Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CADPS2_0003600
Sequence Length
641 nt
GC Content
0.4228
CACUUUUGUGUAAUGGAAAAUUUCACAAACACUUGCAAGAAAUCUUUGUACCCUUGGUUGUCCGCUAUGUGGAUCUCAUGGAGUCUUCCAUCGCCCAGUCAAUUCACAGAGGUUUUGAGCAGGAGACAUGGCAGCCUGUCAAGAAUAUCGCCAACAGUCUUCCCAAUGUAGCUCUUCCAAAAGUUCCAAGUCUGCCUCUUAAUCUUCCACAGAUUCCUAACAUUUCUACUGCUUCGUGGAUGCCUUCUUUAUAUGAGUCCACCAAUGGCUCAGCAACAUCAGAAGACCUUUUUUGGAAGCUUGAUGCACUGCAAAUGUUUGUCUUUGAUCUGCACUGGCCAGAACAGGAAUUUGCCCACCACUUAGAGCAAAGACUUAAACUAAUGGCCAGUGAUAUGCUAGAGGCCUGUGUCAAAAGAACAAGAACUGCAUUUGAACUCAAGCUACAAAAGGCAAGCAAAACAACUGACUUGCGCAUUCCAGCUUCCGUUUGCACUAUGUUUAAUGUAUUAGUCGAUGCCAAAAAGCAAAGCACCAAACUCUGUGCCCUGGAUGGAGGACAAGAGCAACAGUACCAUUCAAAAAUAGAUGAUCUGAUCGACAACAGUGUAAAAGAAAUCAUUUCACUGUUAGUUUCAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-148.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -160.72
Frequency: 0.0000
Diversity: 155.03
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((.(((.....))).))))))....(((..(((((((((((....(((((((...((...(((((.(((...)))...))))).)).)))))))...)))))))))))..)))((((((.((((.................))))...))))))....(((.(((((.................(((((((..((((..((((((...........(((((......)))))...(((((.....((((.(((....)))))))........))))).........(((((((.(((((...((((.(((((((((((......(((((((((....(((..(((((.(........).)))))..))).......)))))))))....(((.(((..(.((((....((........))))))..)..))).)))....)))))))))))...........)))))))))..)))))))(((((..((.(((((...(((((....)))))....))))).))...)))))))))))....))))))))).))))))).)))....((((........))))...(((..((((((((((.(((........)))))))))).))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{{..,,|||{.,({{,..,,,.},,,,...,,(((..(((((((((((....{((({{(,{{((...|||||,,{{,,{||}...))))).},.})}}}}}...)))))))))))..))){(((((.((((...,{....,,......))))...))))}}....{((.((((({......,......,.,{{(((((..{(((..((((({...........(((((......))))).,.(((((.....((((.(({....}))))))........))))).........(((((((.(((((...{(({.((((((((((({.,...(((((((((....(((..(((((.(........).)))))..))).......))))))))).,,.(((.{{|,,,,|||||,..}},.,,,,...,)))),,)..}}).))),.,.}}})|||||||.......,,.,)))))))}}}.)))))))(((((..((.(((((...(((((....)))))....))))).))...)))))))))))....))))))))).})))))).})}....{{{{........}}))...||{..{(((((((((.(((.,....,.)))))))))).)))})}..}
Back