Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_BMPR2_0014900

Sequence Length

1233 nt

GC Content

0.4590

AUUAUUCUUCCUCCUCAUACAUUGAAGACUCUAUCCAUCAUACUGACAGCAUCGUGAAGAAUAUUUCCUCUGAGCAUUCUAUGUCCAGCACACCUUUGACUAUAGGGGAAAAAAACCGAAAUUCAAUUAACUAUGAACGACAGCAAGCACAAGCUCGAAUCCCCAGCCCUGAAACAAGUGUCACCAGCCUCUCCACCAACACAACAACCACAAACACCACAGGACUCACGCCAAGUACUGGCAUGACUACUAUAUCUGAGAUGCCAUACCCAGAUGAAACAAAUCUGCAUACCACAAAUGUUGCACAGUCAAUUGGGCCAACCCCUGUCUGCUUACAGCUGACAGAAGAAGACUUGGAAACCAACAAGCUAGACCCAAAAGAAGUUGAUAAGAACCUCAAGGAAAGCUCUGAUGAGAAUCUCAUGGAGCACUCUCUUAAACAGUUCAGUGGCCCAGACCCACUGAGCAGUACUAGUUCUAGCUUGCUUUACCCACUCAUAAAACUUGCAGUAGAAGCAACUGGACAGCAGGACUUCACACAGACUGCAAAUGGCCAAGCAUGUUUGAUUCCUGAUGUUCUGCCUACUCAGAUCUAUCCUCUCCCCAAGCAGCAGAACCUUCCCAAGAGACCUACUAGUUUGCCUUUGAACACCAAAAAUUCAACAAAAGAGCCCCGGCUAAAAUUUGGCAGCAAGCACAAAUCAAACUUGAAACAAGUCGAAACUGGAGUUGCCAAGAUGAAUACAAUCAAUGCAGCAGAACCUCAUGUGGUGACAGUCACCAUGAAUGGUGUGGCAGGUAGAAACCACAGUGUUAACUCCCAUGCUGCCACAACCCAAUAUGCCAAUGGGACAGUACUAUCUGGCCAAACAACCAACAUAGUGACACAUAGGGCCCAAGAAAUGUUGCAGAAUCAGUUUAUUGGUGAGGACACCCGGCUGAAUAUUAAUUCCAGUCCUGAUGAGCAUGAGCCUUUACUGAGACGAGAGCAACAAGCUGGCCAUGAUGAAGGUGUUCUGGAUCGUCUUGUGGACAGGAGGGAACGGCCACUAGAAGGUGGCCGAACUAAUUCCAAUAACAACAACAGCAAUCCAUGUUCAGAACAAGAUGUUCUUGCACAGGGUGUUCCAAGCACAGCAGCAGAUCCUGGGCCAUCAAAGCCCAGAAGAGCACAGAGGCCUAAUUCUCUGGAUCUUUCAGCCACAAAUGUCCUGGAUGGCAGCAGUAUACAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-311.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -333.04

Frequency: 0.0000

Diversity: 242.66

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....(((((.............))))).....((....((((((....(((((((((((((((((..(((((((((.....((((((.((((((((.......(((((............((((........))))(((..((........)))))..)))))....((......)).((((((((((((((........................(((((((((........(((.((((((..(..........)..))))))))).(((((.......))))).............(((((((.....(((((((.....(((((.(((...))).)))))..(((...((((....(((((((((((..((....((.(((......))).))..))...(((((.(((((...))))))))))..((((((..((.(((((((((.......))))))))).))....(((((.(((.((((.........(((....(((.(((((..(((...(((((.(((((..(((.(((..((((.....))..))..))).))).))))).))))))))))))))))...))).........))))))))))))......))))))....))))))))...)))....))))...)))........(((....)))......(((((((((((((.......(((((...)))))..........(((((...(((.......)))...)))))...(((...((((((((...))))))))...)))((((..........)))).)))))........))))))))...((((.........))))....((((((.(((........)))..))))))........)))))))....)).)))))..((((((....((((....)))).))))))...........))))))).)).((....))(((....)))..)))))......)))))...)))))))))))).)))))).((((...)))).((((((..((((((((....))))))))..))..))))....................)))))))))...)))))))))).)))...(((((...)))))...........((((((.......))))))((((...((((((......))))))..)))).(((..((....)).)))))))....))))))...))

Thermodynamic Ensemble Prediction

.....(((((.............))))).....{{....((((((...{(((((((((((((((((..(((((((((.....((((((.((((((((.......(((((............((((........))))||..,{(.,,,....))),}..))))).,,.{(......,}.||{{((((((((((........................{{(((((((,,.{{{..{{{.((((((..{..........}..))))))}}}.(((((.......)))))...........||{((((((.....(((((((.....(((((.(((...))).)))))..{,{...((((....||{((((((((........((.(((......))).)).,||,..(((((.(((((...))))))))))..||{{{{..{{.(((((((((.......))))))))).}}....(((((.(({{((((.........{{{...,{{(.(((((..(((...(((((.(((((..(((.(((..((((.....)}..})..))).))).))))).))))))))))))))))...}}}.........))))))))))))......}})))}....))))))))...|||....,}}}...}})........,{(,,.,||}.....{(((((((,.|{,{...,,..(((((...))))).,,...,|,.|||||,,.(((.......)))...}}}}}...{{{...,(((((((...)))))))}...))}{(((|{{,,....,}},..||},}.,,,....}})))))),..{{{,....,,,..})))...{((((((.(((........)))..)))))},}......)))))))....))}})))}..{((({{....((((....)))).}))))|...........))))))).)).{(....)){{{....)}}..)))))......)))))...}},})))))))).)))))).{(((,,.}}}).((({{{..((((((((....))))))))..,,..})))....................)))))))))...)))))))))).)))..||||||....{{......}}.....((((((.......))))))((((...((((({......}))))),.)))).{,(,,{,....},.,)))}))},.,))))))...}}