Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CADPS2_0002600
Sequence Length
496 nt
GC Content
0.4113
CAAUGGCUCAGCAACAUCAGAAGACCUUUUUUGGAAGCUUGAUGCACUGCAAAUGUUUGUCUUUGAUCUGCACUGGCCAGAACAGGAAUUUGCCCACCACUUAGAGCAAAGACUUAAACUAAUGGCCAGUGAUAUGCUAGAGGCCUGUGUCAAAAGAACAAGAACUGCAUUUGAACUCAAGCUACAAAAGGCAAGCAAAACAACUGACUUGCGCAUUCCAGCUUCCGUUUGCACUAUGUUUAAUGUAUUAGUCGAUGCCAAAAAGCAAAGCACCAAACUCUGUGCCCUGGAUGGAGGACAAGAGCAACAGUACCAUUCAAAAAUAGAUGAUCUGAUCGACAACAGUGUAAAAGAAAUCAUUUCACUGUUAGUUUCAAAGUUUGUUUCAGUGUUGGAAGGCGUGUUGUCUAAGCUGUCAAGGUAUGAUGAAGGCACUUUCUUUUCAUCCAUUCUGUCAUUCACUGUGAAAGCAGCUGCAAAAUAUGUUGAUGUUCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-112.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -123.80
Frequency: 0.0000
Diversity: 140.04
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((..((.((((((...............(((((((.(((((...((((.(((((((((((......(((((((((....(((..(((((.(........).)))))..))).......)))))))))....(((.(((..(.((((....((........))))))..)..))).)))....)))))))))))...........)))))))))..))))))).((((((...(((((...(((((....)))))....)))))..((((........))))...(((((((.((.((((((((((...((.(((((((((((((....(((..((((((((((.(((........)))))))))).))))))..)))))))).....))))).))..))))))....(((.(((........))).)))....)))).)).))))))).........((((....)))).))))))..)))))).))..)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
...{((..((.((((((.,{{,,....,}},|(((((((.(((((...{(((.((((((((((({.,...(((((((((....(((..(((((.(........).)))))..))).......))))))))).,,.(((.{{|,,,,|||||,..|}..,,,,...,)))),,)..}}).)))..,.}}})|||||||.......,,.,)))))))}}}.)))))))|((((({,,.(((((...(((({....})))}....}})))..|{{{....,...)))).,,{{{{||{|{{,{{{{{(((((.,.((.(((({{{{(((((,,.,({{..((((((((((.(((.,....,.)))))))))).)))}}}.,)})))))).....))))).}),.))))))},.,((({({{.,,..,{{|||{||,....,}))}))))))},,}|,{{{{...,,|})}..)))),))}}},..)))))).))..))}
Back