Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BMPR2_0010300
Sequence Length
858 nt
GC Content
0.4289
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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-222.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -239.34
Frequency: 0.0000
Diversity: 303.48
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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