Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BMPR2_0003500
Sequence Length
2019 nt
GC Content
0.4557
GAGAAUUGCUUGAGCCUGGGAGGCGGAGGUUGCGGUGAGCCAAGUUUGCGCCAUUGCACUCCAGCCUGGGCAACAAGAGCGGAACUGCAUCUCAAAAGAAAAAUAAAUAAAUAAAUAAACGUAACUGGAGAGAAAUCAAUGCCUGGCUUCAAAGCUUCAAAGGACAAGUCAGCUCUCUUGUUAGGGGCUAAUACAGCUGGUGACUUUAAGUUGAAGCCGAUGGUUAUUUACCAUUUUGAAAAUCCUAGAGCCCUUAAGAAUUAUACUAAAUAUGCUCUGCCUGUGCUCUAUGAAUGGAACAACAAAGCCUGAAUGACAGCACAUCUGCUUACAGCAUGACUUACUGAAUAUUUUAAGCCCACCAUUGAGAACUACUGCUCAGAAAAAAAGAUUGCUUUCAAAAUAUUACUGAUCAUUGACAAUGCACCCGAUCACCCAAGAGCUCUGAUGUAGAUGUAUAAGGAGAUGAAUGUUGUUUUCAUGCCUGGUAAGACAACAUCCAUUCUGCAGCCUAUGGAUCCAGGAGUAAUUUUAACUUUAAAAUCUUAUUUAAGAAAUAAUAUUUCAUAGGCUAUAGCUGCCAUAGAUAGUGAUUCCUCUGAAUCUGAGCAAAGUAAAUGCAAAACAUUCUGGAAGGAAUUCACCAUUCAAGAUGCCUUUAAGAGAAUCAGUGAUUCAUGGGAGGAGGUUAAAAUAUCAGUACUAACAGGAAUUUGGAAGAAGUUGAUUCCAACCUUUAUGGAUGACUUUGAUAGGUUAAAGACUUCAGUGGAGGAAGUUACUGCAGAUGUGGUGGAAUAGCAAGAGAACUAGAAUUAGAAGUUGAACCUGAAGAUGUGACUGAAUUGGUGCAGUCUCAUGAGAAAAUUUGAAUGGAGGAAGAGUUGCUUUUUUUUUUUUCUUUUUCAGAAAGGGUCUCACUCUUGCCCAGGCUGGAGUGCAAUGGCGUGGUCACAGCUCACUGCAGCAUCAACCUCCUGGGCUUUAUCAACCCACCUCGGCCUUCCAAGUAGCUGGAACUACAGGUGUGCACUACCACACCUGGAUAAUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGAUGGAGUCUUGCUCUGUCGCUAGGCUGGAGUGCAGUGGUGCGAUCUCGGCUCACUGCAACUUCUGCUUCCUGGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGACUACAGGCACGUGCCACCACGCCCAGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACCGUGUUGGCCGAGAUGGUCUCUAUGUCUUGACCUCGUGAUCCGCCCGCCUCAGCCUCCCUAAAUGCUGGCAUUACAGGCAUGAGCCACUGUGCCCUGUUUAAAAGUUGCUUCUUAUGGAUGAGCAAAGAAAGUUGUUUCUUGAGGUGGAAUCUACUUGUGCAGACGCUGUAAACAUUGUUUAAAUGACAACAAAGGACUUUUUUCUUUUUCUUUUUCUUUUUUUUUUUUUGAGACAGAGUCUUGCGCUGUUGGCCAGGCUGGAGUGCAGUGGUGUGAUCUUGGCUCACUGCAAGCUCUGCCUCCUGGGUUCACACGAUUCUCCUGUCUCAGCCUCCCGAGUAGUUGGGACUACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCUAAUUUUUUGUGUUUUUAGUAGAGACGGGAUUUCACUGUGUUAGCCAGGAUGGUCUGAAUUUCCUGACCUCAUGAUCCACCCGCCUUGGCCUCCCAAAAUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCGUGGCGCCCAGCCUAGCACAUUUUUCUUUUUUGAAAUGGAGUCUCCCUCUGUCGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCACGAUCUUGGCUCACUGCAACCUCUGCAUCCCAGGUUCAAGCUAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCUGAGUAACUGAGAUUACAGGGACCUGCCACCAUGCCCGGCUAAUUUAUUUUUUUUGAGACGGAGUUUCACUUUUUUUGCCCAGGCUGGAUGGAGUGCAAUGGCACGAUCUCGGCUCACCGCAGCCUCCGCCUUCCGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-690.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -726.29
Frequency: 0.0000
Diversity: 350.67
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.((((((((((((((.((((((((((((((((((((((.(((.((((((((((((((((((((((.(((.(((.((((((.(((.(((((((((((((...............(.((((.((((((.........(((((((....))))....))).........)))))).)))).)(((((((((((..(((..(........)..)))((((((.....))))))..........((((((......................))))))(((((.((((((....((((((.(((((((((.((..((.(((((((((....(((......((((((.((((((((.(((.((((.....(((..((((((((......(((((((.((..........(((((..((......))...)))))........((((..((((....)))).))))(((.((((((((((.((.....)))))))))))).))).(((.((((((((((....(((((.......)))))....((((....))))........)))))))))).)))........)).)))))))........)))))))).)))..........((((.((((.((......)).)))).)))).........(((((...)))))))))..)).).))))))))))))))...........((((((........))))))(((((((.((.(.((((((....)))))).).)).)))))))..)))