Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CADPS2_0007200
Sequence Length
760 nt
GC Content
0.4408
GGAUGGUUUAGCCCUGGCCAAGUCUUUGUGUUAGAUGAGUACUGUGCCCGUUAUGGUGUGAGAGGCUGUCACAGACAUCUCUGCUACCUUGCAGAACUGAUGGAACAUUCAGAAAAUGGUGCUGUCAUUGACCCUACCCUGCUCCAUUACAGCUUUGCAUUCUGUGCCUCUCAUGUGCACGGCAACAGGCCUGAUGGAAUUGGGACUGUUUCAGUGGAAGAAAAAGAAAGAUUUGAGGAGAUAAAAGAGAGACUCUCUUCCCUUUUAGAAAAUCAGAUAAGCCAUUUCAGAUACUGUUUUCCCUUUGGACGACCUGAAGGUGCUCUAAAAGCUACACUUUCAUUACUUGAAAGGGUUUUAAUGAAAGAUAUUGCCACUCCCAUACCAGCAGAAGAGGUGAAGAAAGUGGUCAGAAAAUGUCUCGAGAAAGCUGCCUUGAUCAAUUACACUAGACUCACAGAAUAUGCCAAAAUAGAAGGCCCAGCAGAAAAGGAAACAGAGACCAUGAACCAGGCAUCUCCUGCUAGAAAGCUGGAAGAGAUUCUUCAUCUGGCAGAGCUCUGCAUAGAAGUCUUACAGCAGAAUGAAGAGCAUCAUGCAGAGGCAUUUGCCUGGUGGCCUGAUUUAUUGGCUGAACAUGCAGAGAAAUUUUGGGCUUUAUUUACAGUGGAUAUGGACACUGCACUAGAGGCUCAACCGCAAGACUCCUGGGAUAGUUUUCCUCUUUUCCAACUGCUUAAUAAUUUCCUCCGAAAUGACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-201.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -216.78
Frequency: 0.0000
Diversity: 176.42
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.((((((((((((((((((((((..........(((((...(((.((((((((((((((((..((..((..(((((......)))))..)).))..)))....((((((((((((((((((((.....(((...(((((((..(((((((....((((((......).)))))))))..))).)))))))...)))......))))))).............((((((.....((((((.(((......))).)))))).....)))))).........))).))))))))))(((((((.....))))))).(((.....)))....((((((.....))))))((((((..(((..((((((((((((..(.((((.........))))..)..)))))).....)))))))))..)))))))))))......))))))))))).))))).....(((((......(((((..........((.........))....((((((((....((((((((.....((((....))))...))))))))..((((((((.((.(((((.((......)))))).).)))))))))).....)))))))))))))......))))).....)))))))))...)))))..........(((((........)))))..)))).)))).)))))......)))(((((......)))....................(((((....)))))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,({,(((((((({.((((..((((((((.........,,.(((((...(((.((((((((((((({(({.,,|}||..(((((......))))).,{{{,,...,..})}|{((((((({(({{((((((..,..(((...(((((((..((((((,...(((((((......).)))))),}.,)))).)))))))...)))...}..))))))}..,..........((((((.....((((((,(((...,}}))}.)))))).....))))))..,,,.}}})}}.}})))}}}}}{{(((((,..,,|}}}})),{{|,,,,.}}}....((((((.....))))))|{((({..{{,.{((((((((((((..,.((((.........))))..}..)))))).....)))))))}}..)})))})))))......))))))))))).)))))..,..(((.........))){{.........}}..)))))))).....((((((((.,,.((((((((.....{(((,,..,))),}.)))))))),|((((((((.((.{((((.((......)))))).}.)))))))))).,...)))))))))))).,.......))))))))}}.).,.,..((((((((..((({{..(((((((...(({.{(((..((((,{||||........},}),))))..))))..))).....))),,))).,.})))}.....})))))))..,.
Back