Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CADPS2_0004500
Sequence Length
1401 nt
GC Content
0.4325
GGAUGGUUUAGCCCUGGCCAAGUCUUUGUGUUAGAUGAGUACUGUGCCCGUUAUGGUGUGAGAGGCUGUCACAGACAUCUCUGCUACCUUGCAGAACUGAUGGAACAUUCAGAAAAUGGUGCUGUCAUUGACCCUACCCUGCUCCAUUACAGCUUUGCAUUCUGUGCCUCUCAUGUGCACGGCAACAGGCCUGAUGGAAUUGGGACUGUUUCAGUGGAAGAAAAAGAAAGAUUUGAGGAGAUAAAAGAGAGACUCUCUUCCCUUUUAGAAAAUCAGAUAAGCCAUUUCAGAUACUGUUUUCCCUUUGGACGACCUGAAGGUGCUCUAAAAGCUACACUUUCAUUACUUGAAAGGGUUUUAAUGAAAGAUAUUGCCACUCCCAUACCAGCAGAAGAGGUGAAGAAAGUGGUCAGAAAAUGUCUCGAGAAAGCUGCCUUGAUCAAUUACACUAGACUCACAGAAUAUGCCAAAAUAGAAGGCCCAGCAGAAAAGGAAACAGAGACCAUGAACCAGGCAUCUCCUGCUAGAAAGCUGGAAGAGAUUCUUCAUCUGGCAGAGCUCUGCAUAGAAGUCUUACAGCAGAAUGAAGAGCAUCAUGCAGAGGCAUUUGCCUGGUGGCCUGAUUUAUUGGCUGAACAUGCAGAGAAAUUUUGGGCUUUAUUUACAGUGGAUAUGGACACUGCACUAGAGGCUCAACCGCAAGACUCCUGGGAUAGUUUUCCUCUUUUCCAACUGCUUAAUAAUUUCCUCCGAAAUGACACACUUUUGUGUAAUGGAAAAUUUCACAAACACUUGCAAGAAAUCUUUGUACCCUUGGUUGUCCGCUAUGUGGAUCUCAUGGAGUCUUCCAUCGCCCAGUCAAUUCACAGAGGUUUUGAGCAGGAGACAUGGCAGCCUGUCAAGAAUAUCGCCAACAGUCUUCCCAAUGUAGCUCUUCCAAAAGUUCCAAGUCUGCCUCUUAAUCUUCCACAGAUUCCUAACAUUUCUACUGCUUCGUGGAUGCCUUCUUUAUAUGAGUCCACCAAUGGCUCAGCAACAUCAGAAGACCUUUUUUGGAAGCUUGAUGCACUGCAAAUGUUUGUCUUUGAUCUGCACUGGCCAGAACAGGAAUUUGCCCACCACUUAGAGCAAAGACUUAAACUAAUGGCCAGUGAUAUGCUAGAGGCCUGUGUCAAAAGAACAAGAACUGCAUUUGAACUCAAGCUACAAAAGGCAAGCAAAACAACUGACUUGCGCAUUCCAGCUUCCGUUUGCACUAUGUUUAAUGUAUUAGUCGAUGCCAAAAAGCAAAGCACCAAACUCUGUGCCCUGGAUGGAGGACAAGAGCAACAGUACCAUUCAAAAAUAGAUGAUCUGAUCGACAACAGUGUAAAAGAAAUCAUUUCACUGUUAGUUUCAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-370.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -397.92
Frequency: 0.0000
Diversity: 427.67
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..(((((.......)))))..)(((((.....((((.((((((((((..((((...))))..)))((((...))))..(((((......))))).((((........))))....(((((((..(((((((....(((...(((((((..(((((((....((((((......).)))))))))..))).)))))))...)))...(..((.((((((((..((((.((((((((((.((....(((((...))))))))))....(((((.(((.................))))))))..((((((..(((....)))..))))))(((((((((((((((((((....))))...))))))))....(((.............))).....((.(((((...((((..((.....(((.((.(..((((((.((.((........................(((.........)))..(((((....(((((.((((.(((((((.(((((.(((((.(((....))).)).))).......((((.(((((((((((((((.((.(((((.((......)))))).).))))))))).)).)))))).))))))))).)))).)))(((......))).......(((((((((.....(((((........))))).....)))))))))....((((((........)))))).)))))))))..))))).....(((((....)))))........((((((.(((.....))).))))))..(((((..(((((((((((....(((((((...((...(((((.(((...)))...))))).)).)))))))...)))))))))))..))))).)))).)))))).).)).)))...))))))....)))))))..))))))).............)))))))...))))..)))))))).))..)........(((((......)))))...(((((.....((((.(((....)))))))........))))).........(((((((.(((((...((((.(((((((((((......(((((((((....(((..(((((.(........).)))))..))).......)))))))))....(((.(((..(.((((....((........))))))..)..))).)))....)))))))))))...........)))))))))..)))))))...((((.((....)).))))...)))))))...........)))))))..((((((.(((.....)).).)).))))..)))))))))))........(((......)))((((((((((.(((........)))))))))).))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..(((((.......)))))..)(((((.,,,.((((.((((((((({.,((,({{{||||{{|||{{{{.,,}}}}..(((((......))))).((((........))))....((({(((({{{{,{{{....{{{.,.{|{||{{,,({{,,{,..,|||{|||,,,,..|,||}}|||,.,}})),}||||||,{{|||,.,{{.{{.((((((((..((((.(((((((.(({{....{(((((...}))))),.}||||,({,,,.{{{....{{,..{{{{{...,,|||,||{.,,,|||.,|||}}}}))},,)))}}}{((((({(((((({{{,{|}},,)}}}..,}}}}}}}|.,,,{(({{{{....,{{{..,......||}|{{|{.,}||||..,,..,||||{.((,{.,((((((,((.{{............,,,.,,......(((,,......,|||,.{{{{{....(({{,.{{{{.{{,{{,({((((({,{{{({(((((,..,,.||{{||..,}}}.|{||}|||||{{((((((((.((.{((((.((......)))))).}.)))))))))),}.}}))))})))))))),.}}},})))|{,....,,}}),,.....(((((((((.....(((((........))))).....)))))))))....,{{{,{..||||,,|}}}}},}})}}}}}}..|||||,,,..{{{{(,,,.|||,|,(({{{,...,)))}.{({{{,.||||||,,....{{(((,,({{{{{|||||,...,{{{,,({((((...))))}}.,|,||||},.,))))).,,.,,)))),,,,}}})))))))),,))))),}}}}.||}}}}.},)).})}.,.))}))).,,,)))))})..})))))).}},......,,,)))))))...))))..)))))))).))..,........(((((......))))).,.(((((.....((((.(({....}))))))........))))).....,,,(({{(((({(({({...{(({,((({{(((((((.{,,.(((((((((....(((..(((((.(........).)))))..))).......))))))))),{{.(((.,,|}}.,||||},..}},.}}}}...,))))}})..}))})))}.}}))))|||{(||.......}}.})))))))})},))}))))},,||||},,,{{,|..}|||,,.}},))))}....,,))}.,))))))..|(((((.(((.....)).).)),,))),.))))))))))}........|||.,,,,.}}}((((((((((.(((.,....,.)))))))))).))).)))))
Back