Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BMPR2_0012900
Sequence Length
2014 nt
GC Content
0.4568
GGAUCUUUAUGCAAGUAUUUAAGUCUCCACACAAGUGACUGGGUAAGCUCUUGCCGUCUUGCUCAUUCUGUUACUAGAGGACUGGCUUAUCUUCACACAGAAUUACCACGAGGAGAUCAUUAUAAACCUGCAAUUUCCCAUCGAGAUUUAAACAGCAGAAAUGUCCUAGUGAAAAAUGAUGGAACCUGUGUUAUUAGUGACUUUGGACUGUCCAUGAGGCUGACUGGAAAUAGACUGGUGCGCCCAGGGGAGGAAGAUAAUGCAGCCAUAAGCGAGGUUGGCACUAUCAGAUAUAUGGCACCAGAAGUGCUAGAAGGAGCUGUGAACUUGAGGGACUGUGAAUCAGCUUUGAAACAAGUAGACAUGUAUGCUCUUGGACUAAUCUAUUGGGAGAUAUUUAUGAGAUGUACAGACCUCUUCCCAGGGGAAUCCGUACCAGAGUACCAGAUGGCUUUUCAGACAGAGGUUGGAAACCAUCCCACUUUUGAGGAUAUGCAGGUUCUCGUGUCUAGGGAAAAACAGAGACCCAAGUUCCCAGAAGCCUGGAAAGAAAAUAGCCUGGCAGUGAGGUCACUCAAGGAGACAAUCGAAGACUGUUGGGACCAGGAUGCAGAGGCUCGGCUUACUGCACAGUGUGCUGAGGAAAGGAUGGCUGAACUUAUGAUGAUUUGGGAAAGAAACAAAUCUGUGAGCCCAACAGUCAAUCCAAUGUCUACUGCUAUGCAGAAUGAACGCAACCUGUCACAUAAUAGGCGUGUGCCAAAAAUUGGUCCUUAUCCAGAUUAUUCUUCCUCCUCAUACAUUGAAGACUCUAUCCAUCAUACUGACAGCAUCGUGAAGAAUAUUUCCUCUGAGCAUUCUAUGUCCAGCACACCUUUGACUAUAGGGGAAAAAAACCGAAAUUCAAUUAACUAUGAACGACAGCAAGCACAAGCUCGAAUCCCCAGCCCUGAAACAAGUGUCACCAGCCUCUCCACCAACACAACAACCACAAACACCACAGGACUCACGCCAAGUACUGGCAUGACUACUAUAUCUGAGAUGCCAUACCCAGAUGAAACAAAUCUGCAUACCACAAAUGUUGCACAGUCAAUUGGGCCAACCCCUGUCUGCUUACAGCUGACAGAAGAAGACUUGGAAACCAACAAGCUAGACCCAAAAGAAGUUGAUAAGAACCUCAAGGAAAGCUCUGAUGAGAAUCUCAUGGAGCACUCUCUUAAACAGUUCAGUGGCCCAGACCCACUGAGCAGUACUAGUUCUAGCUUGCUUUACCCACUCAUAAAACUUGCAGUAGAAGCAACUGGACAGCAGGACUUCACACAGACUGCAAAUGGCCAAGCAUGUUUGAUUCCUGAUGUUCUGCCUACUCAGAUCUAUCCUCUCCCCAAGCAGCAGAACCUUCCCAAGAGACCUACUAGUUUGCCUUUGAACACCAAAAAUUCAACAAAAGAGCCCCGGCUAAAAUUUGGCAGCAAGCACAAAUCAAACUUGAAACAAGUCGAAACUGGAGUUGCCAAGAUGAAUACAAUCAAUGCAGCAGAACCUCAUGUGGUGACAGUCACCAUGAAUGGUGUGGCAGGUAGAAACCACAGUGUUAACUCCCAUGCUGCCACAACCCAAUAUGCCAAUGGGACAGUACUAUCUGGCCAAACAACCAACAUAGUGACACAUAGGGCCCAAGAAAUGUUGCAGAAUCAGUUUAUUGGUGAGGACACCCGGCUGAAUAUUAAUUCCAGUCCUGAUGAGCAUGAGCCUUUACUGAGACGAGAGCAACAAGCUGGCCAUGAUGAAGGUGUUCUGGAUCGUCUUGUGGACAGGAGGGAACGGCCACUAGAAGGUGGCCGAACUAAUUCCAAUAACAACAACAGCAAUCCAUGUUCAGAACAAGAUGUUCUUGCACAGGGUGUUCCAAGCACAGCAGCAGAUCCUGGGCCAUCAAAGCCCAGAAGAGCACAGAGGCCUAAUUCUCUGGAUCUUUCAGCCACAAAUGUCCUGGAUGGCAGCAGUAUACAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-548.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -586.94
Frequency: 0.0000
Diversity: 404.78
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((.(((((..........((((((.....(((((((((((((((.......).))))))))....)))))).(((((((.((.((((((((..........(((....(((.((((((..(((..(((..((((.((((...((((....(((....))).....))))...))))))))..))))))..)))))))))))).(((((...((((((..((((...((..(((((((((((..(((((((.((((.(((((((........)))).))).)))).......((((((.....))))))........(((..(((((((((.(((.....)))))))....)))))..)))(((((((((.((((...((((......)))).)))).))).))))))....)))))))..)))....))))))))..))))))..))))))...)))))((((.(((.....))).)))).)))))))).)).)))))))...(((.(((((...............)))))))).(((.((..(.....)..)).)))..((((....)))).))))))..........(((((...(((((((((((((((...)))).))))...(((.(((((.....(((((((((..(((((...((((((.........)))))).))))).....))))).))))...((((.(((((.(((.....((((((..(((((((.......(((....)))......(((.......)))........((((((((....(((..(((((...(((((..(((((.....(((((((.......(((((((((((((.....(((.....)))