Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BMPR2_0005700
Sequence Length
2748 nt
GC Content
0.3657
UGGAGACGGGGUUUCACCAUGUUGGCCCGGCUGGUCUCAAACUCCUGACCUCGUGAUCUGCCAGCCUCUGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACCGUGCCCAGGCUAGUAACCACUGUUUAUCUAUUAAUUUGUACUCAGGGUGUUAAUAGAGCACGUUAAUUGAUUUUUUGAAUAUUGAACCAGGCUUGCAUAUCUGGGAUAAACCACCCCGUACCUUUUUUUUUUUUUAACUAUACUUUUUUUUUAAAUGCUGAACUAUCCACAGGCCCUUAUGGUUUUGUUUUUUGUUGUUGUUGUUGUUGUUUUUGUUUUUUGAGAUGGAGCUUUGCUCUUUUUGCCCAAACUGGAGUGCAGUGGUGCGAUCUCAGCUCACUGCAACCUACACCUCCCAGGUUCAUGUGAUUCUCUUGCCUCAGCUCCUGAAUAGCUGGGAUUACAGGCGUACACCACCAUGCCCGGCUAAUUUUUUGUAUUUUUAGUAGAAACAGGGUUUCACCAUGUUAGCCAGGCUGGUCUCGAAUGCUGACAUCAGUUGAUCUGCCUGCCUUGGCCUCCCAAAGUGCCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCACUGUGCCUGGCCAACAUUGGAUUUUUCAGUUGUAUUACCAGUUUUAUGUUCAAAACUCCUUUAAGAGGUUCUAUUUUUAUGCAUUGUCUUUACUUAACCCAAUCUCUUCAUUUAUAAAUAUGUAAAUAUUAUGUAUUUAGAAAAUAUAUAAUGGUAAAGUUUGAAAGGAUGCCUGAGUAACCAAGAACAGUGGUUUCCUGGGGUGGAAGGAGGGCAACAUCGGAAUAGACAAAUGGGAACAAGGGUAUGAGUGAAGCUUUUCACUAUAUAAUCAUUUAUAAAAUGGACAGAUUGAUCGGCUGACACUAAAGUUCUUUUCAGUGUUCUAAUCCUAUGAAUCAUGUCUAGAAUAUUUAAACUAUUGAUAAAAGACCAGCAUCUACAAAAUUUUUAAGUUUUCUUAUUAUUGUUGGUUAAUUUCAUCUCCAGAAUUUAGUUAUUAGUUUUGUUCAGAAACAUUAUUUAAAUAAAUCAGCCUCAGUGCUAUGGUGCGUAUGAAUUAAGCCAUACUAAAGGUACACAUCCAAAAUAAAGAAACAAGUCAGAAGCCCCCAAGGAAUAUAUUGGCCAAGUGUAUUAGACUAUUAUUUUAGCUAAUCAAACACAUUAGGAAAGCCUACUGUAAGAAAUGAAAUUAAAGAUCAGAUAUUGCUUUCGAUAACCUUUUACUUUAGUAUUCUCAGCAAUGUUGGUAAAUAUUUAUUAGCUGAUAAAUUAUGUGGCAAAUGUUCUACAAAAAUUAGUUAAAUCGGAUUAUGUGUGUGGAGAAAGAUUGGCAUUAAAAGUACAUUAGGUUGUCCUUUUAGGAUAAGUCUAUUGAGCAUUUCUUUUUCUGGUUAUUAUAUUGAUAAUUUGAAUAACAGAAAGUAAUUUUUUUGGUCGUGCAUGGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUUGGAGGCCUAGUUGGGUGGAUCAUCUGAAGUCGAGAGUUCGGGACCAGCCUGACCAACAUGGAGAAACCCCAUCUCUACUAAAAAUACAAAAUUAGCCGGGCGUGGUGGCACAUGCCUGUAAUGCCAGCUACUCAGGAGGCUGAGGCAAGAGAAUCGCUUGAACCCAGGAGGCAGAGGUUGCGGUGAGGCGAGAUUGUGCCAUUGCACUCCAGCCUGGGCAUCAAGAGCGAAACUCUGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAUUUUUUUUUAUUGAAGUAUAAUUUAUACCUGAAGUUCACUCAAUUUAAGUGAACAAUUCAGUUAUUUUUUUUGCAAAUGUACACACUUGUGCAAUGGUUACCAGUUUAAUUUUAGAACAUAUAUAUACCCUAAAAAGAAACCAUGUACCCAUUCAUAGUUACUCUUUGUAUCAUUAGUUUACCAUACCUAAUUAUGUAUGUAACUUUGUAUAACUGACUAUAAAAUAUGAUAAAAGUAAGUACUAUGCAAUUUCCAGAAUUAUUCAGCCUUCUAGGUUUGUUUUGAAGACUUGGUAAUUUUGAACAUGGACAUUUUCUUUGAUGAUAUUUUUUAUUUGGACACCAAAAUUAUUUAAUAGAAGCAAGAGUGGUGAGAAUAAUUUGAGUACGAGGGGAUUGCUUUUGGGAAAUGAGAAUUUUAAAAUUUCCUUCUUGUUUGGAGUUUACAAAUGAAUUCAUGAACAGAAGAACGUCAUUGAAUGUAAAAUUAGAAAUUUAUGUAAAGAUUUCAGUUCAAAUAAUUUAGUAGGGAAAUUUAUGAAGUCAUUCGGAUAAGACAAAGAUUUUAUAUAAUAUUUUGAAAACAUUAAAUAAUUUGUCAUUCCUUUAUUUCCUUUAUUUUAGCUUCGCAGAAUCAAGAACGGCUAUGUGCGUUUAAAGAUCCGUAUCAGCAAGACCUUGGGAUAGGUGAGAGUAGAAUCUCUCAUGAAAAUGGGACAAUAUUAUGCUCGAAAGGUAGCACCUGCUAUGGCCUUUGGGAGAAAUCAAAAGGGGACAUAAAUCUUGUAAAACAAGGAUGUUGGUCUCACAUUGGAGAUCCCCAAGAGUGUCACUAUGAAGAAUGUGUAGUAACUACCACUCCUCCCUCAAUUCAGAAUGGAACAUACCGUUUCUGCUGUUGUAGCACAGAUUUAUGUAAUGUCAACUUUACUGAGAAUUUUCCACCUCCUGACACAACACCACUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-883.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -938.21
