Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CADPS2_0016800
Sequence Length
796 nt
GC Content
0.4234
GUUUUUCUAAAGAGUGACCGAGUGGCCAGAAUGGUACAGAGUGGAGGGUGUUCUGCUAAUGACUUCAGAGAAGUAUUUAAGAAAAACAUAGAAAAACGUGUGCGGAGUUUGCCAGAAAUAGAUGGCUUGAGCAAAGAGACAGUGUUGAGCUCAUGGAUAGCCAAAUAUGAUGCCAUUUACAGAGGUGAAGAGGACUUGUGCAAACAGCCAAAUAGAAUGGCCCUAAGUGCAGUGUCUGAACUUAUUCUGAGCAAGGAACAACUCUAUGAAAUGUUUCAGCAGAUUCUGGGUAUUAAAAAACUGGAACACCAGCUCCUUUAUAAUGCAUGUCAGAAAAUUCCCCAAAUUUAUAGCAAAAGAUAUGGAGAAUAUGUAUAUAGAAGAGUUGCGGUCUUCAGUGAAUUUGCUAAUGGCCAAUUUGGAAAGUCUUCCAGUUUCGAAAGGUGGUCCGGAAUUUAAAUUACAAAAAUUAAAACGUUCACAGAACUCUGCAUUUUUGGACAUAGGAGAUGAGAAUGAGAUUCAGCUGUCAAAGUCCGACGUGGUACUGUCAUUCACCUUAGAGAUUGUCAUAAUGGAAGUGCAAGGCCUGAAGUCAGUUGCUCCCAAUCGAAUUGUUUACUGUACAAUGGAAGUGGAAGGAGAAAAACUUCAGACAGACCAGGCCGAAGCCUCAAGGCCACAAUGGGGGACUCAAGGAGAUUUCACCACCACCCAUCCUCGGCCUGUGGUCAAAGUGAAACUCUUCACAGAAAGCACUGGAGUUCUGGCCCUGGAAGAUAAAGAACUGGGAAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-200.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -216.22
Frequency: 0.0000
Diversity: 243.69
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((...........(((((((((((....((.(((..((((((..((((((((((((((.((((((.(.(((((((.......((((........))))....(((((((((..(((..((((((((((.((.(.....).))..))))).....)))))..)))....((.(((((....)))))..))..))).)))))).((((.......))))..)))))))..).)))))).)))))...)))..)))))).))))))....))).))(((((((((.............((((((((..((((((.((((((.(((((((........((.(((.((((........)))).))).))))))))))))))).))))))..)).)))))))))))))))..))))).))))))...(((((((((((((..((((((((((((((....((((.....)))).....((((...)))).......))))))))...(((..(((.(.(((...)))..).)))...)))((((......))))...)))))).))))..((((.(((...(((((.....(((((((...((.((.(((.....(((((.......))))).....))).)).))....)))))))...(((((((((((.(((....)))....(((((((...................)).)))))..))))))..)))))...(((((....))))).....)))))...))).)))).))))))))).))))))(......)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((({..........(((((((((((,,,{{{.(((..((((((..((((((((((({{(,((({{{,|,||{{|{{.,....,{{{........,)))|,,,,((((((((....{{..||||,(((((.,,.,.....,.))..))))),{...,,))}..|||,.,||||(({{{..,{|||||..||{||||{||},}}.((((.......))))..}}})))),,,.)))}}}.}}})).,.}}}..||||||.}}}}}}....))),))(((((((((.............((((((((..((((((.(((((,,(((((({.......,((.(((.((((........)))).))).))))))))))))))).))))))..)).)))))))))))))))..}))))|,))))),,,{({{{{(((||{{..||{{|||{||{{{{{{{.,.,,.....},}},,...||||.,|}}}}.}|||||||||||||...{{{,.{{{{{,({{...}}}.,},||...,}}}||||,.,...}})),}})))))).}}}},|}}|||,.}}}.,))})}.{{{({((({(,,,((,((.(((.....(((((.......))))).....))).}|,}|....}))))}}.,.(((((((((((.(((....)))....(((((((......,|,....,,.,..)).)))))..))))))}.,))))...(((({....)))))....,)))))},}})))}))))))))}}}}}.,}))))(......)
Back