Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BMPR2_0014000
Sequence Length
1738 nt
GC Content
0.4597
GUUGGCACUAUCAGAUAUAUGGCACCAGAAGUGCUAGAAGGAGCUGUGAACUUGAGGGACUGUGAAUCAGCUUUGAAACAAGUAGACAUGUAUGCUCUUGGACUAAUCUAUUGGGAGAUAUUUAUGAGAUGUACAGACCUCUUCCCAGGGGAAUCCGUACCAGAGUACCAGAUGGCUUUUCAGACAGAGGUUGGAAACCAUCCCACUUUUGAGGAUAUGCAGGUUCUCGUGUCUAGGGAAAAACAGAGACCCAAGUUCCCAGAAGCCUGGAAAGAAAAUAGCCUGGCAGUGAGGUCACUCAAGGAGACAAUCGAAGACUGUUGGGACCAGGAUGCAGAGGCUCGGCUUACUGCACAGUGUGCUGAGGAAAGGAUGGCUGAACUUAUGAUGAUUUGGGAAAGAAACAAAUCUGUGAGCCCAACAGUCAAUCCAAUGUCUACUGCUAUGCAGAAUGAACGCAACCUGUCACAUAAUAGGCGUGUGCCAAAAAUUGGUCCUUAUCCAGAUUAUUCUUCCUCCUCAUACAUUGAAGACUCUAUCCAUCAUACUGACAGCAUCGUGAAGAAUAUUUCCUCUGAGCAUUCUAUGUCCAGCACACCUUUGACUAUAGGGGAAAAAAACCGAAAUUCAAUUAACUAUGAACGACAGCAAGCACAAGCUCGAAUCCCCAGCCCUGAAACAAGUGUCACCAGCCUCUCCACCAACACAACAACCACAAACACCACAGGACUCACGCCAAGUACUGGCAUGACUACUAUAUCUGAGAUGCCAUACCCAGAUGAAACAAAUCUGCAUACCACAAAUGUUGCACAGUCAAUUGGGCCAACCCCUGUCUGCUUACAGCUGACAGAAGAAGACUUGGAAACCAACAAGCUAGACCCAAAAGAAGUUGAUAAGAACCUCAAGGAAAGCUCUGAUGAGAAUCUCAUGGAGCACUCUCUUAAACAGUUCAGUGGCCCAGACCCACUGAGCAGUACUAGUUCUAGCUUGCUUUACCCACUCAUAAAACUUGCAGUAGAAGCAACUGGACAGCAGGACUUCACACAGACUGCAAAUGGCCAAGCAUGUUUGAUUCCUGAUGUUCUGCCUACUCAGAUCUAUCCUCUCCCCAAGCAGCAGAACCUUCCCAAGAGACCUACUAGUUUGCCUUUGAACACCAAAAAUUCAACAAAAGAGCCCCGGCUAAAAUUUGGCAGCAAGCACAAAUCAAACUUGAAACAAGUCGAAACUGGAGUUGCCAAGAUGAAUACAAUCAAUGCAGCAGAACCUCAUGUGGUGACAGUCACCAUGAAUGGUGUGGCAGGUAGAAACCACAGUGUUAACUCCCAUGCUGCCACAACCCAAUAUGCCAAUGGGACAGUACUAUCUGGCCAAACAACCAACAUAGUGACACAUAGGGCCCAAGAAAUGUUGCAGAAUCAGUUUAUUGGUGAGGACACCCGGCUGAAUAUUAAUUCCAGUCCUGAUGAGCAUGAGCCUUUACUGAGACGAGAGCAACAAGCUGGCCAUGAUGAAGGUGUUCUGGAUCGUCUUGUGGACAGGAGGGAACGGCCACUAGAAGGUGGCCGAACUAAUUCCAAUAACAACAACAGCAAUCCAUGUUCAGAACAAGAUGUUCUUGCACAGGGUGUUCCAAGCACAGCAGCAGAUCCUGGGCCAUCAAAGCCCAGAAGAGCACAGAGGCCUAAUUCUCUGGAUCUUUCAGCCACAAAUGUCCUGGAUGGCAGCAGUAUACAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-475.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -508.48
Frequency: 0.0000
Diversity: 343.20
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((.(((((((((((((((.....))))))...(((((((((((((((((((.(((.((.(((((((((.........((((((.((((((.((((....))))..(((((((((((....(((((.(((.(((((....))))).....((((....))))..(((((.(((((((...((((..((((.........((((((.(((..(...(((.(((.(((..........)))))))))..)..))))))))).((((((((......((.((((((((((....)))....(((((...((.((((((((((.......(((((((((...)))).)))))((((.(.((......)).)..))))..(((((...((((((.........)))))).)))))))))))))))..))...)))))))))))).)).......((((..(((((......))))).))))(((((...))))).))).))))).......)))).)))).....)))))))..))))).......)))...))))).....)))))))))))..))))))..)))))).......(((........)))((.......))....((((........))))..........)).))))).)).))..)))))))....))))).))).))))...))).............((............))..(((.