Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BMPR2_0006600
Sequence Length
2790 nt
GC Content
0.4473
CUUCGCAGAAUCAAGAACGGCUAUGUGCGUUUAAAGAUCCGUAUCAGCAAGACCUUGGGAUAGGUGAGAGUAGAAUCUCUCAUGAAAAUGGGACAAUAUUAUGCUCGAAAGGUAGCACCUGCUAUGGCCUUUGGGAGAAAUCAAAAGGGGACAUAAAUCUUGUAAAACAAGGAUGUUGGUCUCACAUUGGAGAUCCCCAAGAGUGUCACUAUGAAGAAUGUGUAGUAACUACCACUCCUCCCUCAAUUCAGAAUGGAACAUACCGUUUCUGCUGUUGUAGCACAGAUUUAUGUAAUGUCAACUUUACUGAGAAUUUUCCACCUCCUGACACAACACCACUCAGUCCACCUCAUUCAUUUAACCGAGAUGAGACAAUAAUCAUUGCUUUGGCAUCAGUCUCUGUAUUAGCUGUUUUGAUAGUUGCCUUAUGCUUUGGAUACAGAAUGUUGACAGGAGACCGUAAACAAGGUCUUCACAGUAUGAACAUGAUGGAGGCAGCAGCAUCCGAACCCUCUCUUGAUCUAGAUAAUCUGAAACUGUUGGAGCUGAUUGGCCGAGGUCGAUAUGGAGCAGUAUAUAAAGGCUCCUUGGAUGAGCGUCCAGUUGCUGUAAAAGUGUUUUCCUUUGCAAACCGUCAGAAUUUUAUCAACGAAAAGAACAUUUACAGAGUGCCUUUGAUGGAACAUGACAACAUUGCCCGCUUUAUAGUUGGAGAUGAGAGAGUCACUGCAGAUGGACGCAUGGAAUAUUUGCUUGUGAUGGAGUACUAUCCCAAUGGAUCUUUAUGCAAGUAUUUAAGUCUCCACACAAGUGACUGGGUAAGCUCUUGCCGUCUUGCUCAUUCUGUUACUAGAGGACUGGCUUAUCUUCACACAGAAUUACCACGAGGAGAUCAUUAUAAACCUGCAAUUUCCCAUCGAGAUUUAAACAGCAGAAAUGUCCUAGUGAAAAAUGAUGGAACCUGUGUUAUUAGUGACUUUGGACUGUCCAUGAGGCUGACUGGAAAUAGACUGGUGCGCCCAGGGGAGGAAGAUAAUGCAGCCAUAAGCGAGGUUGGCACUAUCAGAUAUAUGGCACCAGAAGUGCUAGAAGGAGCUGUGAACUUGAGGGACUGUGAAUCAGCUUUGAAACAAGUAGACAUGUAUGCUCUUGGACUAAUCUAUUGGGAGAUAUUUAUGAGAUGUACAGACCUCUUCCCAGGGGAAUCCGUACCAGAGUACCAGAUGGCUUUUCAGACAGAGGUUGGAAACCAUCCCACUUUUGAGGAUAUGCAGGUUCUCGUGUCUAGGGAAAAACAGAGACCCAAGUUCCCAGAAGCCUGGAAAGAAAAUAGCCUGGCAGUGAGGUCACUCAAGGAGACAAUCGAAGACUGUUGGGACCAGGAUGCAGAGGCUCGGCUUACUGCACAGUGUGCUGAGGAAAGGAUGGCUGAACUUAUGAUGAUUUGGGAAAGAAACAAAUCUGUGAGCCCAACAGUCAAUCCAAUGUCUACUGCUAUGCAGAAUGAACGCAACCUGUCACAUAAUAGGCGUGUGCCAAAAAUUGGUCCUUAUCCAGAUUAUUCUUCCUCCUCAUACAUUGAAGACUCUAUCCAUCAUACUGACAGCAUCGUGAAGAAUAUUUCCUCUGAGCAUUCUAUGUCCAGCACACCUUUGACUAUAGGGGAAAAAAACCGAAAUUCAAUUAACUAUGAACGACAGCAAGCACAAGCUCGAAUCCCCAGCCCUGAAACAAGUGUCACCAGCCUCUCCACCAACACAACAACCACAAACACCACAGGACUCACGCCAAGUACUGGCAUGACUACUAUAUCUGAGAUGCCAUACCCAGAUGAAACAAAUCUGCAUACCACAAAUGUUGCACAGUCAAUUGGGCCAACCCCUGUCUGCUUACAGCUGACAGAAGAAGACUUGGAAACCAACAAGCUAGACCCAAAAGAAGUUGAUAAGAACCUCAAGGAAAGCUCUGAUGAGAAUCUCAUGGAGCACUCUCUUAAACAGUUCAGUGGCCCAGACCCACUGAGCAGUACUAGUUCUAGCUUGCUUUACCCACUCAUAAAACUUGCAGUAGAAGCAACUGGACAGCAGGACUUCACACAGACUGCAAAUGGCCAAGCAUGUUUGAUUCCUGAUGUUCUGCCUACUCAGAUCUAUCCUCUCCCCAAGCAGCAGAACCUUCCCAAGAGACCUACUAGUUUGCCUUUGAACACCAAAAAUUCAACAAAAGAGCCCCGGCUAAAAUUUGGCAGCAAGCACAAAUCAAACUUGAAACAAGUCGAAACUGGAGUUGCCAAGAUGAAUACAAUCAAUGCAGCAGAACCUCAUGUGGUGACAGUCACCAUGAAUGGUGUGGCAGGUAGAAACCACAGUGUUAACUCCCAUGCUGCCACAACCCAAUAUGCCAAUGGGACAGUACUAUCUGGCCAAACAACCAACAUAGUGACACAUAGGGCCCAAGAAAUGUUGCAGAAUCAGUUUAUUGGUGAGGACACCCGGCUGAAUAUUAAUUCCAGUCCUGAUGAGCAUGAGCCUUUACUGAGACGAGAGCAACAAGCUGGCCAUGAUGAAGGUGUUCUGGAUCGUCUUGUGGACAGGAGGGAACGGCCACUAGAAGGUGGCCGAACUAAUUCCAAUAACAACAACAGCAAUCCAUGUUCAGAACAAGAUGUUCUUGCACAGGGUGUUCCAAGCACAGCAGCAGAUCCUGGGCCAUCAAAGCCCAGAAGAGCACAGAGGCCUAAUUCUCUGGAUCUUUCAGCCACAAAUGUCCUGGAUGGCAGCAGUAUACAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-767.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -820.75
