Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BMPR2_0011800
Sequence Length
1602 nt
GC Content
0.4488
GGAUCUUUAUGCAAGUAUUUAAGUCUCCACAAAAGUGACUACAGGCGCAUGCCACCACGCCCAGCUAAUUUUUGUAUUUCUAGUAGAGAUGGGGUUUUACUGUGUUGGCCAGGCUGGUCUCAAACUCCUGACCUCGUGAUCCACCCGCCUCAGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACCACGCCCGGCCUCAGUUAUUUUAUCUUUAGCUGGAAACUCUCUUGUAUAUUCACUGGGCUUUCCUCUCUCUGAAUUUCUCCUUUCUAGGGUUCUCCCCUCAUUUUCUAGCAACUGUGGCUGUCCAAAAUAUGUCCUGAGUUUCCCAAGGCCAGAACAAUUUUCUGUUCUUCUUUUUUCUUUUUUUUUUUUUUGAGACGGAGUCUCACUCGGUCACCCAGUCUGGAGUGCAGUGGCGCGACCUCGGCUCACUGCAAGCUCUGCCUCCCAGGUUCACGCCAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCUGAGUAAGUGGGACUACAGGCGCCCACCACCACGCCUGACUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGUAUUUUUUUAGUAGAGAUGGGGUUUUACCGUGUUAGCCAGGAUGGUCUCGAUCUCCUGACCUCAUGAUCCACCCACCUCAGCCUCCCAAAGGGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACCGCGCCUGGCCUCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUAAUUGAGACAGUCUUGCUCUUUCGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCGCGGUCUCAGCUCACUGCAACCUCCGUUUCCUGGGUUCAAGUGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCUGAGUAGCUAGGAUUACAGGCGUGUGCCAUGAUACCCGGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACAGGGUUUCACCACUUUGGCCAGGCUGGUCUCGAACUCCUGACCUCAAGUGAUCUGCCCACCUCAGCCUCCCAAAGUGCUGAGAUUACAGGCAUGAGCCACCACACCCAGCCUAGAAUGGUUUUCUUUAGCAAUUUUAGUUCCACUGCACAGUGCUGAUUUCAGCCUGCCCUCAGGAUAAAAGUCAUAAAAAUGGGUAGCUUGCCCCAUACCACUUUUUUCUCAAAGCUUUAAUGCCUCUCAAGAUCUAUCUGCCUUUAGAUCUUUCUUUUUUUUAAAUUUUGUCCAGCAUUUAUAAAUGUUCUCUAUGGGCAGGCUGGGUCUGGUAGGAGCUUCAUCAGCCAUACUAGAACAGAAUUUAUUAAUUUCUUGAUAAUGGAAUAAACUGUAAGCAACAGAGAGCUGUAGCAUUCUGUUUAAAUUUGUACUUUAUUAUUUAGUAAAUUUGAUUGUUCAAUUGUGAUAUUAAUACCUUGCUUUCUUUAAAACACUUGCAGCUGAUUGGCCGAGGUCGAUAUGGAGCAGUAUAUAAAGGCUCCUUGGAUGAGCGUCCAGUUGCUGUAAAAGUGUUUUCCUUUGCAAACCGUCAGAAUUUUAUCAACGAAAAGAACAUUUACAGAGUGCCUUUGAUGGAACAUGACAACAUUGCCCGCUUUAUAGUUGGAGAUGAGAGAGUCACUGCAGAUGGACGCAUGGAAUAUUUGCUUGUGAUGGAGUACUAUCCCAAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-476.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -503.31
Frequency: 0.0000
Diversity: 439.78
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((((((((((..((.(((((...(((((((...(((....))).....((((((..(((....(..(((((((((((((((((((...((((....((((.(((((((((((......((.(((.(((((((........((((((.....)).))))))))))))))))))))..)))).))).)))).)))).))))))))))).))))))))..)........)))..))))))....(((((((((((........))).((((.....))))((((((.(((((((((..(((((((((.....((((((...((((..((((.((((((......)))))).........................(((.((((...)))).))).....))))))))..))).))).((((((((((((((((((((((((((((....((((((((((....(((((((((((....)))))...))))))...((((((..........))))))........................(((((((.....)))))))((((.....((((.....(((((.(((....))))))))....))))....))))..((((((((......))))))))......)))))))))).....((((((((................................((((.(((...))).))))(((((((.(((((((((((((.((.......))))))))))..)))))...)))))))....((((..(.((((.(((((....)))))..(((((((.((((((.((..(((.........)))..)).)))))).))))))).....)))))..))))......)))))))).((((..........))))....(((.......)))((((((((.....)).)))))).....))))).)))((((((.((((((((((((((.(((......))).)))))))....(((....)))((((....))))((((((...((((((((....((((((((((........))))).................((......)).....((((((((........))))))))......)))))..))))))))((((((....))))))......))))))))))))).)))).)).(((.....)))((((...(((((((((((((((.......(((((((((....((.......(((((((.((....)).))))))).......))..)))))))))))))))))))...)))))...))))............................))))))).)))...))))))))))....(((((...........))))))))))).)))...)))))))))..)))))).........((((...((((...(((((((((.....((..(((((...))))).)))))))))))..))))....))))(((((....)).)))))).))))))))))))...).)))).))...)))))))))).....))))))....))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,{((((((((((((((((..((.(((({...(((((((...(((....))).....((((((..(({....(..(((((((((((((((((((...((((....((((.((((((({{{{..,.{.((.{{{.(((((((........((((((.....)).))))))))))))))})})))..)))).))).)))).)))).))))))))))),})))))))..}........}}}..))))))....{(((((({{{,..,,,,,.,}}.{(((....,))}}{{{{((.(((((((((.,(((((((({....,(,((((,{.,,,,.,{({{,((((((......)))))).......................||(((.(((|.,,)))),)}}..,{,|,,|||||{{{||{|||,(({{{,||||{||||||{{{||||{{{,..,,(((.((((((....(((((((((((....)))))...)}))))...((((((,.......,,||||||....................,,{.(({{.....}}})}))}||(({{.....{(((...{.(((((.(((....}}})))))....))})....,}}}..((((((((......))))))))....||||||||......,)))))))...................................|||||{||,,}))),,,,,(((((((.(((((((((((((.((.......))})))))))..)))))...)))))))....((((((((.(((,{((((....))))))))..)))))))).)))))).))).}}..,,,,|||{{{,,.,{{{,.{{{|||,{{{{{{{((({{{{{.(((({{((..{((((((({..,....|,.)))}....(((.......}}},,||||||.}}}}))}),))))|,,,,,(((|,|||||{(((.(((((((({,{,,,}||{....,,|||,,,,,|||{...}}}}...,,))|||,...||||((((((...((((((((.....((({({((({,...,},))}},.................((......)).....((((((((........))))))))....,})},,,..))))))))((((((....)))))}......))))))))))))).)))).}),}|}}}},,}))),,,,,,||{{((((((((((({......{{{{{{{{{,{{{{,,,{,,,,{((((((.((....)).)))))))|,.,||,}},.}}}}}}}}}}))))))))},,.}))))...||}}}|......}}}})),}}}}},}}}}|,,||))))).,)}|||)))),)))|,....(((((..,........)))))}))))).}))..,)))))))))..}})))).........{{{{...((((...(((((((({....,{{..((({{...))))).)})))))))))..))))....}))}{,{{{....))),))))).))))))))))))...}.)))).)).,.)))))))))).,,.,)))))}..}}|}},..,,
Back