Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_CCNB1_0001400

Sequence Length

648 nt

GC Content

0.4244

GAAGAGCAAGCAGUCAGACCAAAAUACCUACUGGGUCGGGAAGUCACUGGAAACAUGAGAGCCAUCCUAAUUGACUGGCUAGUACAGGUUCAAAUGAAAUUCAGGUUGUUGCAGGAGACCAUGUACAUGACUGUCUCCAUUAUUGAUCGGUUCAUGCAGAAUAAUUGUGUGCCCAAGAAGAUGCUGCAGCUGGUUGGUGUCACUGCCAUGUUUAUUGCAAGCAAAUAUGAAGAAAUGUACCCUCCAGAAAUUGGUGACUUUGCUUUUGUGACUGACAACACUUAUACUAAGCACCAAAUCAGACAGAUGGAAAUGAAGAUUCUAAGAGCUUUAAACUUUGGUCUGGGUCGGCCUCUACCUUUGCACUUCCUUCGGAGAGCAUCUAAGAUUGGAGAGGUUGAUGUCGAGCAACAUACUUUGGCCAAAUACCUGAUGGAACUAACUAUGUUGGACUAUGACAUGGUGCACUUUCCUCCUUCUCAAAUUGCAGCAGGAGCUUUUUGCUUAGCACUGAAAAUUCUGGAUAAUGGUGAAUGGACACCAACUCUACAACAUUACCUGUCAUAUACUGAAGAAUCUCUUCUUCCAGUUAUGCAGCACCUGGCUAAGAAUGUAGUCAUGGUAAAUCAAGGACUUACAAAGCACAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-158.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -170.26

Frequency: 0.0000

Diversity: 204.64

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((.(((((((((..............((((..((....(((.((....)))))...))..)))).)))))).))).))..((((((........(((((..(((.(((((......((((((((((((((.........)).))).)))))((((((....((((...(((((((.((((((((((((..((((.((((..(((((((.........))))))).))...))))))..))))...((((((.(((.(..(..(((........)))..)..).)))))))))(((((.(((((.(((.(((((.(((...))))))))...))).))))).((((((((((.((..(((.((((....)))).))).........))))))))))))((((((........)))))).......)))))((((...(((((((((.....))))))))).....))))...........))))))))....)))))))....)))).....)))))).....(((((......)))))....))))......))))).)))..)))))))))))..)))))((....(((...(((((((((......)))))).))).......(......)...)))..))

Thermodynamic Ensemble Prediction

,,.,,((.,{((((((({{{...........,,}}}}{(,...(({.((....))}}}.,,||,,}},...}))}))))).||.,{,{||{...,|....,((((,{(({(({((((({|,|||...}}}},)))))).....{{{{.(({.{{({((({{{..{|{|{{|,.|{{{{{{.{({(({{{{{(({{(((({(,.{{{(((((((..{{,,{|{|||}}}}..|,,,||||||..}}}|...((((((.(((.{..{..(((........)))..}..}.))))))))),{{{{.(((((.(((.(((((.(((...))))))))...))).))))).((((((((((.((..(((.((((....)))).))).........))))))))))))(((((({{{{{,,.}|||||{,.....,,,,)||,,,.,|{|||||||..,..)))))))))}},.,)))|{{{,.,,,....}),))})}}}}}},))))},,.)))}.,,..,})))),},.,|||||....}})))))}},...,,.,,,.,}}|)}||,,.(((((((({....}))))}}))).,)))))}}|||||{{.....{{|||||.{||,...,}}..)))},})}..}}.,.)}