Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BMPR2_0013100
Sequence Length
644 nt
GC Content
0.4565
AAGAGGAAGGUCUAUUAUCAGAAGAUCUGUUACCAGAAGAAAAACAGCUCAUGAGGCUAUAGGAAAAGGCUGAAAAGAACAUAGAGAAGAACAUUGACAAAUACACGAAGGUCCUCAAGGCCCACAGACUCCUAGUCUGAGUCCAAUAAAGACUGUUUAUUCCUCAUGCUUGUCCUGGCCUGCUCUUCCUCCAUUGUUGCCAUGGGGAUGUAGGGGACCCAGGGGCAGCAGUCCAGGUGCUCUAGGCAGCCUGGGACUUACAAAGCUGGAGAUAAGGAAUGAAUCUUAGUCACUGUCUUUCUAUUAGGUUACUUUAAACAACUCUAAAAGUUGUGCAGACAUAAUUUGUCUAUGAUGUACUUGUUUGCAAGAGAGUUUCAUAAAAUCAUUAGUAAAAACAACCUGCUACUUCAGUUGGAAUAUUGGCAGCCCGGGCGUGAUUGAUGGCUCAUGCCUGUAACUCUGACACUUUGGGAGACCAAGGCAGGUGGAUUGCUUGAGCUCGGGAGUUUGAGACCAGCCUGGGUAACAUGGUGAAACCCUGUCUCUACAAAAAAUAUAAACAUUAGCUGGACGUGGUGGCAUGCACCUGUAGUCGCAGCUACUUGGGAGGCUGAGCUGGGAGGAUUGUUUGAGCCUGGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-179.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -192.58
Frequency: 0.0000
Diversity: 214.60
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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