Frequency: 0.0000
Diversity: 639.15
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((...(((.((.(((....((((.(((.((((((((.((((..(((....))).)))).)((((((......))))))...................(((((.(((((((((....)))...))))))(((((.........((((((((...((((((...)))))))))))((((((......)))))))))..(((((..((((((.......))))))......))))))))))........((((((......))))))((((((((((.((..((((((..((((........))))...))))))....(((((((.(((((.((...((((..(((((...(((((...(((.(((((........)))))((((..((.((.(((((.(((...((((((((.(((((((.....((((..(((((.((((((((.(.((((((((........))((((((((((((((....(((((((....((((.(((((......((..(((.......))).)).....)))))))))((((((....))))))..(((((...........)))))(((((((((.(.((((((.((((...(((((((((...........((((...(((((((((.....((..(((((...))))).)))))))))))..))))..((((.((.(((....))).)).)))).))))).)))))))).(((.((((((........(((((((.(((((.(((((((....)))).................)))))))))))))))(((..(((((....))))))))(((((((((((((.....(((((((.((.((((((((..........(((....(((.((((((..(((..(((..((((.((((...((((....(((....))).....))))...))))))))..))))))..)))))))))))).(((((...((((((..((((...((..(((((((((((..(((((((.((((.(((((((........)))).))).)))).......((((((.....))))))........(((..(((((((((.(((.....)))))))....)))))..)))(((((((((.((((...((((......)))).)))).))).))))))....)))))))..)))....))))))))..))))))..))))))...)))))((((.(((.....))).)))).)))))))).)).)))))))(.((((..(......)..)))).)......((((....)))).............((((((((((....)))....(((((...((.((((((((((.......(((((((((...)))).)))))((((.(.((......)).)..))))..(((((...((((((.........)))))).)))))))))))))))..))...)))))))))))).)))))))))..))))(((((......))))))))))))))..)))))).)))))))))).....(((((.............))))))))))))..))))))).........)))))))...)))))).).)))))))).)))))))))..(((........)))((.......))..........))))))).)).))))))........(((((..((..(((..(((.((..(((((...((((((((.((((((...(((................((.(....)))..(((.((((((..(..........)..))))))))).(((((.......))))).............(((((((.....(((((((.....(((((.(((...))).)))))..(((...((((....(((((((((((..((....((.(((......))).))..))...(((((.(((((...))))))))))..((((((..((.(((((((((.......))))))))).))....(((((.(((.((((.........(((....(((.(((((..(((...(((((.(((((..(((.(((..((((.....))..))..))).))).))))).))))))))))))))))...))).........))))))))))))......))))))....))))))))...)))....))))...)))........(((....)))......(((((((((((((.......(((((...)))))..........(((((...(((.......)))...)))))...(((...((((((((...))))))))...)))((((..........)))).)))))........))))))))...((((.........))))....((((((.(((........)))..))))))........)))))))....)).))))).....)))..)))))).))).....))))).)))))..)).)))..)))..))...)))))...))).)))))..))))...)))))))....))))))))))..))))...)).)))))..)))))))...((((((((....))))))))......................((((.(((.(((.(((((((...))))).)).))))))))))....))))))))))))...((((((.......))))))