Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_CADPS2_0000400

Sequence Length

971 nt

GC Content

0.4119

CACUUUUGUGUAAUGGAAAAUUUCACAAACACUUGCAAGAAAUCUUUGUACCCUUGGUUGUCCGCUAUGUGGAUCUCAUGGAGUCUUCCAUCGCCCAGUCAAUUCACAGAGGUUUUGAGCAGGAGACAUGGCAGCCUGUCAAGAAUAUCGCCAACAGUCUUCCCAAUGUAGCUCUUCCAAAAGUUCCAAGUCUGCCUCUUAAUCUUCCACAGAUUCCUAACAUUUCUACUGCUUCGUGGAUGCCUUCUUUAUAUGAGUCCACCAAUGGCUCAGCAACAUCAGAAGACCUUUUUUGGAAGCUUGAUGCACUGCAAAUGUUUGUCUUUGAUCUGCACUGGCCAGAACAGGAAUUUGCCCACCACUUAGAGCAAAGACUUAAACUAAUGGCCAGUGAUAUGCUAGAGGCCUGUGUCAAAAGAACAAGAACUGCAUUUGAACUCAAGCUACAAAAGGCAAGCAAAACAACUGACUUGCGCAUUCCAGCUUCCGUUUGCACUAUGUUUAAUGUAUUAGUCGAUGCCAAAAAGCAAAGCACCAAACUCUGUGCCCUGGAUGGAGGACAAGAGCAACAGUACCAUUCAAAAAUAGAUGAUCUGAUCGACAACAGUGUAAAAGAAAUCAUUUCACUGUUAGUUUCAAAGUUUGUUUCAGUGUUGGAAGGCGUGUUGUCUAAGCUGUCAAGGUAUGAUGAAGGCACUUUCUUUUCAUCCAUUCUGUCAUUCACUGUGAAAGCAGCUGCAAAAUAUGUUGAUGUUCCAAAACCAGGAAUGGAUCUGGCAGACACCUAUAUUAUGUUUGUUCGGCAAAACCAAGAUAUUCUUCGAGAAAAGGUCAAUGAGGAAAUGUAUAUAGAAAAGUUAUUUGAUCAAUGGUACAGCAGUUCCAUGAAAGUCAUUUGCGUGUGGUUGACUGAUAGAUUAGACCUCCAACUCCAUAUUUACCAGCUGAAGACGCUCAUCAAGAUUGUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-230.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -248.29

Frequency: 0.0000

Diversity: 309.46

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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