Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CAMLG_0001000
Sequence Length
2307 nt
GC Content
0.4551
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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1237.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1265.94
Frequency: 0.0000
Diversity: 244.12
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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