Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BMPR2_0003800
Sequence Length
2273 nt
GC Content
0.5037
UGCAGUGGGGCGAUCUGGGCUCACUGCAAACUCCGCCUCCCGGGUUCCCACCAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGACUACAGGUGUCCGCCACCAUGCCCGGCUAAUUUUUUAUAUUUUUAAUAGAGACGGGGUUUCACCGUGUUAGCCAGGAUGGUCUCGAUCUCGUGACCUCAUGACCCGCCUGCCUCAGCCUCCCAAAGUUCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCAUCGUGCCCGGCCAUAAAGUUUUUUAAGUUAGCCAUUUCCAGUGUCUGAUCUUCAGUGAAGUUUGUAAAUUGUUUUUGUUUUGUUUUGUUUUGCUUUGUUUUGAGAUAGAGUCUCCCUCUGUCUCCUAGGCUGGAGUGCAGUGGCAUGAUCUCAGCUCACUGCAGACUCUGCCUCGUGGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCUGAAUAGCUGGGAUUACAGGUACAUGUCACCACACCCAGUUAAUUUUUCUGUUUUUCGUAGAGAUGGGGUUUCACCAUUGUUGGCCAGACUGGUCUCAAACUGCUGACCUCAGGUGAUCCACCUGCCUCAGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCAUGAGCCACUGCACCCGGCCUGUAUAUUCUUUUAAAAUAAUAAAGAUAGGGAGCUAGAUAUUAGUAAAAAGUAGCAACAAAGAUGUAAGGAUCAGAUGAUGACCCAAGGACUGUUAGUGGAGGGUUUUGCCAUGUUGGCCAGGCUGGUCUUGAACUCCAAACCUCAAGUGAUCCACCCUCCUCGCCCACCCAGAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCACCAUGCCCAGCUGACAGGUGAAAUACUAAAAAAUAACAUGGCUAGGCUCAAAAAUGAAGCUUAACACCUCCUUGGAAUAGAAAAGCAAAGUGUUCUACCUAACUGAACUCUGGGGCCAGAAGUUGGCAGUUUUUCCCAUGAUUUCUUGCCAGGCUGACAGGGUCCAAAAGUGACCAUGUGAGAAGGAGAUCAGAACUUGGCUCCCACUUCAGACACGGGGGCUGUGUCUCCUUGAAAGGAUGCCAGAAAGAGAACAGCAUCUUGCUUCUUGGUGUUAAAAACUUUUUUCAUUGGCCAGGCACUGUGGCACACACCUGUAAUCCCAGCAGUUGAGGAGGAUGGGGUGGGAGGAUUGCUUGAGCCCAGGAGUUCAAGAUCAGCCUAGGCACAGUGGCAAGACCCUUUUCUGUCUCUACAAAAAUUUUAAAAAUUUCUCGGGAUGUUGGCGUGCGCCUGUGGUCCCAGCUACUCAGGACGCUGAGGCAGGGGUAUCGUUUCAGCCAGGAAUUCGAGUCUGCAGUGAGCUAUGAUGGCGCCACUGUACUCUGGCCUGGGCAAUAGCAUAAGACCUCCUCUCUAAAAGAGAAAUGAUAAAAGGCCAGGUACAGUGGCUCAUGGCUGUAGUCCCAGCACUUUCGGAGGCCGGGGUGGUUGGAUUGCUUGAGGCCAGGAGUUCAAGACCAGCCUGACCAACAUGGCGAAACCCUGUCUCUACUAAAUAUACAAAAAUUAUAUUUGUUUAAUUACAUACCACGGAUGUGGUGGCCCGUGCAGACGUCCCAACUACAUGGGAGGCUGAGGCGUGAGAAUUGCUUGAACCUUAGAGGCGGAGGUUGCAGUGAGACAAGAUCAUGUCACUGCCCUCCAGCCUGGGUGACAGAGCAAGACUGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCAGGCACAGUGGCUCACCCCUGUGAUCCCAGCACUUUGAGAGGCCGAGGCGGGCAGAUCACUUGAAGUCAGGAAUUUGAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGACACCCUGUCUCUAAUGAAAAUGCAAACGUUAGCUGGGCAUAGUGGCAUGUGCCUGUAAUCCCUGCCACUUGGGAAGCUGAGGCAAGAGAAUUGCUUGAACCCAGGAGGUGGAGGUUGCAGUGAGCCAAGAUUGUGCCACUGCACUUCAGCCUGGGCGACAGAGCAGGACUUCGUCUGAAGAAAAAAAAAAAAACACGUUUUUUAUAAGCUGUGGCCCUAGGUCUGGCGUGGUGGCUCACGCUUGUAAUCCCAGCACUUUUGGAGGCUGAGGCGGGUGGAUCACGAGGCCAGGAGUUCGAGACCAGCCUGGCCAACACAGUGAAACCCCGUCUCUACUAAAAGUACAAAAAUUAGCUGGGCGUGGUGGCAGGCGCCUGUAAUCCCAGCUACUCUGGAGGCUGAGGCAGGAGCAUUGCUUGAACCUGGGAGGUGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1265.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1296.84
Frequency: 0.0000
Diversity: 257.84
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((.(......).))))))))..)(((((((((((((((((........(((((((((((((((((.((((((((((((.((((((((((.(((((((((((((((((((((((..((((((((.(((((((((((((((((.(((((.((((((.(((((((((.(((.((.((((.(((.((((((((((((((((((.(((((.(((((((((((((((((((((((((((((.((((.((((....)))).....(((((...((.((.........)).)).((((((((((.......((((((.((((...........((((.((((.((((((..(((((((.((((((((((((((((((((((((((((..((((((((((..(((((((((.((((((((((((((((((.(((((((((.((((((...((.(((((((((((((((((((((....((((((((((.((..(((((((((((((((((((((.(((((((.(((((((((.(((((((((((.(.(((((.((((((((((..((((((((.(((((.((((((((((((((((((((..((((((((((..((.((((((((((((((((.........)))))......((((...............)))).(((....)))..((.(((.....))).))........(((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((...((((((((((((((.((.(((((.((.((.((((((((((((((((((.((((((((((..((((..(((((.(((((.((((((...............((((((((....)).))))))...((.....)).............)))))).)))))...