...))))))))).))..))...(((((((..((((..(((((((.(.((..((((.((((((((((.((((((((((((((......((((((.((((((((((........))))))))))..))))))..(((.(........))))((((((.((.((...((((.((((((.(((......)))..........((((.........)))).((((((((((((......)))))...((((((((......))))))))....................(((((..((((..(((((.((...(((((..((((((((((((.((.......))))))))).))))).....)))))...)))))))..))))...))))).....((((((((((((......(((....)))......))))))))...))))...........((.((((.......)))).)))))))))..((((..........))))..)))))))))).)))))))))).........(((......))).))))))..))))))))..))))...)))))).))))..)).).)))...(((((((.(((.(((((((((...)))))).(((((...)))))..((((.....)))).))).))).)))))))))))..))))..))))))).......(((((((((((.....((.(((.((((((((.((((((((((((.((.......)))))))))..)))))))))....)))).)))))...)).)))))))))..((((((....))))))...)))))....(((.........)))......))))))))))..)))))))))))......))))))))))).((((((((.(......).)))).....))))...(((((.(...(((((......)))))...))))))...((...(((.....)))..))..))))))))..))))).))).))).))))))))).)))))))))))))))))))))).))).)))))))))))))))))))))).)))))))))))))).))))))(((.(((((....))))).....((((((.(((....)))((((((.(((.(((..............((((((...))))))........)))..)))))).))).((((....))))))))))((((......)))).........)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((.((((((((((((((.((((((((((((((((((((((.(((.((((((((((((((((((((((.((,{(((.((((((.(((.(((((((((((((...............(.((((.((((((.......,,(((((((....))))....))).,,......)))))).)))).)(((((((((((.,(((,,(,....,,,}..)))((((((.....))))))..,,......((((((...,.,{.......,}......))))))(((((.((((((....((((({,(((((((((.{(..((.(((((((((....{{..{{{{{((((({,((((((((.(((.(({{{(({.{{(.,((((((((......({{{{{{,{{..........(((((..{{......||...})))}.......,{{((|.{{||,..,),},.|}|{(((.(((((((((({{,....,),)))))))))).)))}}}(((((((((((..,..((((({,{{{{..,,{|{{|...,,.}}}}})},,,..}}}))),,,))))})))))))....)}.})))}}|,,,,|,,,)))))))}..,,...,|}....,||{|(|{({((.,.,,.},.}},..))}}}}}},.,}}|,|||}}}},)))))))..)).).)))))))))))))}......,....((((((........)))))}(((((((.((.(.((((({....)))))).}.)).))))))).}))),,,))))))))).))..}}...(((((((..((((..((({(((.(.((..((((.((((((((((.((((((((((((((......{(((((.((((((((((........))))))))))..))))))..((({,........))))((((({{((.((...((((.((((((.(({....,,|}}..........{(((.........)))}.((((((({((((......))))}...((((((((......))))))))....................,((((..((((..(((((.((...((((({.((((((((((((.((,....,.)))))))))},)))).},..}))))...)))))))..))))...))))}.....,{,,((((((((......(((....)))......))))))))...,,|,,,.......,,{|,((({,,.....))}),)})))))))..((((..........))))..)))))))))).))))))))))........,{{{......})).))))))..))))))))..))))...)))))).))))..)).).))).,{(((((({.(({.|{{((((((...)))))).(((((...)))))..{{((,,,..,}}),))).})).)))))))))))..))))..))))))).,,....{((((((((((..,,,{(.(({.({((((({.((((((((((((.((.......))))))))),.})))))}},,}}}),),,))))),..))}})))))))}..((((((....))))))...}))))....(({.........)))......))))))))))..)))))))))))...,,,))))))))))).((((((((.{......,.)))).....))))...(((({{(...(((((......)))))...)))))).}.{{...(((.....)))..))..))))))))},,}))).))).))).))))))))).)))))))))))))))))))))).))).)))))))))))))))))))))).)))))))))))))).))))))(((.(((((....))))).....((((((.(((....)))((((((.(((.(((.,,...........((((((...))))))........)))..)))))).))).((((....))))))))))((((......)))).........)))
Back