..)))))((((((......))))))))))))).)))))))..))).)).))).)).).))(......)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.,((...(((.((.(((....((((.(((.((((((((,{,{{..{,..,,{|,}.,,,),||(((((......)))))}|....,||||......,..|||||.,{{{(((((....))),,,||||||(((((....,....(((((({,..,((((({...}))))))),,,,|||||......))}}))))),.{((((|,{{{{{,......,,||||}..},,,)))))}))))........{(((((......)))))|((((((((((.((..,,,{{{..((((........)))).,,}},},,,.,.(((((((.(((((.((...((((..(((((((,((((....(({.(((((........))))}((((,.({.((.(((((.(({...((((((((.(((((((.....(((,.{(((((.((((((((.{.{(((((((........))|||||,((((((((....(((((((,...((((.(((((.,....{{..{{{.......})).))....,))))))))){(((((....)))))}..(((((..,........))))){((((((((.(.((((((,(((({{,,((({{{{,.,{{{,,....{{{{...,{{{,{{{,.,,,,||,,|||||,,,),}},.|}}}}}})),}..||||..(((({((.(((....,||{||{{|||{{..{(({,{{{{{{{,,((,(({.{{,....{((((((((.(((((.(((((((....)))}........,,,.,....))))))))))))))))},,.(((((....})))).})||}}}},,|||}|....,|{{||||.,|}||||||||...........((({(((,..,,,,,...,(((((((.,{((({{(({,,,{{{,....{{{....}}|{,..||}|,...||||}}|,,,},}|}}|,},,)}))},,)}.(((((...((((((,.((((...((..(((((((((((..(((((((.((((.(((((((........)))),})).)))).......((((((.....))))))..,{{{{{(((..(((((((((.(((.....)))))))....)))))..))),{,{{||||}|(({...,(((...,|,},||,|}}}.}))})))}},..,,)))))))..)))....))))))))..)))))).,))))))...))))),(({,((,..,,,}}),}}}},))})))}}}))})))))))}}}{{{.{({.....,..,,,)}}..,,|,((((....)))).........,}}..)))||||,,}}},})},.,.(((((...((.((((((((((..{{...{{({{{{{(,,,||}}.|}}}}{{|||,,||,,,...}).},.})))..(((((...((((((.........)))))),)))))))))))))))..))...))))).||||...))))..,|.{(((,.(((((......))))).))))},},..)))))).)))))))))}.....||,,|,||.{{{.....})),)})))))))..))))))))........}}}|,|,...,})))).).)))))))).))))))))}..{{{,,,.....}}||,.......}}.....,},..))))))).)).))))))..,..,,.(((((..((..(((..(((.{{..(((((...((((((((.((((((...,,,................{{..,,,.|||,.{{{.||||{|,,,..........|..}}}}}}}}}.(((((.......))))),,........,,,{((((((.....(((((((.....(((((.(((...))).)))))..{,{...((((....||{((((((((........((.(((......))).)).,||,..(((((.(((((...))))))))))..||{{{{..{{.(((((((((.......))))))))).}}....(((((.(({{((((.........{{{...,{{(.(((((..(((...(((((.(((((..(((.(((..((((.....)}..})..))).))).))))).))))))))))))))))...}}}.........))))))))))))......}})))}....))))))))...|||....,}}}...}))........{{(,,.,||}....,{(((((((,.|{,{...,,..(((((...))))).,,...,|,.{((({,,.(((.......)))...}}}}}...{((...,(((((((...)))))))}...))|((((|{{,,....,}},,.||},}.,,,....}})))))),..{{{,....,,,..})))...{((((((.(((........)))..)))))},}......)))))))....))}})))}.....))}..)))))).))).....))))).)))))..}}.)))..)))..))...)))))...})).))))).,}}))...,}))}))..})))))}}))))..))))...)).)))))..)))))))}..((((((((....))))))))......................{((,{(((.(((.(((((({...}))))},).)))))))))}....))))))))))))}..((((((.......))))))..}}}},,{(((|......})))))))))))).)))))))..))).)).))).}}.),))(......)
Back