((((((((.((((((......(((((((((.(((((.......((((.((((.(((.(((((....).)))).)))...(((((((((((..((((..((........))..))))..))).))))))))(((((((((((((((.((((......))))..))).))))))).....)))))......)))).)))).((((...))))(((((..(((((.....)).)))..))))))))))))))))))))).)))).))))))))...)))))...))))..))))).((((........)))).....................((((((.(.(((((((((.((((((((....))).(((((....)))))))))).)))).......))))).).))))))((......))((((...))))((((((((((.(((((((..((....))...........(((((...))))).........)))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))).)).)).))))).)).))))))))))))))...))))))))))))))))))).)))))))))))))))))....))))))))))))))...(((((........)))))...((((((....))))))(((....(((.(.(((((......))))).)))).))).(((((.((((((..((((...(((((((((..(((((((.(........).)))))))))))).))))))))....)))))).....)))))...................))))).))..))))))))))..)))))))))))))))))))).))))).))))))))..)))))))))).))))).).))))))))))).)))))))))))))))).))))))))))).))))))).))))).))))))))))....))))))))))))))))))))).))...)))))).))))))))).)))))))))))))))))).)))))))))..))))))))))..)))))))))))))))))))))))))))).)))))))..)))))).)))).))))...)))).)))))).....)))))))))))))))....)))).))))))))))))))))))))))))))))).))))).)))))))))))))))))).))).)))).)).))).))))))))).)))))).))))).))))))))))))))))).)))))))).))))))))))))))))))))))).)))))))))).)))))))))))).)))))))))))))))))........)))))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((.(......).)))))))),.,(((((((((((((((((.....{,.(((((((((((((((((.((((((((((((.((((((((((.(((((((((((((((((((((((..((((((((.(((((((((((((((((.(((((.((((((.(((((((((.(((.((.((((.(((.((((((((((((((((((.(((((.(((((((((((((((((((((((((((((.((((.,,,,.......|,{{{{(,(((....|}}}.}}}}.,.,,,|,,.((((((((((..,....{{{{{(.{(({.{{{{..,,,.((((.((((.((((((..(((((((.((((((((((((((((((((((((((((..((((((((((..(((((((((.((((((((((((((((((.(((((((((.((((((...((.(((((((((((((((((((((....((((((((((.{{,.{((((((((((((((((((((.((((((,{(((((((((.(((((((((((.(.(((((.((((((((((..((((((((.(((((.((((((((((((((((((((..((((((((((..((.(((((.,.,.,(((((.........}))}}.,{{..((((....,,.........}))).,|....,{{{{,((.{((.....}}}.)}........(((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((...((((((((((((((.((.(((((.((.((.((((((((((((((((((.((((((((((..((((.{(((((.(((((.((((((............{,.((((((((....)),}))))).,.|{.....}}.............)))))).)))))...((((((((.((((((......(((((((((((((((.......((((.((((,(((.(((((....}.)))).))).,.(((((((({{,..(,{({{(({{......,,..,)))}}))),)))))))){{{{{((((((((((.((((......))))..)))}})))))).....,,,))}},..})))).)))}.{(((...)))}(((((..(((((,...,)).)))..))))))))))))))))))))).)))).)))))))).,.))))).}.))))..))))).((((........))))......,{{{{,...,}}}},{({(((,(.{{(((,,{{|||{{{,|||||.{{,.({{((...,)))})})}}),}}}},,,....))))).).))))))||,.,..,},{{{,...))))((((((((((.(((((((,{({....}}......,,,..(((((...))))).........)))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))).)).)).))))).)).))))))))))))))...))))))))))))))))))).)))))))))))))))))....)))))))),,,.,}.....|}}}}}}}},.,..}}}},|(((((....)))))}{{{|,,.{{(.(.(((((......))))).)))|,|||,,{{(,.((((((..((((...(((((((((..(((((((.(........).)))))))))))).))))))))....))))))..,}}))))}...................))))).))..))))))))))..)))))))))))))))))))).))))).))))))))..)))))))))).))))).).))))))))))).)))))))))))))))).)))))))))))},)))))).)}))).))))))))))....))))))))))))))))))))).))...)))))).))))))))).)))))))))))))))))).)))))))))..))))))))))..)))))))))))))))))))))))))))).)))))))..)))))).)))).)))),}})))},)))))).,...))))))))))})}))....)))).))))))))))))))))))))))))))))).))))).)))))))))))))))))).))).)))).)).))).))))))))).)))))).))))).))))))))))))))))).)))))))).))))))))))))))))))))))).)))))))))).)))))))))))).))))))))))))))))).},,}...)))))))))))))))))
Back