Frequency: 0.0000
Diversity: 783.43
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((((.(.((.((..(((.(((.(((.((((......((.(((.((((((..(((((((.((.....)).)).)))))))))))))))))))))))))).)))))))...).)))).))))(((((((((.....(((.((((((.((((((.((.....)).)))))).)))))).)))....((((((((((.....((((.........)))).....................((((....(((((((((((..(((.....(((((.((....)).))))).....)))...((((((.(((.((((((((((((((((((((.(((((((((..((((((..(((((((((((((((((((((((..(((((((((((((...(((((..((((((.(((((((((((((((((((((((((.(((((((.(((((((((((...((((((((((((((((((((..(((((((((((((((....(((((((.(((((((.(.((((((((((((((((.(((((.((((.(((((((((((.((.(((((((.(((((((.(((((((((((((((((((((((((((.(((((((........(((((.(((((((((..(((((.((((((....(((......)))..((((((((.(((..((((((((.(((.((((.........(((((((....)))))))(((((((((((...))))))))))).............((((.(((...((........))...))).)))).))))..)))))))))))))).)))))))).((((((........((((.((((((....))))))))))..))))))......((((((((((.((.((..((((((.(((....))).)))))).....)).)).)))).))))))))))))..)))))..))))....((((((((.............((((....))))....))))))))((((((((.(((((..((((((.....((((.(((((....((((((...........(((......)))))))))....))))).))))...))))))((.......))..........................((((........))))....(((((((((.(((......))))))))...))))..((((....)))))))...)).))))))))....((((.((((((((...((((..((........))))))...)))))))))))).........(((((((((...((.(((((........))))).))))))))))).((((((((((((((((((((((((...((.((((........(((((((((((...))))))).))))))))))...)))))))))).....)))))..)))))))))))))).)))))........))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))).)).))))))))))).)))).))).)).)))))))))))))))).).))))))).)))))))....)))))))))))))))))))))))))))))))))))...))))))))))).))))))).)))))).))))))))))))))))))).))))))..)))))...)))))))))))))..)))))))))))))))))))))))..))))))..))))))))).)))))))))))))).....(((((((((......)))))))))...(((((.......(((.((((((((((((.......)))))))..))))).)))............((((((....))))))((((.(((..((((..((((((..............))))))..))))...))).))))..(((((((....(((((.((..((((...(((((........))))).)))).))))))).)))))))(((((((.((.((((.((((.(((((....(((.(((((((((.((.((((............)))).)).)))))))))))))))))..)))).)))).)).)))))))((((((((((.......((((((..(((((((((..(((.(.(((....))).).))).......)))))))))..))))))...............(((((.((((.(((((((....)))))))..))))))))).((((......)))).......(((((((......))))))).))))))))))......((((((((....(((....)))(((...((((((...((((...................))))...))))))..)))...)))))))).......))))))))))).))).)))))).....)))))))))))...))))..))))).)).))))))))))))(((((.....((((((....))))))........))))).(((((((((....)))...))))))((((((..(((((((..(((((....(((((...))))).....((((..(((.((((......))))..)))..)))).((.((.((.((((...)))))).)).)).