....)).)).)))))))))..........((((........)))).((((.......((.(((.(.....).)))..)).......)))).((((((((((........................(((((((((........(((.((((((..(..........)..))))))))).(((((.......))))).............(((((((.....(((((((.....(((((.(((...))).)))))..(((...((((....(((((((((((..((....((.(((......))).))..))...(((((.(((((...))))))))))..((((((..((.(((((((((.......))))))))).))....(((((.(((.((((.........(((....(((.(((((..(((...(((((.(((((..(((.(((..((((.....))..))..))).))).))))).))))))))))))))))...))).........))))))))))))......))))))....))))))))...)))....))))...)))........(((....)))......(((((((((((((.......(((((...)))))..........(((((...(((.......)))...)))))...(((...((((((((...))))))))...)))((((..........)))).)))))........))))))))...((((.........))))....((((((.(((........)))..))))))........)))))))....)).)))))..((((((....((((....)))).))))))...........))))))).)).((....))(((....)))..)))))......))))).)))))))..)))))..))))).))))))))...)))))))).((((((((....))))))))...................((((........)))).((((((...)))))))).)))))))))))...))).))))).)))).((((((.......))))))((((...((((((......))))))..))))))))))))....)))))))....)))))))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(((...((((.((((((,.,{{,.(((....))).(((((...((((((,{({(({({,,.{((((({.....{(|{|..,,,...}}}}}..}}}))}}...,,.)}))|},{(((((..{{{.,(((..((({,(((|...|{{{....{{{....))),...,))}}...})))))}}..))))))..)))))),{((((..(((.((.(((((.((((((...,,,.(((.(((.....((((((((((((..((((((.....,...((((((((...(((((((((((((((.....)))))),..(({((((((((((((((((.(((.((.((((((({{......{{.((((((.((((((.{(((....}))}..(((((((((((,(,{({(((.(((.{((((,.{{|||||...,,((((....))))..(((((.(((((({,(....})))))))))))),..((((((.(((..(...((,{(((.({(.,........))})))))),.,,,))))))))),}}}},,||,.....{{|((({{{(({{,,,.}}}...,(((((.,.({.((((((((((..{{,..{((((((((...)))).)))),((((|{,|(,,,...}},}|,|)))..(((((...((((((.........)))))),)))))))))))))))..))...))))).||||,,.))}|...,.((((..(((((......))))).))))((((,...})))).,,...,,}|,,,,,}}},,.||,||{.....))),}}.....,,,......))),,,})})),}.,.)))))))))))..))))))..))))))..,,...(((,,......)))||.......,}....{(((........)))},.........},.))))).)).))..)))))))....))))).)))},))).}})},...........................}}..(((.((((.....)))).)))....)))))))))..))))).)))(((((.......)))))...........,)))))}.,{||....(((....)))(((((.(((...))).))))).....},}|(((...}}}.(((((((((.......((.(((......))).)){{(((..(((((.(((((...))))))))))..)),}}}..{{.(((((((((.......))))))))).}}....}.)))))))))...................{((.(((((..(((...(((((.(((((..(((.(((..((((.....}}..})..))).))).))))).)))))))))))))))})))).))))))))....))).)))...{{(,....)}}..,},)))))).))))))).)))))))}..........))))))))))).......{(((((((...{.,,..{{..(((((...))))).}}...)),.))))))))}})))))))......))))..))).))((.,(((((((...)))))))...,((((((((((,,.........,,,..,.,,}....,,)))))))}.}),....(((((.((((((({((((((.(((........)))..)))))}.}......((((((.((..((((((...,,{{......||||,.((((((((((((((({....})),}))))|...,{{{((((.(((,{,,{,,,,.,,|,(((.....))},}}}}}}..,.,}||||,,,{{{,||||{{{{|||{{(((,((,,((((((((....))))))))......)))).................}}),)))))|,,|||}}}))}))).)}}}.)))))})))..,}.,.))))))..)).))))))......((...(((((...((((({......})))))..)))))..))......)))))))..)))))..........))
Back