((((.....)))).)))....)))))))))..((((((((((((((.......)))))...........(((((((..(((..(((((.......(((((.(((...))).)))))....((.((((........))))))..........((.(((......))).))(((((..(((((.(((((...))))))))))..)).)))..((.(((((((((.......))))))))).))....(((((.(((.((((.........(((....(((.(((((..(((...(((((.(((((..(((.(((..((((.....))..))..))).))).))))).))))))))))))))))...))).........))))))))))))...)))))..)))....(((((.((((((...................)))).))...)))))....((((((((...((....((..(((((...))))).))...))..))))))))(((.......)))..))))))).........(((((((...)))))))....)))))))))(((....)))..)))))))))((..(((((((............(((((.(((((((.((((((.(((........)))..))))))........((((((.((..((((((.............((((..((((((((((((((((....))).)))))........((((.(((....((......))(((.....))))))))))......((((...(((.((((((((((((((((.((((((((((((....))))))))......)))).................))).)))))...)))))))).))).)))).))))).)))..)).))))))))..)).))))))......((...(((((...((((((......))))))..)))))..))......)))))))..))))))))))))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((.(((((((((((((((.....)))))),..(({((((((((((((((((.(((.((.((((((({{......{{.((((((.((((((.{(((....}))}..(((((((((((,(,{({(((.(((.{((((,.{{|||||...,,((((....))))..(((((.(((((({,(....})))))))))))),..((((((.(((..(...((,{(((.({(.,........))})))))),.,,,))))))))),}}}},,||,.....{{|((({{{(({{,,,.}}}...,(((((.,.({.((((((((((..{{,..{((((((((...)))).)))),((((|{,|(,,,...}},}|,|)))..(((((...((((((.........)))))),)))))))))))))))..))...))))).||||,,.))}|...,.((((..(((((......))))).))))((((,...})))).,,...,,}|,,,,,}}},,.,|,||{.....))),}}.....,,,......))),,,})})),}.,.)))))))))))..))))))..))))))..,,...(((,,......)))||.......,}....{(((........)))},.........},.))))).)).))..)))))))....))))).)))},))).}})},...........................}}..(((.((((.....)))).)))....)))))))))..((((((((((((((.......)))))...........(((((((.,(((..,,(((....,..(((((.(((...))).)))))..,.{,.,((({....||,((((((((........((.(((......))).)).,{{{..(((((.(((((...))))))))))..||||||..{{.(((((((((.......))))))))).}}....(((((.(({{((((.........{{{...,{{(.(((((..(((...(((((.(((((..(((.(((..((((.....)}..})..))).))).))))).))))))))))))))))...}}}.........))))))))))))...,,,))}})),...}|||||}|,,,{{|.....,,,...}}}......,},||...}))).....((((((((...{.,,..{{..(((((...))))).}}...)),.)))))))){{(,......}))..))))))).....,,..{((((((...)))))))},..)))))))))(((....)))..)))))))))((..(((((((............(((((.((((((({((((((.(((........)))..)))))}.}......((((((.((..((((((...,,{{......||||,.((((((((((((((({....})),})))){...,{{,((((.((({{{,{,,.,.,,|,(((.....))),}}}}}}..,.,}||||,,,{{{,||||{{{{|||{{(((,((,,((((((((....))))))))......)))).................}}),)))))|,,|||}}})),))).)}}}.)))))))))..,}.,.))))))..)).))))))......((...(((((...((((({......})))))..)))))..))......)))))))..))))))))))))...))
Back