Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_BMPR2_0008800

Sequence Length

1086 nt

GC Content

0.4328

AAUGGAACAUACCGUUUCUGCUGUUGUAGCACAGAUUUAUGUAAUGUCAACUUUACUGAGAAUUUUCCACCUCCUGACACAACACCACUCAGUCCACCUCAUUCAUUUAACCGAGAUGAGACAAUAAUCAUUGCUUUGGCAUCAGUCUCUGUAUUAGCUGUUUUGAUAGUUGCCUUAUGCUUUGGAUACAGAAUGUUGACAGGAGACCGUAAACAAGGUCUUCACAGUAUGAACAUGAUGGAGGCAGCAGCAUCCGAACCCUCUCUUGAUCUAGAUAAUCUGAAACUGUUGGAGCUGAUUGGCCGAGGUCGAUAUGGAGCAGUAUAUAAAGGCUCCUUGGAUGAGCGUCCAGUUGCUGUAAAAGUGUUUUCCUUUGCAAACCGUCAGAAUUUUAUCAACGAAAAGAACAUUUACAGAGUGCCUUUGAUGGAACAUGACAACAUUGCCCGCUUUAUAGUUGGAGAUGAGAGAGUCACUGCAGAUGGACGCAUGGAAUAUUUGCUUGUGAUGGAGUACUAUCCCAAUGGAUCUUUAUGCAAGUAUUUAAGUCUCCACACAAGUGACUGGGUAAGCUCUUGCCGUCUUGCUCAUUCUGUUACUAGAGGACUGGCUUAUCUUCACACAGAAUUACCACGAGGAGAUCAUUAUAAACCUGCAAUUUCCCAUCGAGAUUUAAACAGCAGAAAUGUCCUAGUGAAAAAUGAUGGAACCUGUGUUAUUAGUGACUUUGGACUGUCCAUGAGGCUGACUGGAAAUAGACUGGUGCGCCCAGGGGAGGAAGAUAAUGCAGCCAUAAGCGAGGUUGGCACUAUCAGAUAUAUGGCACCAGAAGUGCUAGAAGGAGCUGUGAACUUGAGGGACUGUGAAUCAGCUUUGAAACAAGUAGACAUGUAUGCUCUUGGACUAAUCUAUUGGGAGAUAUUUAUGAGAUGUACAGACCUCUUCCCAGGGGAAUCCGUACCAGAGUACCAGAUGGCUUUUCAGACAGAGGUUGGAAACCAUCCCACUUUUGAGGAUAUGCAGGUUCUCGUGUCUAGGGAAAAACAGAGACCCAAGUUCCCAGAAGCCUGGAAAGAAAAUAGCCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-291.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -308.85

Frequency: 0.0000

Diversity: 350.30

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((......)))))(..((((((..((((..((((..(((............((((((...........................))))))....(((((((........)).))))))))..))))..))))((((.....((((((((..(((((((....))))))).......((((((((((............(((((((........)))))))((((.((((.((.((((((((.(((..(((((((........(((((((...(((((.(...(....)...).)))))....)))))))...(((((...........)))))))))))).(((((((.((((......(((((((((...........((((...(((((((((.....((..(((((...))))).)))))))))))..))))..((((.((.(((....))).)).)))).))))).)))))))).))))))).........(((((((((.(((((.(((((((....)))).................)))))))))))))))))........)))))).))))).)).)))).)))).....(((((((.((.((((((((..........(((....(((.((((((..(((..(((..((((.((((...((((....(((....))).....))))...))))))))..))))))..)))))))))))).(((((...((((((..((((...((..(((((((((((..(((((((.((((.(((((((........)))).))).)))).......((((((.....))))))........(((..(((((((((.(((.....)))))))....)))))..)))(((((((((.((((...((((......)))).)))).))).))))))....)))))))..)))....))))))))..))))))..))))))...)))))((((.(((.....))).)))).)))))))).)).)))))))))))))))))....))))))))))))....((((....))))......))))))..)

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((......)))))(..((((((..,{{(..{{{{..{({..,{,{,.....{{{(((..............,},..........}))})}....(((((((........)))})))),}|..,}}}..}}||{(((,....((((((((..{{(((((...,||}||}|{,.....((((({,{{({,,{{{,,,{{.(((((((........))))))).{{{,,{,|.|||{,{{{{(({||{{{{,((({{....,,{{,.{{{..,,...||}.},..,.,}})))})})||{{||,,,,))})}}..(((((..,.....,..))))),||,,,,.(((((((.,((({{{,,.{({{,{{{|.,,,|||....((((...((((((((,....,((..(((({...))))).)))))))))))..))))..{{{{.{(.(((....))).)).)))).}}}}},}}}})))}.)))))))...,,,{{,{((((((({,(((((.,{{(({{....))}}}}}}}}}})})}},,}.,))))))))}},}))})}}|{{{{{||,.}},}})}),)),)))}|}})}..,,.((((({,.{|.{{|||||{.,,,},....,{,|||||||.||,|||..,{{||{((..{({{,{{{|,,.||,,.,,,|||,...}||{{.,{|,|,..,|||||}|,..}}})))},),})}))),,)}.{((((...((((((,.((((...((..(((((((((((..(((((((.((((.(((((((........)))),})).)))).......((((((.....))))))..,{{{{{(((..(((((((((.(((.....)))))))....)))))..))),{,,,||||}|(({...,(((...,|,},||,}}}}.}))})))}},..,,)))))))..)))....))))))))..)))))).,))))))...))))},(({,(({..,,,})),}}}},})})))}},)).)))))))))}}}}}}}}....)))))))))}}}.,|,((((....))))......})))))..)