((((((.((((((((......))).)))))..)))).)).(((......))).)))))..))))..)))...))))))..))))(((...........)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((((((({.,.{{.,(,,(((.{((,(((,{(((......{{.{{{.((((((..(((((((.((.....}}.)).))))))))))))))}}}))))))})).))}}}|},,.|,}}}}.}}}}|,.{{{{(,,{,,{{{.,{{{{{{{|||,,,,,|||,{{{{..{({({{{{.{{{{..,{|..(((({...,,...})))),......,.{|||{{{{,{{...,,.{((({.{((((.({{{{((,{(((({{...{{(.....(((((.({....)),})})}.....|}}...{{{,,,.,,,,((((.(((((((((((((((.(((((((((..((((((..(((((((((((((((((((((((..(((((((((((((...(((((..((((((.(((((((((((((((((((((((((.(((((((.(((((((((((...(((((((((((((((((({,,{(((((((((((((((....(((((((.(((((((.(.((((((((((((((((.(((((.((((.(((((((((({.((.(((((((.(((((({,(((((((((((((((((((((((((((.(((((((.,,,,((,{{,(({(({{{,,,{{{(((((,,{{{{{|},}||((({,,.|||{{({{(((({,(((,,(((((({(,((,.,{{(,{{{{.{{{(((((((,,,.|}||},{(((((((((({...}))))))))))},.,,,,,,|.,.,{{({((({..({..{{{....,..||}||||||.}}}}..,))))))})),)}},}}}}}}))....||}..,}..}}||||.{{|{||,.,,)))))),}}}|.,,,,}}}},...||||{|||||,{{.((,,((((((.(({....})).))))}},....}}.}}.})}).))}}))|||||},.|||||..{{{{....((((((((.....,{{{{,...,||}}},,,,,....)))))))),,{{|{|{,,,,{||||||||,||.,||||||||,..}}}}}},,}}}},,,,,..,}||||,.,|||,,|||||}}|||,|,,,..,}})})}}},,}})|{{,{,,|{...............,||,,...,{,{,,,,}......))))}...{(({(((((.(((......))))))))...}}||,.((((....)))).}},..,,.,||||||,....{{{,{((((((((...(({{..{{........})}}})...)))))))))))).,,,}},,.||||||||{...||.{((({,,,...,{|||||.,,}}|||||,,...,))}}},,}}))}}||||,{{{,},||,|,,,.,{|.{{.((({(((((((...))))))).)))),)),)).,.}}}}||||}||{{{{{,.|,}})}})}),,)))}}},))}}}...,,,..))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))).)).})))))))))).)))).))).}).)))))))))))))))).).))))))).)))))))....)))))))))))))))))))))))))))))))))))...))))))))))).))))))).))))))}})))))))))))))))))).))))))..)))))...)))))))))))))..)))))))))))))))))))))))..))))))..))))))))).))))))))))))))}.}}}}|{(((((({{....}))))))))......(((,{,...|||.((((((((((((.......)))))))..))))).}}}...,..}}}...,(((({....}))))|((((.(((..((((..((((((..............))))))..))))...))).)))),,(((((((,..,(({(({{{..((((,{,(((((........)))))})))).,)))))}.})))))}{{(((((.{|.{(((.,{{{.(((((....{{,((((((((((.((.((((.,,,.....,,.)))).)).))))))))))))))))),,}}},.)))}.}).)))))}}...{((((...))))}..}}}}))}.})))},})}.}))))}}))}.,}...}}})))}.))),...{{{...((((((((((.{{({{{((((((((((((((((({(((((((....})))))).|)))))},,}...,|,|{{{{||}}..,,,,.(((((((......))))))),})),,,,,,},,,}},}))))))))).}}}}}}..,,,(((...((((((...{(((...................)))),..))))))..))),))))))))).......}))}))),))))}))).))))))}..{{{{{..,...,}..})))}.,}}}},})))))))}}})||{{((({,....,||||||....}}|||},,...,..))))).{{{((((((....))),..})))}|{(({({..{{,,{,{{{((({{..{((((({...}}}))}}},,,{{(||(.,.,,,)},,})}))},|{|||,.||||,{,.{,.,{,||||,..}}}})),)).}},|,{{{{.((((((((......)))}}}))).,|}}}.,},}||},,,,.}||.|,}}}..},}}..}})},.,,}})}..))))|||...........)))
Back