Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_BMPR2_0003100

Sequence Length

445 nt

GC Content

0.3798

GAAGAUUAUCCAUGUUUUUAUUUCGCAUUCCACUUGAACUAUCUUGGAAACACAGGGUAUAACAUCAAACAAUGGUCAUAUAAGUAUUUUUUAAAAUUUGUUUUUAUCUGUUGCUUUAUCUGCUUUGUGGUAUAUUAUUGUAUUCUAUGUCUGGACAUGUCUGGACGUUUUCAGUUGAUUCAUUAAUAUCAGGAGUAGUGUGAGUGUUUCCUUGUCAAGGAGAUACUGCAUUUUCUUCCUAGUCCCAUAAUUAGCCAAAGGAACAAACUACUCUUCUUAAAUGUUCAUCAAAACAGGUAUAUGAGUCUGGGCGCAGUGGCUCACGCCUGUAAUUCCAACACUUUGAGAGGCCGAGGUGGGUGAAUCACUUGAGGCCAGGAGUUUGAGACCAGCCUGGGCAAGACGGCGAAACCUUGUCUCUAUAAAAAAUACAAAAAUUAAUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-102.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -111.65

Frequency: 0.0000

Diversity: 127.39

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...(((((((((.(((....(((((.(((((..((((..(((((((......))))))).....))))((((.(((.....(((((.....(((((.....))))).....))))).....)))))))((((((....))))))..(((((((((....))))))))).......((((........))))((((((((((((((((((((((...))))))))))).)))((((((.(((((......)))))...))))))...))))))))(((((((((((.......((((((...((((((((....)))..))))).))))))......)))).)))))))((((.((((((.....))))))..)))).))))).)))))..))).))))..(((.(((((....)))))))).................)))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

({,(,,,,,{{,((({{,,,.......{{{,...,||..,{{{{||,,,.,,||)))}}.....,.,|||{|}||..,.{,(((((.,...{({{{.....}})))..,},))}}},,,.,})))),|{((,,({{.{{{||{{..(((((((((....)))))))))..{{{{.(((({{{{,...}},|(((((((((({(((((((((((...))))))))))).))}{{{{((.(((((......)))))...)))))}...)))))))|{((((((((({.......((((((...((((((((....))}.,))))).))))))......}))).))))))},|{|,||||}|||}}}})},||}}{.{{{{|.||,,..,}}}.,)))}),).(((.(((({....))))))))......))))))}.}}}.,)))}.