Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CCNB1_0001800
Sequence Length
1209 nt
GC Content
0.3714
AAUAAUUGUGUGCCCAAGAAGAUGCUGCAGCUGGUUGGUGUCACUGCCAUGUUUAUUGCAAGCAAAUAUGAAGAAAUGUACCCUCCAGAAAUUGGUGACUUUGCUUUUGUGACUGACAACACUUAUACUAAGCACCAAAUCAGACAGAUGGAAAUGAAGAUUCUAAGAGCUUUAAACUUUGGUCUGGGUCGGCCUCUACCUUUGCACUUCCUUCGGAGAGCAUCUAAGAUUGGAGAGGUUGAUGUCGAGCAACAUACUUUGGCCAAAUACCUGAUGGAACUAACUAUGUUGGACUAUGACAUGGUGCACUUUCCUCCUUCUCAAAUUGCAGCAGGAGCUUUUUGCUUAGCACUGAAAAUUCUGGAUAAUGGUGAAUGGACACCAACUCUACAACAUUACCUGUCAUAUACUGAAGAAUCUCUUCUUCCAGUUAUGCAGCACCUGGCUAAGAAUGUAGUCAUGGUAAAUCAAGGACUUACAAAGCACAUGACUGUCAAGAACAAGUAUGCCACAUCGAAGCAUGCUAAGAUCAGCACUCUACCACAGCUGAAUUCUGCACUAGUUCAAGAUUUAGCCAAGGCUGUGGCAAAGGUGUAACUUGUAAACUUGAGUUGGAGUACUAUAUUUACAAAUAAAAUUGGCACCAUGUGCCAUCUGUACAUAUUACUGUUGCAUUUACUUUUAAUAAAGCUUGUGGCCCCUUUUACUUUUUUAUAGCUUAACUAAUUUGAAUGUGGUUACUUCCUACUGUAGGGUAGCGGAAAAGUUGUCUUAAAAGGUAUGGUGGGGAUAUUUUUAAAAACUCCUUUUGGUUUACCUGGGGAUCCAAUUGAUGUAUAUGUUUAUAUACUGGGUUCUUGUUUUAUAUACCUGGCUUUUACUUUAUUAAUAUGAGUUACUGAAGGUGAUGGAGGUAUUUGAAAAUUUUACUUCCAUAGGACAUACUGCAUGUAAGCCAAGUCAUGGAGAAUCUGCUGCAUAGCUCUAUUUUAAAGUAAAAGUCUACCACCGAAUCCCUAGUCCCCCUGUUUUCUGUUUCUUCUUGUGAUUGCUGCCAUAAUUCUAAGUUAUUUACUUUUACCACUAUUUAAGUUAUCAACUUUAGCUAGUAUCUUCAAACUUUCACUUUGAAAAAUGAGAAUUUUAUAUUCUAAGCCAGUUUUCAUUUUGGUUUUGUGUUUUGGUUAAUAAAACAAUACUCAAAUACAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-288.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -313.94
Frequency: 0.0000
Diversity: 378.11
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((....(((.......(((((((((..((((((((((((..(((.......((((.(((.(((((((.((((((((.((((.(((((((.((((((.(((.(..(..(((........)))..)..).)))))))))(((((.(((((.(((.(((((.(((...))))))))...))).))))).((((((((((.((..(((.((((....)))).))).........))))))))))))((((((........)))))).......)))))((((...(((((((((.....))))))))).....))))......(((...((((((((((...)))))))..))).)))...)))))))....)))).((((((.((((((((((((...((((((((....(((((((((....))))).))))...(((((.(.(((((((...((((((((((((..................)).)))))))).)).((((.(((((((.........))))))).((((((((...........)))))..)))......)))).....))))))).)))))))))..)))))....))))).....))))))).)).))))...............((((((...))))))..((((((......)).))))....(((((((...(((((((((((.(.((((..((.(((.....)))..))..)))).).))))))((((((((....))))).))).)))))...)))))))..((((.(((((.........(((((......)))))..((((((((.(.......((((((....)))))).((((.............))))(((((((((((((..((((.((((((.((..(((.(((((((((...........)))))))))........((.((((..........)))).)).....))).)))))))))))).))))))))))))).......).))))))))))))))))).....)))))))).)))..))))))).))))....((((.....)))).............)))))))))))..))))))))))))).......))).....((((((((((((..............)))))))))))).)))((((((((.(((............))).))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({...,({(.......(((((((((,.{(((((((((((.,,,{{{,{,{,((({.(({{(((({({.(((((((({,,,,.{{(((({.((((((.((,.(,.,..(((........)))..,..,.}}||||||,.{{{{.(((((.(((.(((((.(((...))))))))...))).))))).((((((((((.((..(((.((((....)))).))).........))))))))))))(((({{{{{{{{{.,|||||{{.........)}}..,,,|,||||||}..,..))))}))))}}...,}}(((((.(({,...|}.)).))))}...,,,)),,,))),}}}...}))))))...||||{.,{{|||,|||||{{{{{{{...{{{((({({{{.(((((((((....)))))}})))}))||||{.(,(((((((,..{{((((((((((,,.,,...,..,,.,...,,.)))))))).},.{{{{.(((((((.........))))))).{({(((((...........)))))..}}}......))))..,.,))))))).)))))}})}|.|)))},,.,||}}}.....}|||}||{|{{||{{{{||||,........((((((...))))))..|{{{{{......))}}})},,,,{{{{.{,,,,{(({{((({{{,{...{{{,{{,{.{{|||||,{,,|,,.,}}},})))))}}{{|{{{||..,,}||||,|}}.||}}}},...}}}}}|}|,{{.||||{.........,{{({,,....}}}}|..{(((((((,{......,((((({...,)))))),|({{,............}}}}(((((((((((((..((((.((((((.{{.,{||,(((((((((...........))))))))).,......{{.{{{|,,.,,,....}}}).))..,.,})).)))))))))))).)))))))))))))...,,..}.}))))}))}))}})}}}..,,}}))))))).)}}..))))))),}}},....||||,....)))}...,,,,.....,|}|}}}})))).,)))))))))))))....,,{||,..,}}||{{{{(((((,....,,,,}.,,,,}}}}}}}))))}|)))((((((((,({{........,,..))},))))))))
Back