Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CD44_0002800
Sequence Length
1588 nt
GC Content
0.4754
CUAUUGUUAACCGUGAUGGCACCCGCUAUGUCCAGAAAGGAGAAUACAGAACGAAUCCUGAAGACAUCUACCCCAGCAACCCUACUGAUGAUGACGUGAGCAGCGGCUCCUCCAGUGAAAGGAGCAGCACUUCAGGAGGUUACAUCUUUUACACCUUUUCUACUGUACACCCCAUCCCAGACGAAGACAGUCCCUGGAUCACCGACAGCACAGACAGAAUCCCUGCUACCACUUUGAUGAGCACUAGUGCUACAGCAACUGAGACAGCAACCAAGAGGCAAGAAACCUGGGAUUGGUUUUCAUGGUUGUUUCUACCAUCAGAGUCAAAGAAUCAUCUUCACACAACAACACAAAUGGCUGGUACGUCUUCAAAUACCAUCUCAGCAGGCUGGGAGCCAAAUGAAGAAAAUGAAGAUGAAAGAGACAGACACCUCAGUUUUUCUGGAUCAGGCAUUGAUGAUGAUGAAGAUUUUAUCUCCAGCACCAUUUCAACCACACCACGGGCUUUUGACCACACAAAACAGAACCAGGACUGGACCCAGUGGAACCCAAGCCAUUCAAAUCCGGAAGUGCUACUUCAGACAACCACAAGGAUGACUGAUGUAGACAGAAAUGGCACCACUGCUUAUGAAGGAAACUGGAACCCAGAAGCACACCCUCCCCUCAUUCACCAUGAGCAUCAUGAGGAAGAAGAGACCCCACAUUCUACAAGCACAAUCCAGGCAACUCCUAGUAGUACAACGGAAGAAACAGCUACCCAGAAGGAACAGUGGUUUGGCAACAGAUGGCAUGAGGGAUAUCGCCAAACACCCAAAGAAGACUCCCAUUCGACAACAGGGACAGCUGCAGCCUCAGCUCAUACCAGCCAUCCAAUGCAAGGAAGGACAACACCAAGCCCAGAGGACAGUUCCUGGACUGAUUUCUUCAACCCAAUCUCACACCCCAUGGGACGAGGUCAUCAAGCAGGAAGAAGGAUGGAUAUGGACUCCAGUCAUAGUAUAACGCUUCAGCCUACUGCAAAUCCAAACACAGGUUUGGUGGAAGAUUUGGACAGGACAGGACCUCUUUCAAUGACAACGCAGCAGAGUAAUUCUCAGAGCUUCUCUACAUCACAUGAAGGCUUGGAAGAAGAUAAAGACCAUCCAACAACUUCUACUCUGACAUCAAGCAAUAGGAAUGAUGUCACAGGUGGAAGAAGAGACCCAAAUCAUUCUGAAGGCUCAACUACUUUACUGGAAGGUUAUACCUCUCAUUACCCACACACGAAGGAAAGCAGGACCUUCAUCCCAGUGACCUCAGCUAAGACUGGGUCCUUUGGAGUUACUGCAGUUACUGUUGGAGAUUCCAACUCUAAUGUCAAUCGUUCCUUAUCAGGAGACCAAGACACAUUCCACCCCAGUGGGGGGUCCCAUACCACUCAUGGAUCUGAAUCAGAUGGACACUCACAUGGGAGUCAAGAAGGUGGAGCAAACACAACCUCUGGUCCUAUAAGGACACCCCAAAUUCCAGAAUGGCUGAUCAUCUUGGCAUCCCUCUUGGCCUUGGCUUUGAUUCUUGCAGUUUGCAUUGCAGUCAACAGUCGAAGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-405.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -436.05
Frequency: 0.0000
Diversity: 383.46
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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