Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CADPS2_0001000
Sequence Length
300 nt
GC Content
0.3600
CAACAGUACCAUUCAAAAAUAGAUGAUCUGAUCGACAACAGUGUAAAAGAAAUCAUUUCACUGUUAGUUUCAAAGUUUGUUUCAGUGUUGGAAGGCGUGUUGUCUAAGCUGUCAAGGUAUGAUGAAGGCACUUUCUUUUCAUCCAUUCUGUCAUUCACUGUGAAAGCAGCUGCAAAAUAUGUUGAUGUUCCAAAACCAGGAAUGGAUCUGGCAGACACCUAUAUUAUGUUUGUUCGGCAAAACCAAGAUAUUCUUCGAGAAAAGGUCAAUGAGGAAAUGUAUAUAGAAAAGUUAUUUGAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-53.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -59.96
Frequency: 0.0000
Diversity: 78.75
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..(((..((((((..((((((((....(((..((((((((((.(((........)))))))))).))))))..))))))))..((.((((((((((((((.....((((((..(((...((((((((.......))))))))...))).((((.....))))..))))))....))))))))....)))))).))...))))))..)))...)(((.((((((.((((((.((((((........((......))........)))...))).))))))))))))..........)).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
{..(((..((((((..{(((((((....(((..((((((((((.(((.,....,.)))))))))).))))))..)))))))}..((.((((((((((((((.....((((((..,((.{{((((((((......,)))))))),..}}}.{(((.....))))..))))))....))))))))....)))))).))...))))))..))){{{|{{{.{{{{{..{|||||,|{{({.....||..{{..,{{{||..,,...,})}..}))).))})))}}}}}}.....,,.,}}},}
Back