)))))..)).)))))))((((((((.(((....((((..((((..((((......))))..)))).....))))))).))))))))..............)))))))))))))))))))....))).))))))...))))))).)))..))))))))......)))..))))))).))))))..)))))))))))))))))))))))))))).))))..)))))).))))))))).)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,{(((((,(({,,((((((.(((.,....,}))))))))........((((......))))..}}}.}}}}}},........(((((.((({.......},.)))))))).)(((((((((.(((((..,.{(((......})))|,......,.....((((.((((((,.((((.((((((((((((((((((((((((((((..{(((((.(((((((..(((...((((((((..{{{(((((((((((((((((((.(.(((((((((((((((((((((((((..((((((((.(((((((((((((((((.(((((((((.((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((({,,{(((((((.((((((((((((((.(.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((.(((.((((.(((((.((((((((.((((..((.((((((((((((((..{(((((((((((..(((((((((((((((((.(((((((((,.,((((((...((((((({{.{(({.(((((((.(((.....))).))))))).....}))).}},.}))))))..))))))))))))).....))).)))))))))))))))))..)))))))))))))))))))))))))).))..)))).)))))))).))))).)))).))).))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).).)))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))).))))))))).)))))))))))}.,))))).))))))))..))))))))))))))))))))))))).).))))))))))))))))))).....{((((((((((((.(({,,..,,.{{{{,..,,((((((((({{....,{{{{{{|................,||,||}}|,.,...,,{{{,,{,,,,,{||{{{{..({((,((((({{((({,,,,{|||,,,|||||||,....{((((((({.{{,......(((((({....((((((.....))))))}},})))).....,}}}.)))))))},}}}}}),,}}..,}}})))))}}))}}))),}}|{{|||||.{{{,.||{{{{,{{{,,{{({{{,,{{,{||||,..,,,,}||,}}},}}}.},,)))))}}}.,....,,}}})}))))}})))))))))))....))).))))))},.,}})))}.}}}..))))))))......))}..))))))).))))))..)))))))))))))))))))))))))))).)))).,)))))).))))))))).)))))))))
Back