Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_BMPR2_0012200

Sequence Length

2245 nt

GC Content

0.4539

CUGAUUGGCCGAGGUCGAUAUGGAGCAGUAUAUAAAGGCUCCUUGGAUGAGCGUCCAGUUGCUGUAAAAGUGUUUUCCUUUGCAAACCGUCAGAAUUUUAUCAACGAAAAGAACAUUUACAGAGUGCCUUUGAUGGAACAUGACAACAUUGCCCGCUUUAUAGUUGGAGAUGAGAGAGUCACUGCAGAUGGACGCAUGGAAUAUUUGCUUGUGAUGGAGUACUAUCCCAAUGGAUCUUUAUGCAAGUAUUUAAGUCUCCACACAAGUGACUGGGUAAGCUCUUGCCGUCUUGCUCAUUCUGUUACUAGAGGACUGGCUUAUCUUCACACAGAAUUACCACGAGGAGAUCAUUAUAAACCUGCAAUUUCCCAUCGAGAUUUAAACAGCAGAAAUGUCCUAGUGAAAAAUGAUGGAACCUGUGUUAUUAGUGACUUUGGACUGUCCAUGAGGCUGACUGGAAAUAGACUGGUGCGCCCAGGGGAGGAAGAUAAUGCAGCCAUAAGCGAGGUUGGCACUAUCAGAUAUAUGGCACCAGAAGUGCUAGAAGGAGCUGUGAACUUGAGGGACUGUGAAUCAGCUUUGAAACAAGUAGACAUGUAUGCUCUUGGACUAAUCUAUUGGGAGAUAUUUAUGAGAUGUACAGACCUCUUCCCAGGGGAAUCCGUACCAGAGUACCAGAUGGCUUUUCAGACAGAGGUUGGAAACCAUCCCACUUUUGAGGAUAUGCAGGUUCUCGUGUCUAGGGAAAAACAGAGACCCAAGUUCCCAGAAGCCUGGAAAGAAAAUAGCCUGGCAGUGAGGUCACUCAAGGAGACAAUCGAAGACUGUUGGGACCAGGAUGCAGAGGCUCGGCUUACUGCACAGUGUGCUGAGGAAAGGAUGGCUGAACUUAUGAUGAUUUGGGAAAGAAACAAAUCUGUGAGCCCAACAGUCAAUCCAAUGUCUACUGCUAUGCAGAAUGAACGCAACCUGUCACAUAAUAGGCGUGUGCCAAAAAUUGGUCCUUAUCCAGAUUAUUCUUCCUCCUCAUACAUUGAAGACUCUAUCCAUCAUACUGACAGCAUCGUGAAGAAUAUUUCCUCUGAGCAUUCUAUGUCCAGCACACCUUUGACUAUAGGGGAAAAAAACCGAAAUUCAAUUAACUAUGAACGACAGCAAGCACAAGCUCGAAUCCCCAGCCCUGAAACAAGUGUCACCAGCCUCUCCACCAACACAACAACCACAAACACCACAGGACUCACGCCAAGUACUGGCAUGACUACUAUAUCUGAGAUGCCAUACCCAGAUGAAACAAAUCUGCAUACCACAAAUGUUGCACAGUCAAUUGGGCCAACCCCUGUCUGCUUACAGCUGACAGAAGAAGACUUGGAAACCAACAAGCUAGACCCAAAAGAAGUUGAUAAGAACCUCAAGGAAAGCUCUGAUGAGAAUCUCAUGGAGCACUCUCUUAAACAGUUCAGUGGCCCAGACCCACUGAGCAGUACUAGUUCUAGCUUGCUUUACCCACUCAUAAAACUUGCAGUAGAAGCAACUGGACAGCAGGACUUCACACAGACUGCAAAUGGCCAAGCAUGUUUGAUUCCUGAUGUUCUGCCUACUCAGAUCUAUCCUCUCCCCAAGCAGCAGAACCUUCCCAAGAGACCUACUAGUUUGCCUUUGAACACCAAAAAUUCAACAAAAGAGCCCCGGCUAAAAUUUGGCAGCAAGCACAAAUCAAACUUGAAACAAGUCGAAACUGGAGUUGCCAAGAUGAAUACAAUCAAUGCAGCAGAACCUCAUGUGGUGACAGUCACCAUGAAUGGUGUGGCAGGUAGAAACCACAGUGUUAACUCCCAUGCUGCCACAACCCAAUAUGCCAAUGGGACAGUACUAUCUGGCCAAACAACCAACAUAGUGACACAUAGGGCCCAAGAAAUGUUGCAGAAUCAGUUUAUUGGUGAGGACACCCGGCUGAAUAUUAAUUCCAGUCCUGAUGAGCAUGAGCCUUUACUGAGACGAGAGCAACAAGCUGGCCAUGAUGAAGGUGUUCUGGAUCGUCUUGUGGACAGGAGGGAACGGCCACUAGAAGGUGGCCGAACUAAUUCCAAUAACAACAACAGCAAUCCAUGUUCAGAACAAGAUGUUCUUGCACAGGGUGUUCCAAGCACAGCAGCAGAUCCUGGGCCAUCAAAGCCCAGAAGAGCACAGAGGCCUAAUUCUCUGGAUCUUUCAGCCACAAAUGUCCUGGAUGGCAGCAGUAUACAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-614.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -659.07

