Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CADPS2_0009500
Sequence Length
615 nt
GC Content
0.4276
AUGCAGAUCGUUUUCAGAAACAUGGUAUGGAUGAGUUUAUUUCUGCAAACCCCUGCAAGCUUGAUCAUGCCUUCCUUUUUAGAAUACUCCAGAGGCAGACUUUGGAUCACAGACUGAAUGAUUCCUAUUCUUGCUUGGGAUGGUUUAGCCCUGGCCAAGUCUUUGUGUUAGAUGAGUACUGUGCCCGUUAUGGUGUGAGAGGCUGUCACAGACAUCUCUGCUACCUUGCAGAACUGAUGGAACAUUCAGAAAAUGGUGCUGUCAUUGACCCUACCCUGCUCCAUUACAGCUUUGCAUUCUGUGCCUCUCAUGUGCACGGCAACAGGCCUGAUGGAAUUGGGACUGUUUCAGUGGAAGAAAAAGAAAGAUUUGAGGAGAUAAAAGAGAGACUCUCUUCCCUUUUAGAAAAUCAGAUAAGCCAUUUCAGAUACUGUUUUCCCUUUGGACGACCUGAAGGUGCUCUAAAAGCUACACUUUCAUUACUUGAAAGGGUUUUAAUGAAAGAUAUUGCCACUCCCAUACCAGCAGAAGAGGUGAAGAAAGUGGUCAGAAAAUGUCUCGAGAAAGCUGCCUUGAUCAAUUACACUAGACUCACAGAAUAUGCCAAAAUAGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-153.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -165.17
Frequency: 0.0000
Diversity: 216.59
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.....)))((((.......(((((((..((((((((....((((......))))...(((((((.(((((.((((((.......(((((((.....))))))).......((((((.(((((...........))))).))))))((((((...((((((...(((..((.((..((((..(((((((...(((((((((((((...))))..(((((......))))).((((........))))..(((((.((..................)).)))))((((.........)))))))))))))))).))))..))))..)).))..))).))))))...)))).))...)))))).)))((((((.....((((((.(((......))).)))))).....)))))).(((..((((((((...(((((((((((((.....))))))).(((.....)))....((((((((((((....))))...)))))))).....((((((..(.((((.........))))..)..))))))..)))))))))).))))..)))))..)))))))......)))))))).....))))))).....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.....)))((((.......(((((((..((((((((....((((......))))...{(((((({{{{{{{((({{{.....,,(((((((,,,,,||||||,,{,..(.((((((.(((((,,........,))))).))))))}.,|||||}|||||,,}|,}}..,,}||},(((({,{,({,.{{{{((((((((({{{{,{{||||..(((((......))))).{{{{,,...,..}}}|,.{{{({{(({{{{{{,{{.....{{{.}.{||||||,,{{,,,{,..,|||||||}}}}},).)}))))},}}))}}|)}})}}}.,.})),.,,..}|||||,..|,,,..,....((((((.....((((((,(((...,}}))}.)))))).....))))))..,|..||||||.}}}}|||,||{{(((((|..|||}}}}))}{{|,,,,,}}}....((((((,,.,,}}}}))}}|,,|,,}}},||{{,,,|||{{|,.|,|{||,.,..,,,,))}),,)..})))))}}}..}}}}}}|||||,,,},,},}}))),}},......)))))))).....))))))).....))))
Back