Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BMPR2_0014800
Sequence Length
1271 nt
GC Content
0.4595
CAACCUGUCACAUAAUAGGCGUGUGCCAAAAAUUGGUCCUUAUCCAGAUUAUUCUUCCUCCUCAUACAUUGAAGACUCUAUCCAUCAUACUGACAGCAUCGUGAAGAAUAUUUCCUCUGAGCAUUCUAUGUCCAGCACACCUUUGACUAUAGGGGAAAAAAACCGAAAUUCAAUUAACUAUGAACGACAGCAAGCACAAGCUCGAAUCCCCAGCCCUGAAACAAGUGUCACCAGCCUCUCCACCAACACAACAACCACAAACACCACAGGACUCACGCCAAGUACUGGCAUGACUACUAUAUCUGAGAUGCCAUACCCAGAUGAAACAAAUCUGCAUACCACAAAUGUUGCACAGUCAAUUGGGCCAACCCCUGUCUGCUUACAGCUGACAGAAGAAGACUUGGAAACCAACAAGCUAGACCCAAAAGAAGUUGAUAAGAACCUCAAGGAAAGCUCUGAUGAGAAUCUCAUGGAGCACUCUCUUAAACAGUUCAGUGGCCCAGACCCACUGAGCAGUACUAGUUCUAGCUUGCUUUACCCACUCAUAAAACUUGCAGUAGAAGCAACUGGACAGCAGGACUUCACACAGACUGCAAAUGGCCAAGCAUGUUUGAUUCCUGAUGUUCUGCCUACUCAGAUCUAUCCUCUCCCCAAGCAGCAGAACCUUCCCAAGAGACCUACUAGUUUGCCUUUGAACACCAAAAAUUCAACAAAAGAGCCCCGGCUAAAAUUUGGCAGCAAGCACAAAUCAAACUUGAAACAAGUCGAAACUGGAGUUGCCAAGAUGAAUACAAUCAAUGCAGCAGAACCUCAUGUGGUGACAGUCACCAUGAAUGGUGUGGCAGGUAGAAACCACAGUGUUAACUCCCAUGCUGCCACAACCCAAUAUGCCAAUGGGACAGUACUAUCUGGCCAAACAACCAACAUAGUGACACAUAGGGCCCAAGAAAUGUUGCAGAAUCAGUUUAUUGGUGAGGACACCCGGCUGAAUAUUAAUUCCAGUCCUGAUGAGCAUGAGCCUUUACUGAGACGAGAGCAACAAGCUGGCCAUGAUGAAGGUGUUCUGGAUCGUCUUGUGGACAGGAGGGAACGGCCACUAGAAGGUGGCCGAACUAAUUCCAAUAACAACAACAGCAAUCCAUGUUCAGAACAAGAUGUUCUUGCACAGGGUGUUCCAAGCACAGCAGCAGAUCCUGGGCCAUCAAAGCCCAGAAGAGCACAGAGGCCUAAUUCUCUGGAUCUUUCAGCCACAAAUGUCCUGGAUGGCAGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-321.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -345.70
Frequency: 0.0000
Diversity: 309.51
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..(((((......))))).)(((((((..............(((((.......((((((((....(((..(((((...(((((..(((((.....(((((((.......(((((((((((((.....(((.....)))....)).)).)))))))))..........((((........)))).((((.......((.(((.(.....).)))..)).......)))).((((((((((........................(((((((((........(((.((((((..(..........)..))))))))).(((((.......))))).............(((((((.....(((((((.....(((((.(((...))).)))))..(((...((((....(((((((((((..((....((.(((......))).))..))...(((((.(((((...))))))))))..((((((..((.(((((((((.......))))))))).))....(((((.(((.((((.........(((....(((.(((((..(((...(((((.(((((..(((.(((..((((.....))..))..))).))).))))).))))))))))))))))...))).........))))))))))))......))))))....))))))))...)))....))))...)))........(((....)))......(((((((((((((.......(((((...)))))..........(((((...(((.......)))...)))))...(((...((((((((...))))))))...)))((((..........)))).)))))........))))))))...((((.........))))....((((((.(((........)))..))))))........)))))))....)).)))))..((((((....((((....)))).))))))...........))))))).)).((....))(((....)))..)))))......))))).)))))))..)))))..))))).))))))))...)))))))).((((((((....))))))))......................((((.(((.(((.(((((((...))))).)).))))))))))....((......)).....((((((.......))))))((((...((((((......))))))..))))...............)))))))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..(((((......))))).)(((((((....,(((.......}}}|,,...{{(((,{{,{....,,..}||||,...,{{{,..{,,,{|,..{((((((({{(({{{(((,.(((({((({....,((((((.((((((({,......(((((............((((........))))||..,{{.,,,....))).}..))))).{,.{{,.....,|,||{{((((((((((........................{{(((((((,,.{{{,.{{{.((((((..{..........}..)))))}}}}.(((((.......)))))...........||{((((((.,...(((((((.....(((((.(((...))).)))))..{,{...((((....||{((((((((........((.(((......))).)).,||,..(((((.(((((...))))))))))..||{|||..{{.(((((((((.......))))))))).}}....(((((.(({{((((.........{{{...,{{(.(((((..(((...(((((.(((((..(((.(((..((((.....)}..})..))).))).))))).))))))))))))))))...}}}.........))))))))))))......}})))}....))))))))...|||....,}}}...}}}........,{(,,.,||}.....{(((((((,.,{,{...,,..(((((...))))).,,...,},.|||||},,(((.......}))...))}}}...,{{...,(((((((...)))))))}...))}{{{|||{,{....,}},..||},}.,,,....}})))))),..{{{,....,,,..})))...{{(((({.(((........)))..)))))),}......)))))))....))}})))}..{((({{....((((....)))).}))}||,,.....,,..))))))).)).{{....)){{{....)}}..)))))......))))).,,))}})))))))).)))))).|||||}}),,,}||||||,.((((((((....))))))))......,}},.............,,..,,,,|||}||||{{,,,,))))))},,))}})))))|....({......}}.....((((((.......)))))),(((...((((({......}))))),.)))}{{{|..,,...,)}.})))}))))},))
Back