Frequency: 0.0000

Diversity: 519.41

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((((.((((..(((((...((((((..(..(.((((.......)))).)..)..))))))....)))))..)))).))...((((((((......((........)).(((((...)))))..))))))))....((((..(((((((.(((.....((((((((((((..((((.(((((((..((.(((.(((....(((((((((.(((((.(((((((....)))).................)))))))))))))))))...(((((....))))).))))))))..)))))....))..))))..)))))))))).))........(((((((............(((((((.....((((((...((((....(((....))).....))))...))))))..((...((((....))))...)).(((((...((((((..((((...((..(((((((((((..(((((((.((((.(((((((........)))).))).)))).......((((((.....))))))........(((..(((((((((.(((.....)))))))....)))))..)))(((((((((.((((...((((......)))).)))).))).))))))....)))))))..)))....))))))))..))))))..))))))...))))).((((...))))((((((....)).)))).)))))))))))))).((.(((...........))).))...((((....)))).........)))..)))))))..))))(((...))).))))))...(((((((...(((((((((((((((...)))).))))...(((.(((((.....(((((((((..(((((...((((((.........)))))).))))).....))))).))))...((((.(((((.(((.....((((((..(((((((.......(((....)))......(((.......)))........((((((((....(((..(((((...(((((..(((((.....(((((((.......(((((((((((((.....(((.....)))....)).)).)))))))))..........((((........)))).((((.......((.(((.(.....).)))..)).......)))).((((((((((........................(((((((((........(((.((((((..(..........)..))))))))).(((((.......))))).............(((((((.....(((((((.....(((((.(((...))).)))))..(((...((((....(((((((((((..((....((.(((......))).))..))...(((((.(((((...))))))))))..((((((..((.(((((((((.......))))))))).))....(((((.(((.((((.........(((....(((.(((((..(((...(((((.(((((..(((.(((..((((.....))..))..))).))).))))).))))))))))))))))...))).........))))))))))))......))))))....))))))))...)))....))))...)))........(((....)))......(((((((((((((.......(((((...)))))..........(((((...(((.......)))...)))))...(((...((((((((...))))))))...)))((((..........)))).)))))........))))))))...((((.........))))....((((((.(((........)))..))))))........)))))))....)).)))))..((((((....((((....)))).))))))...........))))))).)).((....))(((....)))..)))))......))))).)))))))..)))))..))))).))))))))...)))))))).((((((((....))))))))...................((((........)))).((((((...)))))))).)))))))))))...))).))))).)))).((((((.......))))))((((...((((((......))))))..))))))))))))....)))))))....))))))).......

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((.(((((((.((({{{{..((((({{,.{{{{{.{|||||((({,,..{{{||||.{((({{{,..{(((,{{{{,|,,|||....((((...((((((((,....,((..(((({...))))).)))))))))))..))))..{{||,{(.(((....))).||,||||,|,,||,|,||||||,}}||}||..,,.....{((((((((.(((((.(((((((....))))........,.,......))))))))))))))))}.,{((((({,...,,,,}.)))))))|,|||||.....{{{||,,..,,,,))))),.}}}}}},...,.})))))).}).))}}}.,.|}||,,,,||}.||})},,||....,.||||....|(((,,{{|{...,}|,,}},..}}}}}))}}}}}||}}{((((..(((.({.(((((.((((((...,,,.(((.(((.....((((((((((((..((((((.....,...((((((((...(((((((((((((((.....)))))),..(({((((((((((((((((.(((.((.((((((({{......{{.((((((.((((((.{(((....}))}..(((((((((((,(,{({(((.(((.{((((,.{{|||||...,,((((....))))..(((((.(((((({,(....})))))))))))),..((((((.(((..(...((,{(((.({(.,........))})))))),.,,,))))))))),}}}},,||,.....{{|((({{{(({{,,,.}}}...,(((((.,.({.((((((((((..{{,..{((((((((...)))).)))),((((|{,|(,,,...}},}|,|)))..(((((...((((((.........)))))),)))))))))))))))..))...))))).||||,,.))}|...,.((((..(((((......))))).))))((((,...})))).,,...,,}|,,,,,}}},,.,|,||{.....))),}}.....,,,......))),,,})})),}.,.)))))))))))..))))))..))))))..,,...(((,,......)))||.......,}....{(((........)))},.........},.))))).)).))..)))))))....))))).)))},))).}})},...........................}}..(((.((((.....)))).)))....)))))))))..))))).)))(((((.......)))))...........,)))))}.,{||....(((....)))(((((.(((...))).))))).....},}|(((...}}}.(((((((((.......((.(((......))).)){{(((..(((((.(((((...))))))))))..)),}}}..{{.(((((((((.......))))))))).}}....}.)))))))))...................{((.(((((..(((...(((((.(((((..(((.(((..((((.....}}..})..))).))).))))).)))))))))))))))})))).))))))))....))).)))...{{(,....)}}..,},)))))).)))))}).)))))))}...}}.......,,})).))))))}...{(((((((..,{,{,..{,..(((((...))))).,,...,},.|||||}},{{(,......}))..,}}}}}...,{{,,.,(((((((...))))))),...|||(((({{(,,.....},,..||,,,.,,,....}}))))))},..}.....(((((.((((((({((((((.(((........)))..)))))}.}......((((((.((..((((((...,,{{,.....||||,.((((((((((((((({....})),}))))|...,{{,((((.(((,,,,{,,,,.,,|,(((.....))),}}}}}}..,.,}||||,,,{{{,||||{{{{|||{{(((,((,,((((((((....))))))))......)))).................}}),)))))|,,|||}}}))}))).)}}}.)))))})))..,}.,.))))))..)).))))))......((...(((((...((((({......})))))..)))))..))......)))))))..))))).)))(......)